Фактор некроза опухоли

Фактор некроза опухоли
Фактор некроза опухоли
	; PDB rendering based on 1TNF.
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1A8M, 1TNF, 2AZ5, 2E7A, 2TUN, 2ZJC, 2ZPX, 3ALQ, 3IT8, 3L9J, 3WD5, 4G3Y, 4TSV, 4TWT, 5TSW
Идентификаторы
Символ	TNF ; DIF; TNF-alpha; TNFA; TNFSF2
Внешние ID	OMIM: 191160 MGI: 104798 HomoloGene: 496 ChEMBL: 1825 GeneCards: TNF Gene
Генная онтология
Генная онтология
Функция	• protease binding; • cytokine activity; • tumor necrosis factor receptor binding; • protein binding; • identical protein binding; • transcription regulatory region DNA binding;
Компонент клетки	• phagocytic cup; • extracellular region; • extracellular space; • plasma membrane; • integral component of plasma membrane; • external side of plasma membrane; • cell surface; • membrane raft; • recycling endosome;
Биологический процесс	• protein import into nucleus, translocation; • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • MAPK cascade; • activation of MAPKKK activity; • activation of MAPK activity; • positive regulation of cytokine production; • positive regulation of protein phosphorylation; • chronic inflammatory response to antigenic stimulus; • negative regulation of cytokine secretion involved in immune response; • positive regulation of chronic inflammatory response to antigenic stimulus; • positive regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin; • glucose metabolic process; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • transformed cell apoptotic process; • inflammatory response; • humoral immune response; • cell surface receptor signaling pathway; • JNK cascade; • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • response to virus; • response to salt stress; • positive regulation of gene expression; • negative regulation of gene expression; • negative regulation of alkaline phosphatase activity; • negative regulation of lipid storage; • extracellular matrix organization; • osteoclast differentiation; • sequestering of triglyceride; • positive regulation of protein complex assembly; • positive regulation of fever generation; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • negative regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of chemokine production; • positive regulation of interferon-gamma production; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of interleukin-8 production; • receptor biosynthetic process; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion; • positive regulation of NF-kappaB import into nucleus; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of programmed cell death; • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • negative regulation of protein complex disassembly; • positive regulation of protein complex disassembly; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of MAP kinase activity; • protein kinase B signaling; • positive regulation of JUN kinase activity; • negative regulation of growth of symbiont in host; • negative regulation of viral genome replication; • positive regulation of chemokine biosynthetic process; • positive regulation of interleukin-8 biosynthetic process; • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process; • negative regulation of fat cell differentiation; • negative regulation of myoblast differentiation; • negative regulation of osteoblast differentiation; • positive regulation of osteoclast differentiation; • positive regulation of cell adhesion; • positive regulation of protein kinase activity; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • positive regulation of translational initiation by iron; • negative regulation of glucose import; • embryonic digestive tract development; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • positive regulation of cytokine secretion; • positive regulation of phagocytosis; • regulation of insulin secretion; • defense response to Gram-positive bacterium; • leukocyte tethering or rolling; • negative regulation of lipid catabolic process; • regulation of immunoglobulin secretion; • positive regulation of membrane protein ectodomain proteolysis; • positive regulation of sequence-specific DNA binding transcription factor activity; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of protein transport; • response to glucocorticoid; • positive regulation of NFAT protein import into nucleus; • positive regulation of hair follicle development; • positive regulation of protein kinase B signaling; • positive regulation of vitamin D biosynthetic process; • positive regulation of calcidiol 1-monooxygenase activity; • epithelial cell proliferation involved in salivary gland morphogenesis; • regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis; • negative regulation of branching involved in lung morphogenesis; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • cellular response to amino acid stimulus; • cellular response to nicotine; • cellular response to organic cyclic compound; • death-inducing signaling complex assembly; • positive regulation of mononuclear cell migration; • positive regulation of podosome assembly; • extrinsic apoptotic signaling pathway; • necroptotic signaling pathway; • positive regulation of protein localization to cell surface; • positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Фа́ктор некро́за о́пухоли (ФНО, фактор некроза опухоли-альфа, тумор-некротический фактор (ТНФ)[1][2][3][4], кахексин, кахектин) — внеклеточный белок, многофункциональный провоспалительный цитокин, синтезирующийся в основном моноцитами и макрофагами. Влияет на липидный метаболизм, коагуляцию, устойчивость к инсулину, функционирование эндотелия, стимулирует продукцию ИЛ-1, ИЛ-6, ИЛ-8, интерферона-гамма, активирует лейкоциты, один из важных факторов защиты от внутриклеточных паразитов и вирусов. Впервые был обнаружен в сыворотке мышей, которым были введены БЦЖ и эндотоксин. Сыворотка из таких мышей обладала цитотоксическим и цитостатическим действием на некоторые трансформированные клеточные линии, а также вызывала геморрагический некроз и уменьшение привитых опухолей у мышей. Активирует ядерный транскрипционный фактор NF-κB. Избыточная продукция ФНО вызывает расстройства гемодинамики (снижает сократимость миокарда, минутный объем крови, диффузно увеличивает проницаемость капилляров), цитотоксический эффект на клетки организма. Нарушения регуляции ФНО у человека ассоциированы с различными заболеваниями, такими как болезнь Альцгеймера[5], рак[6], клиническая депрессия[7], псориаз[8] и воспалительные заболевания кишечника (болезнь Крона, язвенный колит)[9].

