RCOR1

Корепрессор REST 1
Корепрессор REST 1
	; PDB представлено на примере 2iw5.
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2IW5, 2UXN, 2UXX, 2V1D, 2X0L, 2XAF, 2XAG, 2XAH, 2XAJ, 2XAQ, 2XAS, 2Y48, 3ZMS, 3ZMT, 3ZMU, 3ZMV, 3ZMZ, 3ZN0, 3ZN1, 4BAY, 4KUM
Идентификаторы
Символ	RCOR1 ; COREST; RCOR
Внешние ID	OMIM: 607675 MGI: 106340 HomoloGene: 32246 GeneCards: RCOR1 Gene
Генная онтология
Генная онтология
Функция	• RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding transcription factor activity involved in negative regulation of transcription; • chromatin binding; • protein binding; • transcription regulatory region DNA binding;
Компонент клетки	• nucleus; • nucleoplasm; • nucleolus; • transcriptional repressor complex;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • transcription, DNA-templated; • blood coagulation; • viral process; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • histone H4 deacetylation;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи

Корепрессор REST 1, который также известен как CoREST — белок, кодируемый у человека геном RCOR1 .[1][2]

Функция

Этот ген кодирует белок, который хорошо сохраняется, подавляется при рождении и со специфической ролью в определении дифференциации нервных клеток. Кодируемый белок связывается с С-концевым доменом REST (репрессор транскрипционного фактора сайленсинга элемента 1 (англ. repressor element-1 silencing transcription factor).[2]

Взаимодействия

RCOR1,как было выявлено, взаимодействует с:

HDAC1,[3][4]
HDAC2,[3][4]
HMG20B,[3]
REST (биология)[5] и
PHF21A.[3][6]

Примечания

Andrés M.E., Burger C., Peral-Rubio M.J., Battaglioli E., Anderson M.E., Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: a functional corepressor required for regulation of neural-specific gene expression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — September (vol. 96, no. 17). — P. 9873—9878. — doi:10.1073/pnas.96.17.9873. — PMID 10449787.
Entrez Gene: RCOR1 REST corepressor 1 (неопр.).
Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — May (vol. 99, no. 11). — P. 7420—7425. — doi:10.1073/pnas.112008599. — PMID 12032298.
You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. CoREST is an integral component of the CoREST- human histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — February (vol. 98, no. 4). — P. 1454—1458. — doi:10.1073/pnas.98.4.1454. — PMID 11171972.
Andrés M.E., Burger C., Peral-Rubio M.J., Battaglioli E., Anderson M.E., Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: a functional corepressor required for regulation of neural-specific gene expression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — August (vol. 96, no. 17). — P. 9873—9878. — doi:10.1073/pnas.96.17.9873. — PMID 10449787.
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2004. — September (vol. 322, no. 2). — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.

