POLR2A

Полипептид A РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
Полипептид A РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
	; Представлено на основе PDB 2GHQ.
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2GHQ, 2GHT, 2LTO, 3D9K, 3D9L, 3D9M, 3D9N, 3D9O, 3D9P, 4JXT
Идентификаторы
Символ	POLR2A ; POLR2; POLRA; RPB1; RPBh1; RPO2; RPOL2; RpIILS; hRPB220; hsRPB1
Внешние ID	OMIM: 180660 MGI: 98086 HomoloGene: 721 ChEMBL: 1641353 GeneCards: POLR2A Gene
номер EC	2.7.7.48, 2.7.7.6
Генная онтология
Генная онтология
Функция	• RNA polymerase II activity; • DNA binding; • DNA-directed RNA polymerase activity; • RNA-directed RNA polymerase activity; • protein binding; • ubiquitin protein ligase binding; • poly(A) RNA binding; • metal ion binding;
Компонент клетки	• nucleus; • nucleoplasm; • DNA-directed RNA polymerase II, core complex; • nucleolus;
Биологический процесс	• mRNA splicing, via spliceosome; • transcription, RNA-templated; • DNA repair; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • nucleotide-excision repair; • regulation of transcription, DNA-templated; • transcription from RNA polymerase II promoter; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • RNA splicing; • gene expression; • viral process; • positive regulation of viral transcription;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Субъединица RPB1 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II , также известная как RPB1 , — фермент, кодируемый у человека геном POLR2A .

Функция

Этот ген кодирует большую субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез РНК у эукариот. Продукт этого гена содержит карбоксильный терминальный домен, состоящий из гептапептидных повторов, необходимых для полимеразной активности. Эти повторы содержат сериновые и треониновые остатки, которые в активном состоянии фосфорилируют транскрипцию РНК-полимеразы. Кроме того, эта субъединица, в сочетании с некоторыми другими субъединицами полимеразы, образует ДНК-связывающий домен полимеразы, в котором матричная ДНК транскрибируется в РНК.[1]

Взаимодействия

POLR2A, как было выявлено, взаимодействует с:

BRCA1,[2][3][4][5]
CREBBP,[6]
CTDP1,[3]
CDK8,[6]
GTF2B,[3]
GTF2F1,[6][3]
GTF2H4,[3]
MED21,[6][3][7]
MED26,[8]
PCAF,[6]
POLR2C,[9]
POLR2E,[9]
POLR2H,[9]
POLR2L,[9]
PQBP1,[10]
SMARCA2,[6][11][12]
SMARCA4[11][12][13]
SMARCB1,[6][11][12]
SMYD3,[14]
SND1,[15]
SUPT5H,[16][17]
TAF11,[3]
TBP,[3]
TCEA1,[18][19][20]
TCERG1,[21] and
ZNF74.[22]