Терминология

Происхождение термина связано с тем, что in vitro ФНО вызывает некроз некоторых опухолей. В современной терминологии фактором некроза опухоли называют белок, ранее называвшийся «фактор некроза опухоли-альфа» (ФНО-α). Впрочем, до сих пор иногда используется старый термин ФНО-альфа, хотя ФНО и ФНО-альфа означают один и тот же белок. ФНО является прототипом для целого суперсемейства, которое включает 18 различных белков, служащих лигандами для 29 рецепторов. Один из членов этого суперсемейства, лимфотоксин-альфа, ранее назывался ФНО-бета (ФНО-β).

Структура

ФНО синтезируется как мембранный белок с молекулярной массой 26 кДа (233 аминокислоты). После действия специфической металлопротеазы, т. н. ФНО-конвертирующего фермента (ADAM17), мембрано-связывающий фрагмент отщепляется и образуется растворимый ФНО с молекулярной массой 17 кДа (157 аминокислот). Активной формой белка является гомотример, теряющий активность при диссоциации субъединиц, так как только тример способен связываться с рецептором и олигомеризовать его, что необходимо для запуска сигнального пути. Молекула цитокина образует бета-складчатую структуру.

Генетические варианты

Ген человеческого ФНО-α (TNF-α) был клонирован в 1985 году[10]. Ген картирован на хромосоме 6p21.3, имеет размер 2762 п.н. и содержит 4 экзона. Последний экзон более, чем на 80 % кодирует белок[11]. Известны более 30 полиморфных вариантов гена (микросателлиты, SNP-полиморфизмы), но только около половины из них влияют на экспрессию ФНО-α in vitro[12].

Терапевтическое значение

Антагонисты TNF (в частности, этанерцепт, инфликсимаб, адалимумаб) широко используются в качестве средств для лечения ревматоидного артрита, болезни Крона, псориаза и некоторых других аутоиммунных заболеваний. Несмотря на риск развития инфекций и злокачественных новообразований, требующий от врача тщательной оценки возможных последствий, антагонисты TNF в 2014 году составляли, например, половину мирового рынка антипсориатических лекарств[13].

