RBBP4

Связывающий гистоны белок RBBP4 (также известный как RbAp48 или NURF55 ) — белок, кодируемый у человека геном RBBP4 .[1][2]

Связывающий ретинобластому белок 4

Представлено на основе PDB 2XU7.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволRBBP4 ; NURF55; RBAP48; lin-53
Внешние IDOMIM: 602923 MGI: 1194912 HomoloGene: 21153 GeneCards: RBBP4 Gene
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez592819646
EnsemblENSG00000162521ENSMUSG00000057236
UniProtQ09028Q60972
RefSeq (мРНК)NM_001135255NM_009030
RefSeq (белок)NP_001128727NP_033056
Локус (UCSC)Chr 1:
33.12 – 33.15 Mb
Chr 4:
129.31 – 129.34 Mb
Поиск в PubMed

Функция

Этот ген кодирует повсеместно экспрессированный ядерный белок, который принадлежит к весьма консервативным подсемействам WD-повторных белков. Он присутствует в белковых комплексах, участвующих в ацетилировании гистонов и сборке хроматина. Это является частью Mi-2/NuRD комплекса, который был причастен к ремоделированию хроматина и репрессии транскрипции, связанных с деацетилированием гистонов. Этот кодируемый белок также является частью корепрессора комплексов, которые являются неотъемлемой частью транскрипционного сайленсинга. Это выявлено среди нескольких клеточных белков, которые связываются непосредственно с белком ретинобластомы для регуляции пролиферации клеток. Этот белок также, кажется, вовлечен в репрессию транскрипции E2F-респонсивных генов.[3]

Клиническое значение

Снижение RbAp48 в зубчатой извилине гиппокампа мозга, как подозревают, является основной причиной потери памяти при нормальном старении.[4] Возрастное снижение RbAp48 наблюдается в зубчатой извилине при вскрытии тканей после смерти человека, а также у мышей. Кроме того кнокин-ген в доминантной негативной форме RbAp48 вызывает дефицит памяти у молодых мышей подобно тому, что наблюдается у пожилых мышей. И, наконец, перенос генов лентивирусов для увеличения экспрессии RbAp48 в мозге, реверсирует нарушения памяти у пожилых мышей.[4]

RBBP4 использует частично PKA- CREB1-CPB пути.[4] Таким образом, одним из возможных терапевтических подходов для восстановления возрастной потери памяти является использование PKA-CREB1-CPB путей метаболизма стимулирующих препаратов. Ранее было показано, что агонисты дофамина D1/D5, такие как 6-Br-APB и SKF-38393 , которые положительно соединены с аденилатциклазой и цАМФ Фосфодиэстеразы ингибитора ролипрама уменьшают дефекты памяти у пожилых мышей.[5]