Примечания

Entrez Gene: POLR2A polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A, 220kDa (неопр.).
Krum S.A., Miranda G.A., Lin C., Lane T.F. BRCA1 associates with processive RNA polymerase II (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — December (vol. 278, no. 52). — P. 52012—52020. — doi:10.1074/jbc.M308418200. — PMID 14506230.
Scully R., Anderson S.F., Chao D.M., Wei W., Ye L., Young R.A., Livingston D.M., Parvin J.D. BRCA1 is a component of the RNA polymerase II holoenzyme (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — May (vol. 94, no. 11). — P. 5605—5610. — doi:10.1073/pnas.94.11.5605. — PMID 9159119.
Chiba N., Parvin J.D. Redistribution of BRCA1 among four different protein complexes following replication blockage (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — October (vol. 276, no. 42). — P. 38549—38554. — doi:10.1074/jbc.M105227200. — PMID 11504724.
Krum S.A., Womack J.E., Lane T.F. Bovine BRCA1 shows classic responses to genotoxic stress but low in vitro transcriptional activation activity (англ.) // Oncogene : journal. — 2003. — September (vol. 22, no. 38). — P. 6032—6044. — doi:10.1038/sj.onc.1206515. — PMID 12955082.
Cho H., Orphanides G., Sun X., Yang X.J., Ogryzko V., Lees E., Nakatani Y., Reinberg D. A human RNA polymerase II complex containing factors that modify chromatin structure (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1998. — September (vol. 18, no. 9). — P. 5355—5363. — PMID 9710619.
Suñé C., Hayashi T., Liu Y., Lane W.S., Young R.A., Garcia-Blanco M.A. CA150, a nuclear protein associated with the RNA polymerase II holoenzyme, is involved in Tat-activated human immunodeficiency virus type 1 transcription (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1997. — October (vol. 17, no. 10). — P. 6029—6039. — PMID 9315662.
Sato S., Tomomori-Sato C., Parmely T.J., Florens L., Zybailov B., Swanson S.K., Banks C.A., Jin J., Cai Y., Washburn M.P., Conaway J.W., Conaway R.C. A set of consensus mammalian mediator subunits identified by multidimensional protein identification technology (англ.) // Molecular Cell : journal. — 2004. — June (vol. 14, no. 5). — P. 685—691. — doi:10.1016/j.molcel.2004.05.006. — PMID 15175163.
Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.
Humbert S., Saudou F. Toward cell specificity in SCA1 (англ.) // Neuron. — Cell Press, 2002. — May (vol. 34, no. 5). — P. 669—670. — doi:10.1016/s0896-6273(02)00715-8. — PMID 12062012.
Sif S., Saurin A.J., Imbalzano A.N., Kingston R.E. Purification and characterization of mSin3A-containing Brg1 and hBrm chromatin remodeling complexes (англ.) // Genes & Development : journal. — 2001. — March (vol. 15, no. 5). — P. 603—618. — doi:10.1101/gad.872801. — PMID 11238380.
Wang W., Côté J., Xue Y., Zhou S., Khavari P.A., Biggar S.R., Muchardt C., Kalpana G.V., Goff S.P., Yaniv M., Workman J.L., Crabtree G.R. Purification and biochemical heterogeneity of the mammalian SWI-SNF complex (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1996. — October (vol. 15, no. 19). — P. 5370—5382. — PMID 8895581.
Zhao K., Wang W., Rando O.J., Xue Y., Swiderek K., Kuo A., Crabtree G.R. Rapid and phosphoinositol-dependent binding of the SWI/SNF-like BAF complex to chromatin after T lymphocyte receptor signaling (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — November (vol. 95, no. 5). — P. 625—636. — doi:10.1016/s0092-8674(00)81633-5. — PMID 9845365.
Hamamoto R., Furukawa Y., Morita M., Iimura Y., Silva F.P., Li M., Yagyu R., Nakamura Y. SMYD3 encodes a histone methyltransferase involved in the proliferation of cancer cells (англ.) // Nature Cell Biology : journal. — 2004. — August (vol. 6, no. 8). — P. 731—740. — doi:10.1038/ncb1151. — PMID 15235609.
Yang J., Aittomäki S., Pesu M., Carter K., Saarinen J., Kalkkinen N., Kieff E., Silvennoinen O. Identification of p100 as a coactivator for STAT6 that bridges STAT6 with RNA polymerase II (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2002. — September (vol. 21, no. 18). — P. 4950—4958. — doi:10.1093/emboj/cdf463. — PMID 12234934.
Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1999. — September (vol. 19, no. 9). — P. 5960—5968. — PMID 10454543.
Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Ferdous A., Imai T., Hirose S., Sugimoto S., Yano K., Hartzog G.A., Winston F., Buratowski S., Handa H. DSIF, a novel transcription elongation factor that regulates RNA polymerase II processivity, is composed of human Spt4 and Spt5 homologs (англ.) // Genes & Development : journal. — 1998. — February (vol. 12, no. 3). — P. 343—356. — doi:10.1101/gad.12.3.343. — PMID 9450929.
Conaway R.C., Kong S.E., Conaway J.W. TFIIS and GreB: two like-minded transcription elongation factors with sticky fingers (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2003. — August (vol. 114, no. 3). — P. 272—274. — PMID 12914690.
Archambault J., Pan G., Dahmus G.K., Cartier M., Marshall N., Zhang S., Dahmus M.E., Greenblatt J. FCP1, the RAP74-interacting subunit of a human protein phosphatase that dephosphorylates the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase IIO (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1998. — October (vol. 273, no. 42). — P. 27593—27601. — doi:10.1074/jbc.273.42.27593. — PMID 9765293.
Pan G., Aso T., Greenblatt J. Interaction of elongation factors TFIIS and elongin A with a human RNA polymerase II holoenzyme capable of promoter-specific initiation and responsive to transcriptional activators (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — September (vol. 272, no. 39). — P. 24563—24571. — doi:10.1074/jbc.272.39.24563. — PMID 9305922.
Carty S.M., Goldstrohm A.C., Suñé C., Garcia-Blanco M.A., Greenleaf A.L. Protein-interaction modules that organize nuclear function: FF domains of CA150 bind the phosphoCTD of RNA polymerase II (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2000. — August (vol. 97, no. 16). — P. 9015—9020. — doi:10.1073/pnas.160266597. — PMID 10908677.
Grondin B., Côté F., Bazinet M., Vincent M., Aubry M. Direct interaction of the KRAB/Cys2-His2 zinc finger protein ZNF74 with a hyperphosphorylated form of the RNA polymerase II largest subunit (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — October (vol. 272, no. 44). — P. 27877—27885. — doi:10.1074/jbc.272.44.27877. — PMID 9346935.

