Ро-независимая терминация

Внутренняя терминация, также ρ-независимая терминация, ро-независимая терминация (англ. Rho-independent termination), — механизм остановки транскрипции гена у прокариот[1]. Суть этого механизма такова: мРНК содержит гуанин-цитозин-обогащённую последовательность, которая может образовывать структуры типа шпилька в 7—20 пар оснований в длину. Гуанин и цитозин образуют друг с другом три водородные связи и поэтому связаны довольно прочно[2]. Сразу после шпильки располагается участок, обогащённый урацилом. Связи между урацилом и аденином очень слабы. Белок, связанный с РНК-полимеразой (nusA), настолько прочно связывается со шпилькой, что это вызывает временную остановку полимеразы и прекращение транскрипции[3]. В этот момент полимераза располагается на полиурациловом участке последовательности. Слабые аденин-урациловые связи снижают энергию дестабилизации дуплекса РНК-ДНК, что позволяет им ослабить напряжение полинуклеотидной цепи и диссоциировать от РНК-полимеразы[2].

Вторичная структура бактериального Rho-независимого терминального элемента

Ро-элементы, которые не содержат полиурациловой последовательности, способны приостановить РНК-полимеразу, но она, как правило, продолжает транскрипцию спустя некоторое время, поскольку дуплекс слишком стабилен, чтобы вызвать диссоциацию РНК-полимеразы и последующую терминацию.

Ро-независимая терминация транскрипции — это частый случай механизма, лежащего в основе активности цис-регуляторных элементов РНК, таких как рибопереключатели.

Примечания
  1. Farnham, PJ; Platt, T. Rho-independent termination: dyad symmetry in DNA causes RNA polymerase to pause during transcription in vitro (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 1981. — 11 February (vol. 9, no. 3). — P. 563—577. — doi:10.1093/nar/9.3.563. — PMID 7012794.
  2. Lewin, Benjamin. Genes IX (неопр.). — Sudbury, MA: Jones and Bartlett Publishers, 2007. — ISBN 0-7637-4063-2.
  3. Wilson K. S., von Hippel P. H. Transcription termination at intrinsic terminators: the role of the RNA hairpin (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — September (vol. 92, no. 19). — P. 8793—8797. — doi:10.1073/pnas.92.19.8793. — PMID 7568019.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.