TCF4

TCF4
TCF4
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2KWF
Идентификаторы
Символы	TCF4, E2-2, ITF-2, ITF2, PTHS, SEF-2, SEF2, SEF2-1, SEF2-1A, SEF2-1B, SEF2-1D, TCF-4, bHLHb19, FECD3, transcription factor 4, CDG2T
Внешние IDs	OMIM: 602272 MGI: 98506 HomoloGene: 2407 GeneCards: 6925
Связанные наследственные заболевания
Название болезнии	Ссылки
Генная онтология
Генная онтология
Функции	• protein dimerization activity; • гомодимеризация белка; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • bHLH transcription factor binding; • E-box binding; • protein C-terminus binding; • GO:0001948 связывание с белками плазмы; • связывание похожих белков; • TFIIB-class transcription factor binding; • protein heterodimerization activity; • ДНК-связывающий; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Компонент клетки	• transcription regulator complex; • клеточное ядро; • beta-catenin-TCF complex; • beta-catenin-TCF7L2 complex;
Биологический процесс	• Дифференцировка клеток; • ДНК-зависимая регуляция транскрипции; • protein-DNA complex assembly; • транскрипция, ДНК-зависимая; • nervous system development; • ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции; • DNA-templated transcription, initiation; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор; • positive regulation of neuron differentiation;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6925
	21413
	ENSG00000196628
	ENSMUSG00000053477
	P15884
	Q60722
NM_001083962; NM_001243226; NM_001243227; NM_001243228; NM_001243230;
	NM_001243231; NM_001243232; NM_001243233; NM_001243234; NM_001243235; NM_001243236; NM_001306207; NM_001306208; NM_003199; NM_001330604; NM_001330605; NM_001348211; NM_001348212; NM_001348213; NM_001348214; NM_001348215; NM_001348216; NM_001348217; NM_001348218; NM_001348219; NM_001348220; NM_001369572; NM_001369573; NM_001369574; NM_001369575; NM_001369576; NM_001369577; NM_001369578; NM_001369579; NM_001369580; NM_001369581; NM_001369582; NM_001369583; NM_001369584; NM_001369585; NM_001369586; NM_001369567; NM_001369568; NM_001369569; NM_001369570; NM_001369571
NM_001083967; NM_013685; NM_001361126; NM_001361127; NM_001361128;
	NM_001361129
NP_001077431; NP_001230155; NP_001230156; NP_001230157; NP_001230159;
	NP_001230160; NP_001230161; NP_001230162; NP_001230163; NP_001230164; NP_001230165; NP_001293136; NP_001293137; NP_001317533; NP_001317534; NP_003190; NP_001335140; NP_001335141; NP_001335142; NP_001335143; NP_001335144; NP_001335145; NP_001335146; NP_001335147; NP_001335148; NP_001335149; NP_001356501; NP_001356502; NP_001356503; NP_001356504; NP_001356505; NP_001356506; NP_001356507; NP_001356508; NP_001356509; NP_001356510; NP_001356511; NP_001356512; NP_001356513; NP_001356514; NP_001356515; NP_001356496; NP_001356497; NP_001356498; NP_001356499; NP_001356500
NP_001077436; NP_038713; NP_001348055; NP_001348056; NP_001348057;
	NP_001348058
Править (человек)	Править (мышь)

TCF-4 (от англ. Transcription factor 4) или Фактор транскрипции 4, также известный как фактор транскрипции иммуноглобулина 2 (ITF-2), представляет собой белок, который у человека кодируется геном TCF4, расположенным на хромосоме 18q21.2[1].

Функция

Белки TCF4 действуют как факторы транскрипции, которые связываются с мотивом усилителя иммуноглобулина mu-E5/kappa-E2. TCF4 активирует транскрипцию путём связывания с E-боксом (5’-CANNTG-3 ’), обычно обнаруживаемым на SSTR2-INR или инициаторном элементе рецептора 2 соматостатина. TCF4 в первую очередь участвует в неврологическом развитии плода во время беременности, инициируя нейральную дифференцировку путем связывания с ДНК. Он обнаруживается в центральной нервной системе, сомитах и предшественнике гонад на ранних этапах развития. На более поздних этапах развития его находят в щитовидной железе, тимусе и почках, тогда как во взрослом возрасте TCF4 может быть обнаружен в лимфоцитах, мышцах, зрелых нейронах и желудочно-кишечной системе[2][3][4].

Клиническое значение

Мутации в TCF4 вызывают синдром Питта — Хопкинса (PTHS). Эти мутации приводят к тому, что белки TCF4 не связываются должным образом с ДНК и не контролируют дифференцировку нервной системы. В большинстве изученных случаев мутации были de novo, то есть это была новая мутация, не обнаруженная у других членов семьи пациента. Общие симптомы синдрома Питта-Хопкинса включают широкий рот, желудочно-кишечные проблемы, задержку развития мелкой моторики, проблемы с речью и дыханием, эпилепсию и другие дефекты головного мозга[5][6].

