Транслоказы
Транслоказы — отдельный класс ферментов, катализирующих перенос ионов или молекул через мембраны или их разделение в мембранах. Этот класс ферментов сформировался из ранее принадлежащих другим классам ферментов.[1]
АТФ-синтаза — ранее фермент относился к третьему классу и был назван по номенклатуре — АТФ-фосфогидролаза, но название не соответствует характеру работы фермента, так как гидролиз АТФ практически не происходит.
За ферментами, перемещёнными в класс транслоказ, сохранились прежние систематические названия.
Катализируемые реакции
Ферменты 7-го класса катализируют реакции переноса молекул или ионов через мембраны, сопряженного с другими реакциями.
Например, при переносе протонов из матрикса митохондрии в межмембранное пространство через комплекс I электрон-транспортной цепи (7.1.1.2) происходит восстановление убихинона до убихинола, и реакция описывается следующей схемой[2]:
- NADH + CoQ + 6 H+[side 1] = NAD+ + CoQH2 + 7 H+[side 2]
Второй пример — АТФ-синтаза, катализирующая реакцию переноса протонов из межмембранного пространства митохондрии в матрикс с образованием при этом молекулы АТФ из АДФ и неорганического фосфата, реакция описывается схемой[3]:
- АДФ + Фн + 4 H+[side 1] → АТФ + H2O + 4 H+[side 2]
Номенклатура
За ферментами сохранились систематические названия, указывающие на их прежний класс.
В зависимости от переносимых ионов или молекул в седьмом классе выделяют шесть подклассов.
EC 7.1 — ферменты, катализирующие транслокацию протонов водорода H+;
EC 7.2 — ферменты, катализирующие транслокацию неорганических катионов и их хелатов;
ЕС 7.3 — ферменты, катализирующие транслокацию неорганических анионов;
EC 7.4 — ферменты, катализирующие транслокацию аминокислот и пептидов;
EC 7.5 — ферменты, катализирующие транслокацию углеводов и их производных;
EC 7.6 — ферменты, катализирующие транслокацию иных соединений.
Деление на под-подклассы основано на реакциях, которые обеспечивают движущую силу для транслокации:
EC 7._.1 — ферменты, катализирующие реакции транслокации, связанные с реакциями окисления-восстановления;
EC 7._.2 — ферменты, катализирующие реакции транслокации, связанные с гидролизом нуклеозидтрифосфата;
EC 7._.3 — ферменты, катализирующие реакции транслокации, связанные с гидролизом дифосфата;
EC 7._.4 — ферменты, катализирующие реакции транслокации, связанные с реакцией декарбоксилирования.
К ферментам этого класса не относятся каналы (поры), изменяющие конформацию между открытым и закрытым состоянием в ответ на какое либо воздействие, а так же транспортеры, которые не зависят от фермент-катализируемых реакций.
См. также
Примечания
- Международный союз биохимии и молекулярной биологии. Новый класс ферментов: транслоказы. . IUBMB NEWS (Август 2018).
- НАДН:убихинон редуктаза . IUBMB Enzyme Nomenclature.
- АТФ-синтаза . IUBMB Enzyme Nomenclature.