Панкреатическая рибонуклеаза

Рибонуклеазы поджелудочной железы (Шифр КФ 3.1.27.5, РНКаза, РНКаза I, РНКаза А, РНКаза поджелудочной железы, рибонуклеаза I, эндорибонуклеаза I, рибонуклеиновая фосфатаза, щелочная рибонуклеаза, рибонуклеаза, гликопротеины гена S, щелочная рибонуклеаза Ceratitis capitata, гликопротеины SLSG, S-генотип-ассоц. гликопротеины, рибонуклеат 3'-пиримидино-олигонуклеотидогидролаза) — это пиримидин-специфичные эндонуклеазы, обнаруживаемые в большом количестве в поджелудочной железе некоторых млекопитающих и некоторых рептилий[1].

Панкреатическая рибонуклеаза

Структура РНКазы А
Идентификаторы
Шифр КФ 3.1.27.5
Номер CAS 9001-99-4
Базы ферментов
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA entry
ExPASy NiceZyme view
MetaCyc metabolic pathway
KEGG KEGG entry
PRIAM profile
PDB structures RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Gene Ontology AmiGO • EGO
Поиск
PMC статьи
PubMed статьи
NCBI NCBI proteins
CAS 9001-99-4
Панкреатическая рибонуклеаза
Идентификаторы
Символ RNaseA
Pfam PF00074
SMART SM00092
PROSITE PDOC00118
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель

В частности, ферменты участвуют в эндонуклеолитического расщепления 3'-фосфомононуклеотидов и 3'-фосфолигонуклеотидов, оканчивающиеся на C-P или U-P с 2',3'-циклическими фосфатными промежуточными соединениями. Рибонуклеаза может раскручивать спираль РНК, образуя комплекс с одноцепочечной РНК; комплекс возникает в результате расширенного многосайтового катион-анионного взаимодействия между остатками лизина и аргинина фермента и фосфатными группами нуклеотидов.

Известные члены семьи

Рибонуклеаза поджелудочной железы крупного рогатого скота является наиболее изученным представителем семейства и служит модельной системой в работе, связанной с фолдингом белков, образованием дисульфидных связей, кристаллографией и спектроскопией белков, а также динамикой белков[2]. Геном человека содержит 8 генов, которые имеют общую структуру и функцию с рибонуклеазой поджелудочной железы крупного рогатого скота, с 5 дополнительными псевдогенами. Структура и динамика этих ферментов связаны с разнообразием их биологический функций[3].

Другие белки, принадлежащие к суперсемейству панкреатических рибонуклеаз, включают: рибонуклеазы семенных пузырьков крупного рогатого скота и мозга; несекреторные рибонуклеазы почек[4]; рибонуклеазы печеночного типа[5]; ангиогенин, который вызывает васкуляризацию нормальных и злокачественных тканей; эозинофильный катионный белок[6], цитотоксин и гельминтотоксин с рибонуклеазной активностью; и рибонуклеаза печени лягушки и лектин, связывающий сиаловую кислоту. Последовательность рибонуклеаз поджелудочной железы содержит четыре консервативных дисульфидных связи и три аминокислотных остатка, участвующих в каталитической активности[7].

Гены человека

Гены человека, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают:

  • ANG ,
  • RNASE1, RNASE10, RNASE12, RNASE2, RNASE3, RNASE4, RNASE6, RNASE7 и RNASE8.

Цитотоксичность

Некоторые представители семейства рибонуклеаз поджелудочной железы обладают цитотоксическим действием. Клетки млекопитающих защищены от этих эффектов благодаря их чрезвычайно высокому сродству к ингибитору рибонуклеазы (RI), который защищает клеточную РНК от разрушения рибонуклеазами поджелудочной железы[8]. Рибонуклеазы поджелудочной железы, которые не ингибируются RI, примерно так же токсичны, как альфа-сарцин, дифтерийный токсин или рицин[9].

Две панкреатические рибонуклеазы, выделенные из ооцитов северной леопардовой лягушки — амфиназа и ранпирназа — не ингибируются RI и проявляют дифференциальную цитотоксичность в отношении опухолевых клеток[10]. Ранпирназа изучалась в 3 фазе клинических испытаний как кандидат на лечение мезотелиомы, но испытание не продемонстрировало статистической значимости в отношении основных конечных точек[11].

Примечания

 

  1. “Comparison of the structure of turtle pancreatic ribonuclease with those of mammalian ribonucleases”. FEBS Lett. 194 (2): 338—343. 1986. DOI:10.1016/0014-5793(86)80113-2. PMID 3940901.
  2. “Back to the future: ribonuclease A”. Biopolymers. 90 (3): 259—77. 2008. DOI:10.1002/bip.20845. PMID 17868092.
  3. “Conservation of Dynamics Associated with Biological Function in an Enzyme Superfamily”. Structure. 26 (3): 426—436. Mar 2018. DOI:10.1016/j.str.2018.01.015. PMID 29478822.
  4. “Molecular cloning of the human eosinophil-derived neurotoxin: a member of the ribonuclease gene family”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86 (12): 4460—4464. 1989. DOI:10.1073/pnas.86.12.4460. PMID 2734298.
  5. “Primary structure of a ribonuclease from porcine liver, a new member of the ribonuclease superfamily”. Biochemistry. 28 (25): 9806—9813. 1989. DOI:10.1021/bi00451a040. PMID 2611266.
  6. “Human eosinophil cationic protein. Molecular cloning of a cytotoxin and helminthotoxin with ribonuclease activity”. J. Exp. Med. 170 (1): 163—176. 1989. DOI:10.1084/jem.170.1.163. PMID 2473157.
  7. “Ribonuclease A”. Chem. Rev. 98 (3): 1045—1066. 1998. DOI:10.1021/cr960427h. PMID 11848924.
  8. Gaur, D (6 July 2001). “Interaction of human pancreatic ribonuclease with human ribonuclease inhibitor. Generation of inhibitor-resistant cytotoxic variants”. The Journal of Biological Chemistry. 276 (27): 24978—84. DOI:10.1074/jbc.m102440200. PMID 11342552.
  9. Saxena, SK (5 November 1991). “Comparison of RNases and toxins upon injection into Xenopus oocytes”. The Journal of Biological Chemistry. 266 (31): 21208—14. PMID 1939163.
  10. “Ribonucleases as novel chemotherapeutics : the ranpirnase example”. BioDrugs. 22 (1): 53—58. 2008. DOI:10.2165/00063030-200822010-00006. PMID 18215091.
  11. Alfacell Annual Report 2009. Дата обращения: 2 февраля 2015.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.