См. также

Литература

Verstrepen L., Bekaert T., Chau T.L., Tavernier J., Chariot A., Beyaert R. TLR-4, IL-1R and TNF-R signaling to NF-kappaB: variations on a common theme (англ.) // Cell. Mol. Life Sci. : journal. — 2008. — June. — doi:10.1007/s00018-008-8064-8. — PMID 18535784.
Bradley J.R. TNF-mediated inflammatory disease (англ.) // J. Pathol. : journal. — 2008. — January (vol. 214, no. 2). — P. 149—160. — doi:10.1002/path.2287. — PMID 18161752.

Примечания

Сбойчаков В. Б. Тумор некротический фактор / Микробиология с основами эпидемиологии и методами микробиологических исследований // СПб.: СпецЛит, 2017. — 608 с. ISBN 978-5-299-00404-5.
ТНФ — тумор-некротический фактор / Эндокринология. Под ред. Боднара П. Н. Изд. 2-е, перераб. и доп. // Винница: Нова Книга, 2015. — 496 с., ил. ISBN 978-966-382-560-1. С. 419.
Мотавкин П. А., Гельцер Б. И. Клиническая и экспериментальная патофизиология лёгких // М.: Наука, 1998. — 365 с. ISBN 978-502-004-451-7. С. 69.
Тумор-некротический фактор (ТНФ) / Российский физиологический журнал имени И. М. Сеченова. РАН: Отделение физиологии, Физиологическое общество им. И. П. Павлова // М.: Наука, 2001, № 3. Том 87, выпуски 1-6. С. 353.
Swardfager W., Lanctôt K., Rothenburg L., Wong A., Cappell J., Herrmann N. A meta-analysis of cytokines in Alzheimer's disease (англ.) // Biol Psychiatry : journal. — 2010. — Vol. 68, no. 10. — P. 930—941. — doi:10.1016/j.biopsych.2010.06.012. — PMID 20692646.
Locksley R.M., Killeen N., Lenardo M.J. The TNF and TNF receptor superfamilies: integrating mammalian biology (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2001. — Vol. 104, no. 4. — P. 487—501. — doi:10.1016/S0092-8674(01)00237-9. — PMID 11239407.
Dowlati Y., Herrmann N., Swardfager W., Liu H., Sham L., Reim E.K., Lanctôt K.L. A meta-analysis of cytokines in major depression (англ.) // Biol Psychiatry : journal. — 2010. — Vol. 67, no. 5. — P. 446—457. — doi:10.1016/j.biopsych.2009.09.033. — PMID 20015486.
Victor F.C., Gottlieb A.B. TNF-alpha and apoptosis: implications for the pathogenesis and treatment of psoriasis (англ.) // J Drugs Dermatol : journal. — 2002. — Vol. 1, no. 3. — P. 264—275. — PMID 12851985.
Brynskov J., Foegh P., Pedersen G., Ellervik C., Kirkegaard T., Bingham A., Saermark T. Tumour necrosis factor alpha converting enzyme (TACE) activity in the colonic mucosa of patients with inflammatory bowel disease (англ.) // Gut : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 1. — P. 37—43. — doi:10.1136/gut.51.1.37. — PMID 12077089.
Old L.J. Tumor necrosis factor (TNF) (англ.) // Science. — 1985. — Vol. 230, no. 4726. — P. 630—632. — doi:10.1126/science.2413547. — PMID 2413547.
Nedwin G.E., Naylor S.L., Sakaguchi A.Y., Smith D., Jarrett-Nedwin J., Pennica D., Goeddel D.V., Gray P.W. Human lymphotoxin and tumor necrosis factor genes: structure, homology and chromosomal localization (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — 1985. — Vol. 13, no. 17. — P. 6361—6373. — doi:10.1093/nar/13.17.6361. — PMID 2995927.
Bidwell J., Keen L., Gallgher G. Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line database (англ.) // Genes and Immunity. : journal. — 1999. — P. 3—19. — PMID 11197303.
Rizvi S., Chaudhari K., Syed B. A. The psoriasis drugs market // Nature Reviews Drug Discovery. — 2015. — Vol. 14. — P. 745-746. — doi:10.1038/nrd4763.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сбойчаков В. Б. Тумор некротический фактор / Микробиология с основами эпидемиологии и методами микробиологических исследований // СПб.: СпецЛит, 2017. — 608 с. ISBN 978-5-299-00404-5.

