Бета-штамм SARS-CoV-2

Бета-штамм коронавируса SARS-CoV-2[1], также известный как линия 501.V2, 20C/501Y.V2 или B.1.351[2] (в прессе также встречаются названия «африканский штамм»[3] или «южноафриканский штамм»[4]) — штамм вируса SARS-CoV-2, вызывающего COVID-19. Впервые этот штамм был обнаружен в округе Бухта Нельсона Манделы[5] Восточно-Капской провинции ЮАР[6], о чём сообщило министерство здравоохранения ЮАР 18 декабря 2020 года[7].

Страны с подтвержденными случаями заражения штаммом 501.V2 по состоянию на 29 декабря 2020 года

Штамм

Исследователи и официальные лица сообщили, что распространенность этого штамма была выше среди молодых людей без каких-либо сопутствующих заболеваний, и, по сравнению с другими штаммами, в таких случаях он чаще приводит к серьёзным заболеваниям. Министерство здравоохранения Южной Африки также указало, что этот штамм может быть движущей силой второй волны пандемии COVID-19 в стране из-за того, что штамм распространяется быстрее, чем другие более ранние штаммы вируса.

Ученые отметили, что этот штамм содержит несколько мутаций, которые позволяют ему легче прикрепляться к клеткам человека из-за трех мутаций в рецептор-связывающем домене (RBD) в спайковом гликопротеине вируса: N501Y (аминокислота аспарагин (N) заменена на аминокислоту тирозин (Y) в позиции 501), K417N и E484K. Две из этих мутаций (E484K и N501Y) находятся в рецептор-связывающем мотиве (RBM) рецептор-связывающего домена (RBD).

Мутация N501Y также была обнаружена в штамме 202012/01, широко распространившимся в Великобритании. Две другие мутации, обнаруженные в 501.V2 — E484K и K417N, в британском штамме отсутствуют. Кроме того, 501.V2 не имеет мутации 69-70del, обнаруженной в другом штамме.

Обнаружение

Новый штамм был обнаружен путем секвенирования полного генома. Несколько геномных последовательностей из этой линии были отправлены в базу данных генетических последовательностей GISAID, например, последовательность EPI_ISL_678597.

Международное распространение

23 декабря Мэтт Хэнкок объявил, что два человека, которые приехали из Южной Африки в Великобританию, были инфицированы 501.V2. 28 декабря этот штамм был обнаружен у двух человек в Швейцарии и у одного человека в Финляндии. 29 декабря штамм был обнаружен у путешественника, приехавшего из Южной Африки в Японию, и у одного международного путешественника в Квинсленде, Австралия. 30 декабря штамм был обнаружен в Замбии. 31 декабря он был также обнаружен во Франции у пассажира, возвращавшегося из Южной Африки. 2 января 2021 года первый случай заражения этим штаммом был выявлен в Южной Корее. Австрия сообщила о своем первом случае заражения этим штаммом, а также о четырёх случаях заражения британским штаммом 4 января. 8 января 2021 года Ирландия сообщила об обнаружении 3 случаев заболевания этим штаммом, все из которых были связаны с поездками из Южной Африки.

Нечувствительность к вакцинам

4 января 2021 года газета The Telegraph сообщила, что оксфордский иммунолог сэр Джон Белл считает, что новый южноафриканский штамм вызывает «большой вопрос», поскольку он может быть устойчивым к вакцинам, тем самым разрушая надежды и заменяя их страхом[8]. В тот же день профессор вакцинологии Шабир Мадхи заявил CBS News, что нет уверенности в том, что новый штамм 501.V2 сможет «обойти» защиту вакциной, но он полагает, что она «может быть менее эффективна»[9]. Дополнительные мутации в белке-шипе в штамме 501.V2 были названы доцентом кафедры клеточной микробиологии Университета Рединга Саймоном Кларком как вызывающий беспокойство фактор, поскольку они «могут сделать вирус менее восприимчивым к иммунному ответу, вызванному вакциной». Лоуренс Янг, вирусолог из Уорикского университета, также отметил, что множественные спайковые мутации этого штамма «могут привести к некоторому уходу от иммунной защиты»[10].

Некоторые исследования показывают ускользание этого штамма от нейтрализующего многоклонального антитела, нацеленного на спайк-белок SARS-CoV-2[11][12].

