Дельта-штамм SARS-CoV-2
Дельта-штамм коронавируса SARS-CoV-2 (штамм B.1.617.2[1]) — один из штаммов вируса SARS-CoV-2, возбудителя COVID-19, относящийся к линии поколений B.1.617. Впервые обнаружен и описан в Индии[2].
Передача происходит в разных возрастных группах, включая лиц от 12 до 20 лет[3]. Инкубационный период составляет не 3—7 дней, а 1—3 дня[4]. Также отмечается повышенная по сравнению с другими штаммами вирусная нагрузка[4]. Период выведения возбудителя из организма составляет 13—15 дней, в то время как для других штаммов он составляет 7—9 дней[4].
Вызывает простудные симптомы в тяжелой форме, включая недомогание, повышенную температуру, мигрень (головную боль), боль в горле, кашель и ринит[3][5]. Риск госпитализации по сравнению с альфа-штаммом выше в 1,85 раза[3].
По данным на конец декабря 2021 года, дельта-штамм быстро вытесняется омикрон-штаммом в тех странах, где последний начал распространяться[6] (в частности, так происходит в Дании, Норвегии, Великобритании и США)[7].
Изменения вируса
У дельта-штамма выявлена мутация P681R. В результате изменён небольшой фрагмент S-белка, а вирус стал более заразным[2].
14 июня 2021 года в Индии был обнаружен мутировавший вариант B.1.617.2, который известен как вариант AY.1 или «дельта плюс»[8]. «Дельта плюс» отличается наличием в спайковом белке мутации K417N, которая способна снижать активность антител у переболевших и вакцинированных людей[9]. Минздрав Индии назвал три отличительных признака «дельты плюс»: повышенная контагиозность, усиленная способность связываться с рецепторами клеток легких и потенциальная устойчивость к терапии моноклональными антителами[10]. «Дельта плюс» имеет мутацию K417N в спайковом белке (то есть в белке шипа вируса), в результате вирус быстрее связывается с клетками легких человека. Имеется предположение, что K417N также помогает вирусу уклоняться от нейтрализующих антител. Схожие мутации имеются у штаммов «бета» и «гамма».[11]
В октябре 2021 года, отслеживая эволюцию штамма «дельта», британские вирусологи обнаружили новый штамм AY.4.2, обладающий большей контагиозностью, чем предыдущие штаммы. AY.4.2 на 10—15 % заразнее штамма «дельта». В Великобритании на его долю приходится каждый десятый случай заражения коронавирусом в стране[12][13].
Распространение
К началу июля 2021 года Всемирная организация здравоохранения зафиксировала дельта-штамм в 98 странах как с высоким, так и с низким уровнем вакцинации населения, во многих странах он становится доминантным[14].
Научный сотрудник Китайского центра по контролю и профилактике заболеваний Фэн Цзыцзянь считает вероятным, что дельта-штамм станет доминирующим во всём мире[15].
В России
По информации на середину июня 2021 года, доля дельта-штамма (B.1.617 по классификации PANGO) за предшествующие четыре недели составила в России 63,2 %, о чём указано на международной платформе GISAID, которая обеспечивает открытый доступ к геномным последовательностям вирусов гриппа и коронавируса и географическим данным распространения вариантов коронавируса. Аналогичные данные можно было найти в базе проекта Бернского и Базельского университетов Швейцарии CoVariants, где указывалось, что во второй половине мая 2021 года доля дельта-штамма для секвенированных образцов из России составляла 66 %[16]. По данным Российского консорциума по секвенированию геномов SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI), дельта-штамм занимал чуть больше половины (52 %) в образцах, полученных в Санкт-Петербурге в мае 2021 года, а в июне 2021 года — более 90 %[17][18].
По Санкт-Петербургу дельта-вариант распространился за 2 месяца и в конце второй декады июня 2021 года потеснил альфа-штамм. Санкт-Петербург — единственный регион России с достаточными данными по секвенированию штаммов вирусов[2].
29 июня 2021 года глава Роспотребнадзора Анна Попова заявила об обнаружении в России варианта дельта-штамма — «дельта-плюс».[19]
13 июля 2021 года главный санитарный врач Ростовской области заявил, что за последние 3 недели специалисты Роспотребнадзора выявляют исключительно дельта-штамм, при этом в 90 % случаев его носители не выезжали за границу. Кроме того, отметил он, этот штамм выявляют у граждан, прибывающих из Таджикистана, Узбекистана и Киргизии[20].
Примечания
- ВОЗ решила называть штаммы коронавируса буквами греческого алфавита . — «Варианты коронавируса COVID-19 станут обозначать буквами греческого алфавита, чтобы не дискриминировать страны, где эти штаммы обнаружили впервые, и для удобства произношения в ненаучном разговоре, сообщила Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ). В соответствии с новой системой, «британский» штамм коронавируса B.1.1.7 получит название «Альфа», вариант B.1.351, впервые обнаруженный в ЮАР, станет «Бетой», а бразильский P.1 — «Гаммой». Два подвида «индийского» штамма коронавируса — B.1.617.2 и B.1.617.1 — назовут «Дельтой» и «Каппой» соответственно.».
- Александр Ершов. Рассказываем все, что известно ученым о варианте дельта, из-за которого Россия переживает небывалую вспышку ковида . Meduza (19.06.2021).
- Названы группы населения, которые в первую очередь поражает дельта-штамм коронавируса .
- Эпидемиолог из КНР назвал три главных особенности штамма «Дельта» COVID-19 .
- Германия: Симптомы индийского штамма коронавируса отличаются от типичных .
- Анастасия Селиванова. Попова предсказала вытеснение «дельта»-штамма «омикроном» // Российская газета, 28.12.2021.
- Эксперт сообщил, что новый штамм «омикрон» начинает очень быстро вытеснять «дельту» // ТАСС, 26.12.2021.
- Sharma, Milan New 'Delta Plus' variant of SARS-CoV-2 identified; here's what we know so far (англ.). India Today. Дата обращения: 16 июня 2021.
- В Индии выявили новый штамм коронавируса «дельта плюс», 21 июня 2021
- В Индии обнаружили новый сверхзаразный штамм Covid, 24.06.2021
- "Дельта плюс" вызывает все больше опасений. Что мы знаем об этом штамме коронавируса? .
- New Delta descendant may be more infectious than its ancestor
- В Великобритании раскрыли подробности о новом штамме коронавируса, 20 октября 2021
- ВОЗ зафиксировала штамм COVID «дельта» в 98 странах // Интерфакс, 02.07.2021.
- Дельта-штамм станет доминирующим в мире - эксперт .
- Доля индийского варианта коронавируса в России достигла 63 % // Медвестник, 16.06.2021
- Заразительный пример: какова роль индийского штамма в росте заболеваемости // Известия, , 16.06.2021.
- Индийский штамм нашли в 90 % исследованных российских образцов коронавируса // Известия, 16.06.2021.
- В России обнаружили штамм коронавируса "дельта плюс" .
- Назван российский регион, где выявили исключительно «дельта»-штамм коронавируса .