Примечания

Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (Feb 1990). “Sequence of the cDNA encoding ITF-2, a positive-acting transcription factor”. Nucleic Acids Research. 18 (3): 678. DOI:10.1093/nar/18.3.678. PMC 333500. PMID 2308860.
de Pontual L, Mathieu Y, Golzio C, Rio M, Malan V, Boddaert N, et al. (Apr 2009). “Mutational, functional, and expression studies of the TCF4 gene in Pitt-Hopkins syndrome”. Human Mutation. 30 (4): 669—76. DOI:10.1002/humu.20935. PMID 19235238.
Pscherer A, Dörflinger U, Kirfel J, Gawlas K, Rüschoff J, Buettner R, Schüle R (Dec 1996). “The helix-loop-helix transcription factor SEF-2 regulates the activity of a novel initiator element in the promoter of the human somatostatin receptor II gene”. The EMBO Journal. 15 (23): 6680—90. DOI:10.1002/j.1460-2075.1996.tb01058.x. PMC 452492. PMID 8978694.
D'Rozario, Mitchell; Zhang, Ting; Waddell, Edward A.; Zhang, Yonggang; Sahin, Cem; Sharoni, Michal; Hu, Tina; Nayal, Mohammad; Kutty, Kaveesh; Liebl, Faith; Hu, Wenhui (2016-04-12). “Type I bHLH Proteins Daughterless and Tcf4 Restrict Neurite Branching and Synapse Formation by Repressing Neurexin in Postmitotic Neurons”. Cell Reports. 15 (2): 386—397. DOI:10.1016/j.celrep.2016.03.034. ISSN 2211-1247. PMC 4946342. PMID 27050508.
Amiel J, Rio M, de Pontual L, Redon R, Malan V, Boddaert N, et al. (May 2007). “Mutations in TCF4, encoding a class I basic helix-loop-helix transcription factor, are responsible for Pitt-Hopkins syndrome, a severe epileptic encephalopathy associated with autonomic dysfunction”. American Journal of Human Genetics. 80 (5): 988—93. DOI:10.1086/515582. PMC 1852736. PMID 17436254.
Zweier C, Peippo MM, Hoyer J, Sousa S, Bottani A, Clayton-Smith J, et al. (May 2007). “Haploinsufficiency of TCF4 causes syndromal mental retardation with intermittent hyperventilation (Pitt-Hopkins syndrome)”. American Journal of Human Genetics. 80 (5): 994—1001. DOI:10.1086/515583. PMC 1852727. PMID 17436255.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[pmid2308860-1] Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (Feb 1990). “Sequence of the cDNA encoding ITF-2, a positive-acting transcription factor”. Nucleic Acids Research. 18 (3): 678. DOI:10.1093/nar/18.3.678. PMC 333500. PMID 2308860.

[pmid19235238-2] Pontual L, Mathieu Y, Golzio C, Rio M, Malan V, Boddaert N, et al. (Apr 2009). “Mutational, functional, and expression studies of the TCF4 gene in Pitt-Hopkins syndrome”. Human Mutation. 30 (4): 669—76. DOI:10.1002/humu.20935. PMID 19235238.

[pmid8978694-3] Pscherer A, Dörflinger U, Kirfel J, Gawlas K, Rüschoff J, Buettner R, Schüle R (Dec 1996). “The helix-loop-helix transcription factor SEF-2 regulates the activity of a novel initiator element in the promoter of the human somatostatin receptor II gene”. The EMBO Journal. 15 (23): 6680—90. DOI:10.1002/j.1460-2075.1996.tb01058.x. PMC 452492. PMID 8978694.

[4] D'Rozario, Mitchell; Zhang, Ting; Waddell, Edward A.; Zhang, Yonggang; Sahin, Cem; Sharoni, Michal; Hu, Tina; Nayal, Mohammad; Kutty, Kaveesh; Liebl, Faith; Hu, Wenhui (2016-04-12). “Type I bHLH Proteins Daughterless and Tcf4 Restrict Neurite Branching and Synapse Formation by Repressing Neurexin in Postmitotic Neurons”. Cell Reports. 15 (2): 386—397. DOI:10.1016/j.celrep.2016.03.034. ISSN 2211-1247. PMC 4946342. PMID 27050508.

[pmid17436254-5] Amiel J, Rio M, de Pontual L, Redon R, Malan V, Boddaert N, et al. (May 2007). “Mutations in TCF4, encoding a class I basic helix-loop-helix transcription factor, are responsible for Pitt-Hopkins syndrome, a severe epileptic encephalopathy associated with autonomic dysfunction”. American Journal of Human Genetics. 80 (5): 988—93. DOI:10.1086/515582. PMC 1852736. PMID 17436254.

[pmid17436255-6] Zweier C, Peippo MM, Hoyer J, Sousa S, Bottani A, Clayton-Smith J, et al. (May 2007). “Haploinsufficiency of TCF4 causes syndromal mental retardation with intermittent hyperventilation (Pitt-Hopkins syndrome)”. American Journal of Human Genetics. 80 (5): 994—1001. DOI:10.1086/515583. PMC 1852727. PMID 17436255.