Угур Сахин, исполнительный директор BioNTech, заявил, что необходимы дальнейшие исследования, чтобы убедиться, что нынешняя вакцина производства этой компании работает против штамма 501.V2, однако, если вакцину будет необходимо скорректировать, компания может сделать это примерно за 6 недель[13].

8 января Guardian сообщила, что вакцина Pfizer и BioNTech от COVID-19 показала в тестах, включающих 20 анализов крови, что она способна обеспечивать защиту от штамма 501.V2. Необходимы дальнейшие исследования, чтобы установить точную степень защиты[14].

Компания Модерна планирует протестировать новую версию своей вакцины, специально модифицированную для защиты от штамма 501.V2[15], аналогичные меры предпринимает компания Novavax[16]. По данным клинического исследования вакцины Ad26.COV2.S компании Johnson & Johnson, её эффективность на юге Африки на 15 % ниже, чем в США (57 % и 72 % соответственно); разница, вероятно, связана с распространенностью штамма 501.V2 в ЮАР[17]. Ещё одно исследование вакцины (NVX-CoV2373 производства Novavax) показало[16][18] эффективность в 60 % (для ВИЧ-негативных участников) в Южной Африке по сравнению с эффективностью 90 % в Великобритании. По данным Reuters, вакцина Pfizer лишь немного менее эффективна против 501.V2[19]. Компания AstraZeneca планирует адаптировать свою вакцину к данному штамму, новая вакцина должна быть готова к осени 2021[20].

24 февраля 2021 года компания Модерна объявила о начале клинических исследований новой версии своей вакцины. Новая версия разработана специально для борьбы с 501.V2[21][22].

Мутация E484K

Сообщается, что изменение аминокислоты E484K, мутация рецептор-связывающего домена (RBD), «связана с ускользанием от нейтрализующих антител», что может отрицательно повлиять на эффективность вакцин против COVID, нацеленных на спайк-белок[23][24]. Спайковая мутация E484K была связана со случаем повторного заражения штаммом 501.V2 SARS-CoV-2 в Бразилии, что, по мнению исследователей, было первым подобным случаем повторного заражения штаммом, содержащим данную мутацию[25].

Статистика
Случаи по странам (по состоянию на 9 января 2021)
Страна Подтвержденных случаев Дата Источники
Великобритания223 декабря 2020[26]
Швейцария228 декабря 2020[27]
Финляндия128 декабря 2020[28]
Япония129 декабря 2020[29]
Австралия129 декабря 2020[30]
Замбия130 декабря 2020[31]
Франция131 декабря 2020[32]
Южная Корея12 января 2021[33]
Австрия14 января 2021[34]
Ирландия38 января 2021[35]
Канада18 января 2021[36]
В мире (11 других стран)15

