Гаплогруппа D (Y-ДНК)

Гаплогруппа D (CTS3946) — гаплогруппа ДНК Y-хромосомы. Как гаплогруппа D, так и E содержат однонуклеотидный полиморфизм M168, который имеется во всех гаплогруппах, кроме A и B (см. группа CT), а также полиморфизм уникального события YAP, уникальный для гаплогруппы DE — общего предка D и Е.

Не следует путать с Гаплогруппа D (мтДНК).
Гаплогруппа D
Тип Y-ДНК
Время появления 64,7-83 тыс. лет назад[1]
Место появления Африка, Азия[1]
Предковая группа DE
Сестринские группы E
Субклады D1, D2
Мутации-маркеры CTS3946, CTS4030/Z1605

Происхождение

Гаплогруппа D происходит от мутации Y-хромосомной гаплогруппы DE, произошедшей у мужчины, жившего предположительно 65,2 тыс. лет назад. Время жизни общего предка всех живущих носителей Y-хромосомной гаплогруппы D — 46,5 тыс. лет назад (даты определены по снипам компанией YFull[2]).

Крис Тайлер-Смит с коллегами считают, что гаплогруппа D образовалась в Африке около 73 тыс. л. н., а около 71 тыс. лет назад отделилась западноафриканская линия D0[1]. И гаплогруппа D, и гаплогруппа E содержат характеристику уникальный полиморфизм событий YAP, но показывают общее происхождение. Субклад гаплогруппы D1- M174 возник, с большой вероятностью в Азии, около 60 тыс. лет назад. Субклад гаплогруппы D1- M174 не встречается за пределами Азии. Гаплогруппа D2 была обнаружена незначительно в Африке и Передней Азии[3].

По мнению Т. Карафет, гаплогруппа D возникла в Азии около 60 тыс. лет назад[4][5].

Палеогенетика
  • Гаплогруппа D обнаружена у образца Ma91 (ок. 4319 л. н.) из Малайзии[6].
  • Субклад D1a2b1 (D1b2a-CTS220 в ISOGG 2018) выявлен у представителя культуры Дзёмон, жившего примерно 3500—3800 лет назад[7]. У образца I6341 (Burial 5, JOM_137, 1500—1000 лет до н. э., Funadomari, Ребун) определена Y-хромосомная гаплогруппа D-M174/F1344>D1b-M64.1>Z1516, у образца I13887 (1063 Burial 7, 2191—1982 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1a2a3a-Z1570 (D1b1c1 в ISOGG 2018), у образца I13886 (1062 Burial 6, 2136—1959 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1a2a3a-Z1575 (D1b1c1 в ISOGG 2018), у образца I13883 (1050 Burial 2, 984—835 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1b-M64.1>D1b1c-CTS6609>D1b1c1-Z1574>Y11739 (ISOGG 2018)[8].
  • Гаплогруппа D1a2a1 определена у представителя кобанской культуры из могильника Заюково-3, расположенного близ села Заюково в Баксанском районе Кабардино-Балкарии (VIII—VII века до н. э.)[9].
  • D1b-M64.1>Z1516>CTS220 определили у образца I15926 (SRM 3826-1163, Pogrebeniye 2, Burial #2, 1800—1950 гг.) со стоянки Nevelsk 2 на Сахалине[8].

Обзор

В настоящее время встречается с высокой частотой среди населения Тибета, Японского архипелага[10] и Андаманских островов, однако, в силу неизвестных обстоятельств, пока не обнаружена на полуострове Индостан. Айны в Японии, а также народы джарава и онге на Андаманских островах имеют почти исключительно данную гаплогруппу, хотя у айнов кроме гаплогруппы D1a2 (81,3%[11]) с частотой около 15 % также встречается Y-хромосомная гаплогруппа C3.