Литература

Nomura N., Nagase T., Miyajima N., Sazuka T., Tanaka A., Sato S., Seki N., Kawarabayasi Y., Ishikawa K., Tabata S. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. II. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0041-KIAA0080) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1 (англ.) // DNA Research : journal. — 1994. — Vol. 1, no. 5. — P. 223—229. — doi:10.1093/dnares/1.5.223. — PMID 7584044.
Andersson B., Wentland M.A., Ricafrente J.Y., Liu W., Gibbs R.A. A "double adaptor" method for improved shotgun library construction (англ.) // Analytical Biochemistry : journal. — 1996. — Vol. 236, no. 1. — P. 107—113. — doi:10.1006/abio.1996.0138. — PMID 8619474.
Yu W., Andersson B., Worley K.C., Muzny D.M., Ding Y., Liu W., Ricafrente J.Y., Wentland M.A., Lennon G., Gibbs R.A. Large-scale concatenation cDNA sequencing (англ.) // Genome Research : journal. — 1997. — Vol. 7, no. 4. — P. 353—358. — doi:10.1101/gr.7.4.353. — PMID 9110174.
Grimes J.A., Nielsen S.J., Battaglioli E., Miska E.A., Speh J.C., Berry D.L., Atouf F., Holdener B.C., Mandel G., Kouzarides T. The co-repressor mSin3A is a functional component of the REST-CoREST repressor complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 13. — P. 9461—9467. — doi:10.1074/jbc.275.13.9461. — PMID 10734093.
Hartley J.L., Temple G.F., Brasch M.A. DNA cloning using in vitro site-specific recombination (англ.) // Genome Research : journal. — 2000. — Vol. 10, no. 11. — P. 1788—1795. — doi:10.1101/gr.143000. — PMID 11076863.
Humphrey G.W., Wang Y., Russanova V.R., Hirai T., Qin J., Nakatani Y., Howard B.H. Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 9. — P. 6817—6824. — doi:10.1074/jbc.M007372200. — PMID 11102443.
You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. CoREST is an integral component of the CoREST- human histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 98, no. 4. — P. 1454—1458. — doi:10.1073/pnas.98.4.1454. — PMID 11171972.
Ballas N., Battaglioli E., Atouf F., Andres M.E., Chenoweth J., Anderson M.E., Burger C., Moniwa M., Davie J.R., Bowers W.J., Federoff H.J., Rose D.W., Rosenfeld M.G., Brehm P., Mandel G. Regulation of neuronal traits by a novel transcriptional complex (англ.) // Neuron : journal. — Cell Press, 2001. — Vol. 31, no. 3. — P. 353—365. — doi:10.1016/S0896-6273(01)00371-3. — PMID 11516394.
Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 11. — P. 7420—7425. — doi:10.1073/pnas.112008599. — PMID 12032298.
Battaglioli E., Andrés M.E., Rose D.W., Chenoweth J.G., Rosenfeld M.G., Anderson M.E., Mandel G. REST repression of neuronal genes requires components of the hSWI.SNF complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 43. — P. 41038—41045. — doi:10.1074/jbc.M205691200. — PMID 12192000.
Lunyak V.V., Burgess R., Prefontaine G.G., Nelson C., Sze S.H., Chenoweth J., Schwartz P., Pevzner P.A., Glass C., Mandel G., Rosenfeld M.G. Corepressor-dependent silencing of chromosomal regions encoding neuronal genes (англ.) // Science : journal. — 2002. — Vol. 298, no. 5599. — P. 1747—1752. — doi:10.1126/science.1076469. — PMID 12399542.
Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 9. — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2004. — Vol. 322, no. 2. — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.
Gu H., Liang Y., Mandel G., Roizman B. Components of the REST/CoREST/histone deacetylase repressor complex are disrupted, modified, and translocated in HSV-1-infected cells (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2005. — Vol. 102, no. 21. — P. 7571—7576. — doi:10.1073/pnas.0502658102. — PMID 15897453.
Lee M.G., Wynder C., Cooch N., Shiekhattar R. An essential role for CoREST in nucleosomal histone 3 lysine 4 demethylation (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7057. — P. 432—435. — doi:10.1038/nature04021. — PMID 16079794.
Shi Y.J., Matson C., Lan F., Iwase S., Baba T., Shi Y. Regulation of LSD1 histone demethylase activity by its associated factors (англ.) // Molecular Cell : journal. — 2005. — Vol. 19, no. 6. — P. 857—864. — doi:10.1016/j.molcel.2005.08.027. — PMID 16140033.
Nousiainen M., Silljé H.H., Sauer G., Nigg E.A., Körner R. Phosphoproteome analysis of the human mitotic spindle (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2006. — Vol. 103, no. 14. — P. 5391—5396. — doi:10.1073/pnas.0507066103. — PMID 16565220.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[pmid10449787-1] Andrés M.E., Burger C., Peral-Rubio M.J., Battaglioli E., Anderson M.E., Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: a functional corepressor required for regulation of neural-specific gene expression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — September (vol. 96, no. 17). — P. 9873—9878. — doi:10.1073/pnas.96.17.9873. — PMID 10449787.

[entrez-2] Entrez Gene: RCOR1 REST corepressor 1 (неопр.).

[pmid12032298-3] Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — May (vol. 99, no. 11). — P. 7420—7425. — doi:10.1073/pnas.112008599. — PMID 12032298.

[pmid11171972-4] You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. CoREST is an integral component of the CoREST- human histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — February (vol. 98, no. 4). — P. 1454—1458. — doi:10.1073/pnas.98.4.1454. — PMID 11171972.

[autogenerated1-5] Andrés M.E., Burger C., Peral-Rubio M.J., Battaglioli E., Anderson M.E., Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: a functional corepressor required for regulation of neural-specific gene expression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — August (vol. 96, no. 17). — P. 9873—9878. — doi:10.1073/pnas.96.17.9873. — PMID 10449787.

[pmid15325272-6] Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2004. — September (vol. 322, no. 2). — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.