См. также

Примечания
  1. ВОЗ решила называть штаммы коронавируса буквами греческого алфавита. — «Варианты коронавируса COVID-19 станут обозначать буквами греческого алфавита, чтобы не дискриминировать страны, где эти штаммы обнаружили впервые, и для удобства произношения в ненаучном разговоре, сообщила Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ). В соответствии с новой системой, "британский" штамм коронавируса B.1.1.7 получит название "Альфа", вариант B.1.351, впервые обнаруженный в ЮАР, станет "Бетой", а бразильский P.1 - "Гаммой". Два подвида "индийского" штамма коронавируса - B.1.617.2 и B.1.617.1 - назовут "Дельтой" и "Каппой" соответственно.».
  2. CDC. Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) (англ.) ?. Centers for Disease Control and Prevention (11 февраля 2020). Дата обращения: 9 января 2021.
  3. Африканский штамм коронавируса поставил под вопрос эффективность вакцин. www.mk.ru. Дата обращения: 9 января 2021.
  4. Новый «южноафриканский» штамм коронавируса добрался до Франции. lenta.ru. Дата обращения: 9 января 2021.
  5. SA reaches grim milestone of 1 million Covid-19 cases (англ.). www.iol.co.za. Дата обращения: 9 января 2021.
  6. Covid: South Africa passes one million infections as cases surge, BBC News (28 декабря 2020). Дата обращения 9 января 2021.
  7. Fink, Sheri. South Africa announces a new coronavirus variant., The New York Times (18 декабря 2020). Дата обращения 9 января 2021.
  8. Knapton, Sarah. South African variant may evade vaccines and testing, warn scientists, The Telegraph (4 января 2021). Дата обращения 5 января 2021.
  9. COVID vaccines "might not" work as well on South African strain, scientists warn (англ.) ?. www.cbsnews.com. Дата обращения: 5 января 2021.
  10. U.K. scientists worry vaccines may not protect against coronavirus variant found in South Africa | CBC News, CBC. Дата обращения 5 января 2021.
  11. Yiska Weisblum, Fabian Schmidt, Fengwen Zhang, Justin DaSilva, Daniel Poston. Escape from neutralizing antibodies by SARS-CoV-2 spike protein variants // eLife. — Т. 9. — ISSN 2050-084X. — doi:10.7554/eLife.61312.
  12. Brief report: New Variant Strain of SARS-CoV-2 Identified in Travelers from Brazil.
  13. BioNTech vaccine for new COVID-19 variant could be ready in 6 weeks (англ.). euronews (22 декабря 2020). Дата обращения: 5 января 2021.
  14. Geddes, Linda. Pfizer vaccine protects against new Covid variants, study suggests, The Guardian (8 января 2021). Дата обращения 9 января 2021.
  15. Grady, Denise. Moderna Says Vaccine Still Protects Against Virus Variants, The New York Times (25 января 2021). Дата обращения 25 января 2021.
  16. Novavax COVID-19 Vaccine Demonstrates 89.3% Efficacy in UK Phase 3 Trial | Novavax Inc. - IR Site (англ.). ir.novavax.com. Дата обращения: 30 января 2021.
  17. Johnson & Johnson отчиталась об эффективности своей вакцины от COVID-19. РБК. Дата обращения: 29 января 2021.
  18. Novavax Soars After Upbeat Results From Covid Vaccine Trial, Bloomberg.com (28 января 2021). Дата обращения 29 января 2021.
  19. Geddes, Linda. Pfizer vaccine protects against new Covid variants, study suggests, The Guardian (8 января 2021). Дата обращения 1 февраля 2021.
  20. AstraZeneca адаптирует вакцину для борьбы со штаммом COVID-19 из ЮАР. РБК. Дата обращения: 12 февраля 2021.
  21. Moderna сообщила о разработке вакцины от южноафриканского штамма COVID-19 — Интерфакс.
  22. Berkeley Lovelace Jr. Moderna to begin clinical trials of Covid booster shots for variant from South Africa, sends to NIH for study (англ.). CNBC (24 февраля 2021). Дата обращения: 26 февраля 2021.
  23. New virus mutation raises vaccine questions (англ.). France 24 (13 января 2021). Дата обращения: 24 января 2021.
  24. Ewen Callaway. Could new COVID variants undermine vaccines? Labs scramble to find out (англ.) // Nature. — 2021-01-07. — Vol. 589, iss. 7841. — P. 177–178. — doi:10.1038/d41586-021-00031-0.
  25. Brito, Ricardo. South African coronavirus variant detected in reinfection case in Brazil, Reuters (9 января 2021). Дата обращения 24 января 2021.
  26. Confirmed cases of COVID-19 variant from South Africa identified in UK. Government of the United Kingdom. Дата обращения: 23 декабря 2020.
  27. South African Covid variant discovered in Switzerland. BusinessInsider. Дата обращения: 29 декабря 2020.
  28. Update: New UK, South African variant Covid strains detected in Finland. Yle News. Дата обращения: 29 декабря 2020.
  29. South African coronavirus variant found in Japan (англ.) ?. News24. Дата обращения: 29 декабря 2020.
  30. First case of 'more contagious' coronavirus strain detected in Australia. 9 News (29 December 2020).
  31. Zambia experiences second wave of Covid-19 as variant linked to new strain in South Africa isolated (англ.), Luksaka Times (30 December 2020).
  32. France has detected its first case of the South African variant of coronavirus, the health ministry said on Thursday, France 24 (31 December 2020).
  33. 남아공 '변이 코로나' 첫 국내 확인…영국발 변이도 4건 추가 (кор.), Donga Ilbo (2 January 2021).
  34. Ellyatt, Holly. Covid variant found in South Africa is worrying experts: Here's what we know so far, CNBC (6 January 2021).
  35. Statement from the National Public Health Emergency Team - Friday 8 January. Government of Ireland. Department of Health (8 January 2021). Дата обращения: 8 января 2021.
  36. Alberta reports Canada's 1st case of coronavirus variant found in South Africa. CBC News (8 January 2021). Дата обращения: 9 января 2021.

Ссылки
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.