Литература

Jeang K.T. Tat, Tat-associated kinase, and transcription (англ.) // Journal of Biomedical Science : journal. — 1998. — Vol. 5, no. 1. — P. 24—7. — doi:10.1007/BF02253352. — PMID 9570510.
Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation (англ.) // Current Biology : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 8, no. 13. — P. R447—9. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. — PMID 9651670.
Romano G., Kasten M., De Falco G., Micheli P., Khalili K., Giordano A. Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression (англ.) // Journal of Cellular Biochemistry : journal. — 2000. — Vol. 75, no. 3. — P. 357—368. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. — PMID 10536359.
Szentirmay M.N., Sawadogo M. Spatial organization of RNA polymerase II transcription in the nucleus (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2000. — Vol. 28, no. 10. — P. 2019—2025. — doi:10.1093/nar/28.10.2019. — PMID 10773068.
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.

Ссылки

Побочное следствие от потери гена ТР53 при колоректальном раке подсказало новую стратегию его лечения

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Entrez Gene: POLR2A polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A, 220kDa (неопр.).

[pmid14506230-2] Krum S.A., Miranda G.A., Lin C., Lane T.F. BRCA1 associates with processive RNA polymerase II (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — December (vol. 278, no. 52). — P. 52012—52020. — doi:10.1074/jbc.M308418200. — PMID 14506230.

[pmid9159119-3] Scully R., Anderson S.F., Chao D.M., Wei W., Ye L., Young R.A., Livingston D.M., Parvin J.D. BRCA1 is a component of the RNA polymerase II holoenzyme (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — May (vol. 94, no. 11). — P. 5605—5610. — doi:10.1073/pnas.94.11.5605. — PMID 9159119.

[pmid11504724-4] Chiba N., Parvin J.D. Redistribution of BRCA1 among four different protein complexes following replication blockage (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — October (vol. 276, no. 42). — P. 38549—38554. — doi:10.1074/jbc.M105227200. — PMID 11504724.

[pmid12955082-5] Krum S.A., Womack J.E., Lane T.F. Bovine BRCA1 shows classic responses to genotoxic stress but low in vitro transcriptional activation activity (англ.) // Oncogene : journal. — 2003. — September (vol. 22, no. 38). — P. 6032—6044. — doi:10.1038/sj.onc.1206515. — PMID 12955082.

[pmid9710619-6] Cho H., Orphanides G., Sun X., Yang X.J., Ogryzko V., Lees E., Nakatani Y., Reinberg D. A human RNA polymerase II complex containing factors that modify chromatin structure (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1998. — September (vol. 18, no. 9). — P. 5355—5363. — PMID 9710619.

[pmid9315662-7] Suñé C., Hayashi T., Liu Y., Lane W.S., Young R.A., Garcia-Blanco M.A. CA150, a nuclear protein associated with the RNA polymerase II holoenzyme, is involved in Tat-activated human immunodeficiency virus type 1 transcription (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1997. — October (vol. 17, no. 10). — P. 6029—6039. — PMID 9315662.

[pmid15175163-8] Sato S., Tomomori-Sato C., Parmely T.J., Florens L., Zybailov B., Swanson S.K., Banks C.A., Jin J., Cai Y., Washburn M.P., Conaway J.W., Conaway R.C. A set of consensus mammalian mediator subunits identified by multidimensional protein identification technology (англ.) // Molecular Cell : journal. — 2004. — June (vol. 14, no. 5). — P. 685—691. — doi:10.1016/j.molcel.2004.05.006. — PMID 15175163.

[pmid9201987-9] Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.

[pmid12062018-10] Humbert S., Saudou F. Toward cell specificity in SCA1 (англ.) // Neuron. — Cell Press, 2002. — May (vol. 34, no. 5). — P. 669—670. — doi:10.1016/s0896-6273(02)00715-8. — PMID 12062012.

