Корепрессор
Корепрессор — вещество, которое ингибирует экспрессию генов. Для прокариот корепрессорами являются низкомолекулярные вещества или малые молекулы, тогда как в эукариотах, корепрессорами являются белки. Корепрессоры непосредственно не связывают ДНК, но вместо этого косвенно регулируют экспрессию гена путём связывания с репрессорами и усиливают или модулируют их действие.
Корепрессор подавляет (репрессирует) экспрессию генов путём связывания с репрессором, который по сути своей является фактором транскрипции. Репрессор, в свою очередь связывает промотор соответствующего гена и блокирует транскрипцию данного гена.
Функции
Прокариоты
Для прокариот, термин корепрессор используют для обозначения низкомолекулярного лиганда, который активирует белок-репрессор. Например, триптофановый репрессор (TRpr) кишечной палочки способен связываться с ДНК и подавлять транскрипцию триптофанового оперона только тогда, когда с ним связан его корепрессор — триптофан. Белок-репрессор, не связанный с корепрессором называется апорепрессором и неспособен подавлять активность генов[1]. Оперон Trp кодирует ферменты, ответственные за синтез триптофана, а белок TRpr обеспечивает отрицательную обратную связь, которая помогает регулировать уровень биосинтеза этой аминокислоты.
Проще говоря, триптофан действует как регуляторная молекула, подавляя собственный биосинтез[2].
Эукариоты
Применительно к эукариотам термин корепрессор используется для обозначения белка, который связывается с факторами транскрипции[3]. В отсутствие корепрессоров и в присутствии коактиваторов, факторы транскрипции активируют экспрессию гена. Коактиваторы и корепрессоры конкурирут за места связывания на молекулах транскрипционных факторов. Ещё один механизм, с помощью которого корепрессор может подавить инициацию транскрипции — связывание с фактором транскрипции/ДНК комплексом путём присоединения к себе гистондезацетилазы, которая катализируют удаление ацетильных групп с лизиновых остатков. Это увеличивает положительный заряд гистонов, который усиливает электростатическое притяжение между положительно заряженными гистонами и отрицательно заряженной ДНК, что делает ДНК менее доступными для транскрипции[4][5].
В настоящий момент, по разным подсчётам, организме человека обнаружена от нескольких десятков до нескольких сотен корепрессоров, однако, эта цифра сильно зависит от уровня доверия к исследованию, которое характеризует белок в как корепрессор[6].
Примечания
- Evans P. D., Jaseja M., Jeeves M., Hyde E. I. NMR studies of the Escherichia coli Trp repressor.trpRs operator complex. (англ.) // European journal of biochemistry. — 1996. — Vol. 242, no. 3. — P. 567—575. — doi:10.1111/j.1432-1033.1996.0567r.x. — PMID 9022683.
- Foster J. B., Slonczewski J. Microbiology: An Evolving Science. — Second. — New York: W. W. Norton & Company, 2010. — ISBN 0-393-93447-0.
- Jenster G. Coactivators and corepressors as mediators of nuclear receptor function: an update. (англ.) // Molecular and cellular endocrinology. — 1998. — Vol. 143, no. 1-2. — P. 1—7. — doi:10.1016/S0303-7207(98)00145-2. — PMID 9806345.
- Lazar M.A. Nuclear receptor corepressors // Nucl Recept Signal. — 2003. — Т. 1. — С. e001. — doi:10.1621/nrs.01001. — PMID 16604174.
- Goodson M., Jonas B.A., Privalsky M.A. Corepressors: custom tailoring and alterations while you wait (англ.) // Nucl Recept Signal : journal. — 2005. — Vol. 3, no. Oct 21. — P. e003. — doi:10.1621/nrs.03003. — PMID 16604171.
- Schaefer U., Schmeier S., Bajic V.B. TcoF-DB: dragon database for human transcription co-factors and transcription factor interacting proteins (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — 2011. — January (vol. 39, no. Database issue). — P. D106—10. — doi:10.1093/nar/gkq945. — PMID 20965969.