Также Y-хромосомная гаплогруппа D обнаружена с низкой или умеренной частотой у народов Центральной Азии и севера Восточной Азии, а также у китайцев-хань и народов мяо-яо в Китае и некоторых национальных меньшинств китайских провинций Сычуань и Юньнань, говорящих на тибето-бирманских языках и проживающих в непосредственной близости от тибетцев. Субклад D1a1a-M15, выявленный в популяции народа И (Ляншань-Ийский автономный округ) был разветвлением расширения тибетских групп с запада на восток на плато[12].

В отличие от гаплогруппы C, гаплогруппа D не мигрировала из Азии через Берингию в Новый Свет.

Гаплогруппа D также примечательна своей исключительной географической дифференциацией, когда определённый подкласс гаплогруппы чётко локализуется в какой-либо популяции, где большой процент лиц имеют гаплогруппу D:

Такая, по-видимому, древняя диверсификация гаплогруппы D заставляет предположить, что её скорее следует охарактеризовать как «супергаплогруппу», «макрогаплогруппу».

Особо характерными являются примеры гаплогруппы D у населения Японских островов, поскольку они содержат комплекс из как минимум пяти отдельных мутаций, свойственных гаплогруппе D, что ясно отличает их от гаплогруппы D, обнаруженной у жителей Тибета и Андаманских островов. Этот факт является свидетельством того, что гаплогруппа D1a2 была модальной гаплогруппой доисторической культуры Дзёмон на Японских островах.

Подклассы

Филогенетическое дерево

ISOGG (version: 14.151)[13].

Примечания
  1. Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; Asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans out of Africa (англ.) // Genetics : journal. — 2019. — 13 June. — P. genetics.302368.2019. — ISSN 0016-6731. — doi:10.1534/genetics.119.302368. — PMID 31196864.
  2. D YTree
  3. Estes, Roberta Exciting New Y DNA Haplogroup D Discoveries! (англ.). DNAeXplained - Genetic Genealogy (21 июня 2019). Дата обращения: 8 июля 2019.
  4. Shi et al. (2008) Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations, BMC Biology
  5. Tatiana M. Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  6. Hugh McColl et al. Ancient Genomics Reveals Four Prehistoric Migration Waves into Southeast Asia, 2018
  7. POB-162 Phenotype and phylogeny of Neolithic Japanese hunter-gatherers, Jomon people, based on whole nuclear genome sequences // SMBE 2018 Архивная копия от 7 июля 2018 на Wayback Machine
  8. Chuan-Chao Wang et al. Genomic Insights into the Formation of Human Populations in East Asia (Supplementary Tables // Table 1. Newly reported ancient individuals), 2021
  9. Eugenia Boulygina et al. Mitochondrial and Y-chromosome diversity of the prehistoric Koban culture of the North Caucasus, 2020
  10. Michael F. Hammer, Tatiana M. Karafet, Hwayong Park, Keiichi Omoto, Shinji Harihara, Mark Stoneking and Satoshi Horai, «Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes», Journal of Human Genetics Volume 51, Number 1 / January, 2006.
  11. Yusuke Watanabe, Izumi Naka, Seik-Soon Khor, Hiromi Sawai, Yuki Hitomi, Katsushi Tokunaga, Jun Ohashi Analysis of whole Y-chromosome sequences reveals the Japanese population history in the Jomon period, 2019
  12. Fei Wang, Feng Song, Mengyuan Song, Jienan Li, Mingkun Xie, Yiping Hou. Genetic reconstruction and phylogenetic analysis by 193 Y-SNPs and 27 Y-STRs in a Chinese Yi ethnic group, 28 April 2021
  13. Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2019
  14. Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082.
  15. D YTree. www.yfull.com. Дата обращения: 3 сентября 2019.
  16. Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2014

Литература

См. также
Эволюционное древо гаплогрупп Y-хромосомы человека
Y-хромосомный Адам
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1  F2  F3    GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
I J LT (K1) K2
L (K1a)   T (K1b)       K2a/K2a1/NO/NO1 K2b
N O   K2b1     P (K2b2)/P1  
  S (K2b1a) M (K2b1b) Q R  

Ссылки
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.