POEM@Home
POEM@Home — проект добровольных вычислений, построенный на платформе BOINC. Запущен Технологическим институтом Карлсруэ. Основной целью проекта является моделирование сворачивания белков, базирующееся на догме Анфинсена, с использованием пакета SIMONA (англ. SImulation of MOlecular and NAnoscale systems)[1] с открытым исходным кодом. По состоянию на 15 декабря 2013 года в нём приняли участие 43 516 пользователей (117 821 компьютеров) из 168 стран, обеспечивая интегральную производительность в 648 терафлопс[2]. В проекте имеются расчетные модули с поддержкой технологии OpenCL, позволяющие запуск соответствующих задач фолдинга с использованием GPU.
| POEM@Home | |
|---|---|
| Платформа | BOINC |
| Объём загружаемого ПО | 3.7 МБ |
| Объём загружаемых данных задания | 80 КБ |
| Объём отправляемых данных задания | 70 КБ |
| Объём места на диске | 3 МБ |
| Используемый объём памяти | 100 МБ |
| Графический интерфейс | нет |
| Среднее время расчёта задания | 4 часа |
| Deadline | 7 дней |
| Возможность использования GPU | да |
Научные цели
Целью проекта является изучение того, как структура белка определяет функцию белка, предсказать структуру белка своей аминокислотой последовательности, исследовать, как белки взаимодействуют друг с другом, и понять, как белки могут привести к функциональным нарушениям. Полученные знания могут быть использованы в разработке различных методов лечения.