Взаимодействия

RBBP4, как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания

  1. Qian Y.W., Wang Y.C., Hollingsworth RE Jr, Jones D., Ling N., Lee E.Y. A retinoblastoma-binding protein related to a negative regulator of Ras in yeast (англ.) // Nature : journal. — 1993. — September (vol. 364, no. 6438). P. 648—652. doi:10.1038/364648a0. PMID 8350924.
  2. Barak O., Lazzaro M.A., Lane W.S., Speicher D.W., Picketts D.J., Shiekhattar R. Isolation of human NURF: a regulator of Engrailed gene expression (англ.) // EMBO J : journal. — 2003. — November (vol. 22, no. 22). P. 6089—6100. doi:10.1093/emboj/cdg582. PMID 14609955.
  3. Entrez Gene: RBBP4 retinoblastoma-binding protein 4.
  4. Pavlopoulos E., Jones S., Kosmidis S., Close M., Kim C., Kovalerchik O., Small S.A., Kandel E.R. Molecular Mechanism for Age-Related Memory Loss: The Histone-Binding Protein RbAp48 (англ.) // Sci Transl Med : journal. — 2013. — August (vol. 5, no. 200). P. 200ra115. doi:10.1126/scitranslmed.3006373. PMID 23986399.
  5. Bach M.E., Barad M., Son H., Zhuo M., Lu Y.F., Shih R., Mansuy I., Hawkins R.D., Kandel E.R. Age-related defects in spatial memory are correlated with defects in the late phase of hippocampal long-term potentiation in vitro and are attenuated by drugs that enhance the cAMP signaling pathway (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — April (vol. 96, no. 9). P. 5280—5285. doi:10.1073/pnas.96.9.5280. PMID 10220457.
  6. Yarden R.I., Brody L.C. BRCA1 interacts with components of the histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. Vol. 96, no. 9. P. 4983—4988. doi:10.1073/pnas.96.9.4983. PMID 10220405.
  7. Zhang Q., Vo N., Goodman R.H. Histone binding protein RbAp48 interacts with a complex of CREB binding protein and phosphorylated CREB (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2000. Vol. 20, no. 14. P. 4970—4978. doi:10.1128/MCB.20.14.4970-4978.2000. PMID 10866654.
  8. Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. Vol. 22, no. 2. P. 536—546. doi:10.1128/MCB.22.2.536-546.2002. PMID 11756549.
  9. Zhang Y., Dufau M.L. Dual mechanisms of regulation of transcription of luteinizing hormone receptor gene by nuclear orphan receptors and histone deacetylase complexes (англ.) // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : journal. — 2003. Vol. 85, no. 2—5. P. 401—414. doi:10.1016/S0960-0760(03)00230-9. PMID 12943729.
  10. Yao Y.L., Yang W.M. The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. Vol. 278, no. 43. P. 42560—42568. doi:10.1074/jbc.M302955200. PMID 12920132.
  11. Nicolas E., Ait-Si-Ali S., Trouche D. The histone deacetylase HDAC3 targets RbAp48 to the retinoblastoma protein (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — 2001. Vol. 29, no. 15. P. 3131—3136. doi:10.1093/nar/29.15.3131. PMID 11470869.
  12. Grozinger C.M., Hassig C.A., Schreiber S.L. Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. Vol. 96, no. 9. P. 4868—4873. doi:10.1073/pnas.96.9.4868. PMID 10220385.
  13. You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. CoREST is an integral component of the CoREST- human histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. Vol. 98, no. 4. P. 1454—1458. doi:10.1073/pnas.98.4.1454. PMID 11171972.
  14. Hassig C.A., Fleischer T.C., Billin A.N., Schreiber S.L., Ayer D.E. Histone deacetylase activity is required for full transcriptional repression by mSin3A (англ.) // Cell : journal. Cell Press, 1997. Vol. 89, no. 3. P. 341—347. doi:10.1016/S0092-8674(00)80214-7. PMID 9150133.
  15. Ng H.H., Zhang Y., Hendrich B., Johnson C.A., Turner B.M., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 is a transcriptional repressor belonging to the MeCP1 histone deacetylase complex (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. Vol. 23, no. 1. P. 58—61. doi:10.1038/12659. PMID 10471499.
  16. Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. Vol. 13, no. 15. P. 1924—1935. doi:10.1101/gad.13.15.1924. PMID 10444591.
  17. Zhang Y., Dufau M.L. Silencing of transcription of the human luteinizing hormone receptor gene by histone deacetylase-mSin3A complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. Vol. 277, no. 36. P. 33431—33438. doi:10.1074/jbc.M204417200. PMID 12091390.
  18. Hassig C.A., Tong J.K., Fleischer T.C., Owa T., Grable P.G., Ayer D.E., Schreiber S.L. A role for histone deacetylase activity in HDAC1-mediated transcriptional repression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. Vol. 95, no. 7. P. 3519—3524. doi:10.1073/pnas.95.7.3519. PMID 9520398.
  19. Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex (англ.) // Cell : journal. Cell Press, 1997. Vol. 89, no. 3. P. 357—364. doi:10.1016/S0092-8674(00)80216-0. PMID 9150135.
  20. Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. Vol. 278, no. 9. P. 7234—7239. doi:10.1074/jbc.M208992200. PMID 12493763.
  21. Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — 1998. Vol. 395, no. 6705. P. 917—921. doi:10.1038/27699. PMID 9804427.
  22. Qian Y.W., Lee E.Y. Dual retinoblastoma-binding proteins with properties related to a negative regulator of ras in yeast (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1995. Vol. 270, no. 43. P. 25507—25513. doi:10.1074/jbc.270.43.25507. PMID 7503932.
  23. Nicolas E., Morales V., Magnaghi-Jaulin L., Harel-Bellan A., Richard-Foy H., Trouche D. RbAp48 belongs to the histone deacetylase complex that associates with the retinoblastoma protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. Vol. 275, no. 13. P. 9797—9804. doi:10.1074/jbc.275.13.9797. PMID 10734134.
  24. Zhang Y., Sun Z.W., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex (англ.) // Mol. Cell : journal. — 1998. Vol. 1, no. 7. P. 1021—1031. doi:10.1016/S1097-2765(00)80102-1. PMID 9651585.
  25. Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1) (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. Vol. 22, no. 3. P. 835—848. doi:10.1128/MCB.22.3.835-848.2002. PMID 11784859.

Литература

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.