[pmid11238380-11] Sif S., Saurin A.J., Imbalzano A.N., Kingston R.E. Purification and characterization of mSin3A-containing Brg1 and hBrm chromatin remodeling complexes (англ.) // Genes & Development : journal. — 2001. — March (vol. 15, no. 5). — P. 603—618. — doi:10.1101/gad.872801. — PMID 11238380.

[pmid8895581-12] Wang W., Côté J., Xue Y., Zhou S., Khavari P.A., Biggar S.R., Muchardt C., Kalpana G.V., Goff S.P., Yaniv M., Workman J.L., Crabtree G.R. Purification and biochemical heterogeneity of the mammalian SWI-SNF complex (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1996. — October (vol. 15, no. 19). — P. 5370—5382. — PMID 8895581.

[pmid9845365-13] Zhao K., Wang W., Rando O.J., Xue Y., Swiderek K., Kuo A., Crabtree G.R. Rapid and phosphoinositol-dependent binding of the SWI/SNF-like BAF complex to chromatin after T lymphocyte receptor signaling (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — November (vol. 95, no. 5). — P. 625—636. — doi:10.1016/s0092-8674(00)81633-5. — PMID 9845365.

[pmid15235609-14] Hamamoto R., Furukawa Y., Morita M., Iimura Y., Silva F.P., Li M., Yagyu R., Nakamura Y. SMYD3 encodes a histone methyltransferase involved in the proliferation of cancer cells (англ.) // Nature Cell Biology : journal. — 2004. — August (vol. 6, no. 8). — P. 731—740. — doi:10.1038/ncb1151. — PMID 15235609.

[pmid12234934-15] Yang J., Aittomäki S., Pesu M., Carter K., Saarinen J., Kalkkinen N., Kieff E., Silvennoinen O. Identification of p100 as a coactivator for STAT6 that bridges STAT6 with RNA polymerase II (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2002. — September (vol. 21, no. 18). — P. 4950—4958. — doi:10.1093/emboj/cdf463. — PMID 12234934.

[pmid10454543-16] Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1999. — September (vol. 19, no. 9). — P. 5960—5968. — PMID 10454543.

[pmid9450929-17] Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Ferdous A., Imai T., Hirose S., Sugimoto S., Yano K., Hartzog G.A., Winston F., Buratowski S., Handa H. DSIF, a novel transcription elongation factor that regulates RNA polymerase II processivity, is composed of human Spt4 and Spt5 homologs (англ.) // Genes & Development : journal. — 1998. — February (vol. 12, no. 3). — P. 343—356. — doi:10.1101/gad.12.3.343. — PMID 9450929.

[pmid12914699-18] Conaway R.C., Kong S.E., Conaway J.W. TFIIS and GreB: two like-minded transcription elongation factors with sticky fingers (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2003. — August (vol. 114, no. 3). — P. 272—274. — PMID 12914690.

[pmid9765293-19] Archambault J., Pan G., Dahmus G.K., Cartier M., Marshall N., Zhang S., Dahmus M.E., Greenblatt J. FCP1, the RAP74-interacting subunit of a human protein phosphatase that dephosphorylates the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase IIO (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1998. — October (vol. 273, no. 42). — P. 27593—27601. — doi:10.1074/jbc.273.42.27593. — PMID 9765293.

[pmid9305922-20] Pan G., Aso T., Greenblatt J. Interaction of elongation factors TFIIS and elongin A with a human RNA polymerase II holoenzyme capable of promoter-specific initiation and responsive to transcriptional activators (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — September (vol. 272, no. 39). — P. 24563—24571. — doi:10.1074/jbc.272.39.24563. — PMID 9305922.

[pmid10908677-21] Carty S.M., Goldstrohm A.C., Suñé C., Garcia-Blanco M.A., Greenleaf A.L. Protein-interaction modules that organize nuclear function: FF domains of CA150 bind the phosphoCTD of RNA polymerase II (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2000. — August (vol. 97, no. 16). — P. 9015—9020. — doi:10.1073/pnas.160266597. — PMID 10908677.

[pmid9346935-22] Grondin B., Côté F., Bazinet M., Vincent M., Aubry M. Direct interaction of the KRAB/Cys2-His2 zinc finger protein ZNF74 with a hyperphosphorylated form of the RNA polymerase II largest subunit (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — October (vol. 272, no. 44). — P. 27877—27885. — doi:10.1074/jbc.272.44.27877. — PMID 9346935.