PHF21A

Пальцевидный белок PHD 21A
Пальцевидный белок PHD 21A
	; Представлено на основе PDB 2PUY.
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2PUY, 2YQL
Идентификаторы
Символ	PHF21A ; BHC80
Внешние ID	OMIM: 608325 HomoloGene: 9597 GeneCards: PHF21A Gene
Генная онтология
Генная онтология
Функция	• DNA binding; • chromatin binding; • zinc ion binding;
Компонент клетки	• histone deacetylase complex; • nucleoplasm;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • suckling behavior; • transcription, DNA-templated; • regulation of transcription, DNA-templated; • blood coagulation; • chromatin modification;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Пальцевидный белок PHD 21A — белок, кодируемый у человека геном PHF21A .[1][2][3]

Функция

PHF21A является составной частью BRAF35 (MIM 605535)/гистондеацетилазы (HDAC, см MIM 601241) комплекса (BHC), являясь посредником репрессии нейроноспецифических генов посредством цис-регуляторных элементов, известный как репрессорный элемент 1 (RE1) или нейронный ограничительный сайленсер (NRS) (Hakimi и др., 2002).[3]

Взаимодействия

PHF21A, как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания

Nagase T., Kikuno R., Hattori A., Kondo Y., Okumura K., Ohara O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro (англ.) // DNA Research : journal. — 2000. — February (vol. 7, no. 6). — P. 347—355. — doi:10.1093/dnares/7.6.347. — PMID 11214970.
Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — May (vol. 99, no. 11). — P. 7420—7425. — doi:10.1073/pnas.112008599. — PMID 12032298.
Entrez Gene: PHF21A PHD finger protein 21A (неопр.).
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2004. — September (vol. 322, no. 2). — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.
Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — February (vol. 278, no. 9). — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.

Литература

Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 9. — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2004. — Vol. 322, no. 2. — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.
Shi Y.J., Matson C., Lan F., Iwase S., Baba T., Shi Y. Regulation of LSD1 histone demethylase activity by its associated factors (англ.) // Molecular Cell : journal. — 2005. — Vol. 19, no. 6. — P. 857—864. — doi:10.1016/j.molcel.2005.08.027. — PMID 16140033.
Rual J.F., Venkatesan K., Hao T., Hirozane-Kishikawa T., Dricot A., Li N., Berriz G.F., Gibbons F.D., Dreze M., Ayivi-Guedehoussou N., Klitgord N., Simon C., Boxem M., Milstein S., Rosenberg J., Goldberg D.S., Zhang L.V., Wong S.L., Franklin G., Li S., Albala J.S., Lim J., Fraughton C., Llamosas E., Cevik S., Bex C., Lamesch P., Sikorski R.S., Vandenhaute J., Zoghbi H.Y., Smolyar A., Bosak S., Sequerra R., Doucette-Stamm L., Cusick M.E., Hill D.E., Roth F.P., Vidal M. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
Hailesellasse Sene K., Porter C.J., Palidwor G., Perez-Iratxeta C., Muro E.M., Campbell P.A., Rudnicki M.A., Andrade-Navarro M.A. Gene function in early mouse embryonic stem cell differentiation (англ.) // BMC Genomics : journal. — 2007. — Vol. 8. — P. 85. — doi:10.1186/1471-2164-8-85. — PMID 17394647.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[pmid11214970-1] Nagase T., Kikuno R., Hattori A., Kondo Y., Okumura K., Ohara O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro (англ.) // DNA Research : journal. — 2000. — February (vol. 7, no. 6). — P. 347—355. — doi:10.1093/dnares/7.6.347. — PMID 11214970.

[pmid12032298-2] Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — May (vol. 99, no. 11). — P. 7420—7425. — doi:10.1073/pnas.112008599. — PMID 12032298.

[entrez-3] Entrez Gene: PHF21A PHD finger protein 21A (неопр.).

[pmid15325272-4] Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2004. — September (vol. 322, no. 2). — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.

[pmid12493763-5] Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — February (vol. 278, no. 9). — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.