[2] ТНФ — тумор-некротический фактор / Эндокринология. Под ред. Боднара П. Н. Изд. 2-е, перераб. и доп. // Винница: Нова Книга, 2015. — 496 с., ил. ISBN 978-966-382-560-1. С. 419.

[3] Мотавкин П. А., Гельцер Б. И. Клиническая и экспериментальная патофизиология лёгких // М.: Наука, 1998. — 365 с. ISBN 978-502-004-451-7. С. 69.

[4] Тумор-некротический фактор (ТНФ) / Российский физиологический журнал имени И. М. Сеченова. РАН: Отделение физиологии, Физиологическое общество им. И. П. Павлова // М.: Наука, 2001, № 3. Том 87, выпуски 1-6. С. 353.

[pmid20692646-5] Swardfager W., Lanctôt K., Rothenburg L., Wong A., Cappell J., Herrmann N. A meta-analysis of cytokines in Alzheimer's disease (англ.) // Biol Psychiatry : journal. — 2010. — Vol. 68, no. 10. — P. 930—941. — doi:10.1016/j.biopsych.2010.06.012. — PMID 20692646.

[pmid11239407-6] Locksley R.M., Killeen N., Lenardo M.J. The TNF and TNF receptor superfamilies: integrating mammalian biology (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2001. — Vol. 104, no. 4. — P. 487—501. — doi:10.1016/S0092-8674(01)00237-9. — PMID 11239407.

[pmid20015486-7] Dowlati Y., Herrmann N., Swardfager W., Liu H., Sham L., Reim E.K., Lanctôt K.L. A meta-analysis of cytokines in major depression (англ.) // Biol Psychiatry : journal. — 2010. — Vol. 67, no. 5. — P. 446—457. — doi:10.1016/j.biopsych.2009.09.033. — PMID 20015486.

[pmid12851985-8] Victor F.C., Gottlieb A.B. TNF-alpha and apoptosis: implications for the pathogenesis and treatment of psoriasis (англ.) // J Drugs Dermatol : journal. — 2002. — Vol. 1, no. 3. — P. 264—275. — PMID 12851985.

[pmid12077089-9] Brynskov J., Foegh P., Pedersen G., Ellervik C., Kirkegaard T., Bingham A., Saermark T. Tumour necrosis factor alpha converting enzyme (TACE) activity in the colonic mucosa of patients with inflammatory bowel disease (англ.) // Gut : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 1. — P. 37—43. — doi:10.1136/gut.51.1.37. — PMID 12077089.

[pmid2413547-10] Old L.J. Tumor necrosis factor (TNF) (англ.) // Science. — 1985. — Vol. 230, no. 4726. — P. 630—632. — doi:10.1126/science.2413547. — PMID 2413547.

[pmid2995927-11] Nedwin G.E., Naylor S.L., Sakaguchi A.Y., Smith D., Jarrett-Nedwin J., Pennica D., Goeddel D.V., Gray P.W. Human lymphotoxin and tumor necrosis factor genes: structure, homology and chromosomal localization (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — 1985. — Vol. 13, no. 17. — P. 6361—6373. — doi:10.1093/nar/13.17.6361. — PMID 2995927.

[bidwell-12] Bidwell J., Keen L., Gallgher G. Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line database (англ.) // Genes and Immunity. : journal. — 1999. — P. 3—19. — PMID 11197303.

[nrdd-13] Rizvi S., Chaudhari K., Syed B. A. The psoriasis drugs market // Nature Reviews Drug Discovery. — 2015. — Vol. 14. — P. 745-746. — doi:10.1038/nrd4763.