SDF-1 (белок)

SDF-1 (англ. Stromal cell-derived factor-1), или CXCL12 (англ. chemokine (C-X-C motif) ligand 12) хемокин подсемейства CXC, который у человека закодирован геном CXCL12. SDF-1 связывается с рецепторами CXCR4 и CXCR7 и играет важную роль в эмбриональном развитии и гематопоэзе[1]. SDF-1 выступает не только в роли хемоаттрактанта: в некоторых случаях он может стимулировать пролиферацию клеток и способствовать их выживанию[2].

SDF-1
Идентификаторы
Символы pre-B cell growth-stimulating factorIRHchemokine (C-X-C motif) ligand 12CXCL12intercrine reduced in hepatomasstromal cell-derived factor 1hIRHC-X-C motif chemokine 12PBSFChemokine CXCL12
Внешние IDs GeneCards:
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Виды Человек Мышь
Entrez

n/a

n/a

Ensembl

n/a

n/a

UniProt

n/a

n/a

RefSeq (мРНК)

n/a

n/a

RefSeq (белок)

n/a

n/a

Локус (UCSC) n/a n/a
Поиск PubMed n/a
Править (человек)

Структура гена и мРНК

Ген CXCL12 человека был впервые клонирован в 1995 году[3]. Ген располагается в длинном плече 10-й хромосомы , имеет размер более 88 000 пар нуклеотидов и содержит 5 экзонов[2].

Альтернативный сплайсинг приводит к синтезу мРНК, которые кодируют несколько изоформ SDF-1: SDF-1α (89 аминокислотных остатков), SDF-1β (93 а. о.), SDF-1γ (119 а. о.), SDF-1δ (140 а. о.), SDF-1ε (90 а. о.) и SDF-1φ (100 а. о.)[2]. Первые три экзона, входящие в состав всех вариантов мРНК одинаковы, поэтому N-концевые участки всех изоформ SDF-1 идентичны.

Распространение

SDF-1 синтезируется многими типами клеток. мРНК, кодирующие SDF-1α и SDF-1β, обнаруживают в сердце, почках, печени, лёгких, поджелудочной железе, плаценте, скелетных мышцах, селезёнке, лимфатических узлах, тимусе, миндалинах и костном мозге, но не в лейкоцитах периферической крови. Кроме того, в отличие от мРНК SDF-1β, мРНК SDF-1α присутствует в головном мозге. мРНК SDF-1α также синтезируется во многих эмбриональных тканях, мРНК SDF-1β встречается в чуть более узком наборе тканей эмбриона с преобладанием в селезёнке. мРНК SDF-1γ в небольших количествах присутствует во многих тканях взрослого организма с преобладанием в сердце. мРНК SDF-1δ, ε и φ детектируют в поджелудочной железе, сердце, печени, почках и некоторых других тканях взрослого организма. мРНК SDF-1δ синтезируется во многих органах эмбриона, в то время как мРНК SDF-1ε и φ присутствует только в почках[2].

Функции

SDF-1 выполняет множество функций как во взрослом организме, так и в ходе эмбрионального развития. В первую очередь, SDF-1 является хемоаттрактантом для клеток, которые имеют его рецепторы на мембране, например для B-лимфоцитов и гемопоэтических стволовых клеток. Клетки стромы костного мозга синтезируют SDF-1, который обеспечивает локализацию гемопоэтических клеток-предшественников в их клеточных нишах и не даёт им раньше времени покинуть костный мозг. В эмбриональном развитии SDF-1 управляет миграцией разных типов клеток и играет важную роль в формировании органов[4].

SDF-1 выступает как ростовой фактор для B-клеток и стимулирует их пролиферацию. Кроме того, SDF-1 может защищать злокачественные В-клетки от апоптоза при хроническом лимфоцитарном лейкозе[5].

Примечания

  1. Rankin S. M. Chemokines and adult bone marrow stem cells // Immunol Lett. — 2012. Т. 145, вып. 1—2. С. 47—54. doi:10.1016/j.imlet.2012.04.009. PMID 22698183.
  2. Yu L., Cecil J., Peng S. B., Schrementi J., Kovacevic S., Paul D., Su E. W., Wang J. Identification and expression of novel isoforms of human stromal cell-derived factor 1 // Gene. — 2006. Т. 7, вып. 374. С. 174—179. PMID 16626895.
  3. Shirozu M., Nakano T., Inazawa J., Tashiro K., Tada H., Shinohara T., Honjo T. Structure and chromosomal localization of the human stromal cell-derived factor 1 (SDF1) gene // Genomics. — 1995. Т. 28, вып. 3. С. 495—500. PMID 7490086.
  4. Lewellis S. W., Knaut H. Attractive guidance: how the chemokine SDF1/CXCL12 guides different cells to different locations // Semin Cell Dev Biol. — 2012. Т. 23, вып. 3. С. 333—340. doi:10.1016/j.semcdb.2012.03.009. PMID 22414535.
  5. Burger J. A., Tsukada N., Burger M., Zvaifler N. J., Dell'Aquila M., Kipps T. J. Blood-derived nurse-like cells protect chronic lymphocytic leukemia B cells from spontaneous apoptosis through stromal cell-derived factor-1 // Blood. — 2000. Т. 96, вып. 8. С. 2655—2663. PMID 11023495. (недоступная ссылка)
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.