Гаплогруппа DE (Y-ДНК)

Гаплогруппа DE — это человеческая Y-хромосомная гаплогруппа. Её определяют мутации однонуклеотидного полиморфизма M1(YAP), M145(P205), M203, P144, P153, P165, P167, P183[5].

Гаплогруппа DE
Тип Y-ДНК
Время появления 57000—66000 лет до н. э.[1] / 70000—75000 лет — время разделения CF и DE, и 50000—55000 — время разделения на D и E[2]
Место появления Африка[3] или Азия[4]
Предковая группа CT
Сестринские группы CF
Субклады DE*, D и E
Мутации-маркеры YAP, M145 = P205, M203, P144, P153, P165, P167, P183

Она известна за счёт определяющего её полиморфизма уникального события — инсерции YAP. Эта мутация произошла, когда участок ДНК Alu, копирующий себя, добавил копию в Y-хромосому. Так, Y-хромосомы, содержащие мутацию YAP, называют YAP+, а не содержащие — YAP-.

Появление

Происходит от мутации гаплогруппы CT, произошедшей у мужчины, жившего около 68,5 тыс. лет назад (дата определена по снипам компанией YFull[6]).

По одной версии, гаплогруппа DE и YAP+ появились в Африке[7]. Это подтверждается тем, что:

  1. В Африке YAP имеет наибольшее распространение (более 80 %).
  2. DE содержит две подгруппы, которые не пересекаются филогенетически или географически.
  3. Гаплогруппа C появилась примерно в одно время с DE где-то в Азии, и нет никаких свидетельств, в том числе археологических, о миграциях народов из Азии в Африку в ту эпоху.

По другой версии, YAP+ родом из Азии. Это подтверждают следующие аргументы:

  1. Учитывая наличие YAP у носителей гаплогруппы D в северо-восточной Индии и на Андаманских островах, можно предположить, что в Южной Азии некоторые из хромосом M168 привели к добавлению YAP и мутации M174[4].
  2. Гаплогруппа CT, от которой происходит DE, имеет неафриканское происхождение[8].
  3. Существуют свидетельства несколько более поздних перемещений хромосом из Азии в Африку.

В 2016 году Позник и Андерхилл показали, что Y-хромосомная гаплогруппа E возникла за пределами Африки, а общий предок всех неафриканских линий (TMRCA), в том числе гаплогрупп DE и CF, жил ~ 76 тыс. лет назад[9]. Разделение гаплогруппы DE на субклады D и E произошло 69,0 ± 14,7 тыс. л. н., приход носителей гаплогруппы Е в Африку произошёл 65,5 ± 8,5 тыс. лет назад[10].

Крис Тайлер-Смит с коллегами считают, что линии DE и CF разошлись 77 тыс. л. н. (исходя из скорости мутации 0,76×10-9 на пару нуклеотидов в год)[11].

Этногеографическое распространение

До сих пор не было найдено ни одного живущего в настоящий момент представителя парагруппы DE. Найденные 5 образцов у нигерийцев оказались на самом деле редким субкладом гаплогруппы D2 (A5580.2)[12]. То же самое относится к образцу из народа налу из Гвинеи-Бисау[13]. У двух представителей на Тибете[14], оказался на самом деле субклад D-M174, а также у одного образца из Республики Алтай в Бешпельтире[15].

Дерево

Филогенетическое дерево YCC 2008[16].

  • DE (YAP, M145 [P205], M203, P144, P153, P165, P167, P183)
    • DE*
    • D (M174, (021355))
    • E (SRY4064, M96, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162)

Примечания
  1. Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  2. Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans, Nature 505, 87–91 (02 January 2014)
  3. Underhill. The case for an African rather than an Asian origin of the human Y-chromosome YAP insertion // Genetic, Linguistic and Archaeological Perspectives on Human Diversity in Southeast Asia (англ.). — 2001. — ISBN 9810247842.
  4. Chandrasekar et al. (2007), YAP insertion signature in South Asia, 1: Ann Hum Biol. 2007 Sep-Oct;34(5):582-6.
  5. ISOGG reference webpage.
  6. DE YTree
  7. Stone, Linda. Voyages, Prehistoric Human Expansions // Genes, Culture, and Human Evolution (неопр.). — 2007.
  8. Chuan-Chao Wang, Li Hui. Comparison of Y-chromosomal lineage dating using either evolutionary or genealogical Y-STR mutation rates, bioRxiv posted online May 3, 2014
  9. Posnik G. D. et al. (2016) Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences, Nature Genetics, 48, 593–599.
  10. Vicente M Cabrera et al. Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup L3 basic lineages migrated back to Africa from Asia around 70,000 years ago, December 13, 2017
  11. Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; Asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans out of Africa (англ.) // Genetics : journal. — 2019. — 13 June. — P. genetics.302368.2019. — ISSN 0016-6731. — doi:10.1534/genetics.119.302368. — PMID 31196864.
  12. Weale et al. (2003), Rare Deep-Rooting Y Chromosome Lineages in Humans: Lessons for Phylogeography, Genetics, Vol. 165, 229—234
  13. Rosa et al. (2007), Y-chromosomal diversity in the population of Guinea-Bissau: a multiethnic perspective, BMC Evolutionary Biology Т. 7: 124, doi:10.1186/1471-2148-7-124, <http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2148-7-124.pdf>
  14. Shi et al. (2008) Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations, BMC Biology
  15. Kharkov et al. (2007)
  16. Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008


Эволюционное древо гаплогрупп Y-хромосомы человека
Y-хромосомный Адам
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1  F2  F3    GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
I J LT (K1) K2
L (K1a)   T (K1b)       K2a/K2a1/NO/NO1 K2b
N O   K2b1     P (K2b2)/P1  
  S (K2b1a) M (K2b1b) Q R  
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.