HMG20B

SWI/SNF-связанный, матрично-ассоциированный актинозависимый регулятор хроматина, 1-зависимый член подсемейства E  — белок, кодируемый у человека геном HMG20B[1][2].

Высокомобильная группа 20B

PDB представлено на основе 2crj.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволHMG20B ; BRAF25; BRAF35; HMGX2; HMGXB2; PP7706; SMARCE1r; SOXL; pp8857
Внешние IDOMIM: 605535 MGI: 1341190 HomoloGene: 74949 GeneCards: HMG20B Gene
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez1036215353
EnsemblENSG00000064961ENSMUSG00000020232
UniProtQ9P0W2Q9Z104
RefSeq (мРНК)NM_006339NM_001163165
RefSeq (белок)NP_006330NP_001156637
Локус (UCSC)Chr 19:
3.57 – 3.58 Mb
Chr 10:
81.35 – 81.35 Mb
Поиск в PubMed

Взаимодействия

HMG20B, как было выявлено, взаимодействует с KIF4A[3], HDAC1[4], гистондеацетилазой 2[4][5], PHF21A[4][6], RCOR1[4] и BRCA2[4][7].

Примечания

  1. Sumoy L., Carim L., Escarceller M., Nadal M., Gratacos M., Pujana M.A., Estivill X., Peral B. HMG20A and HMG20B map to human chromosomes 15q24 and 19p13.3 and constitute a distinct class of HMG-box genes with ubiquitous expression (англ.) // Cytogenetics and Genome Research : journal. — 2000. — June (vol. 88, no. 1—2). P. 62—7. doi:10.1159/000015486. PMID 10773667.
  2. Entrez Gene: HMG20B high-mobility group 20B.
  3. Lee, Young Mi; Kim Wankee. Association of human kinesin superfamily protein member 4 with BRCA2-associated factor 35 (англ.) // Biochemical Journal : journal. — England, 2003. — September (vol. 374, no. Pt 2). P. 497—503. doi:10.1042/BJ20030452. PMID 12809554.
  4. Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Chenoweth Josh; Lane William S; Mandel Gail; Shiekhattar Ramin. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — United States, 2002. — May (vol. 99, no. 11). P. 7420—7425. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.112008599. PMID 12032298.
  5. Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2003. — February (vol. 278, no. 9). P. 7234—7239. ISSN 0021-9258. doi:10.1074/jbc.M208992200. PMID 12493763.
  6. Iwase, Shigeki; Januma Aya; Miyamoto Kiyoko; Shono Naomi; Honda Arata; Yanagisawa Junn; Baba Tadashi. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — United States, 2004. — September (vol. 322, no. 2). P. 601—608. ISSN 0006-291X. doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.
  7. Marmorstein, L Y; Kinev A V; Chan G K; Bochar D A; Beniya H; Epstein J A; Yen T J; Shiekhattar R. A human BRCA2 complex containing a structural DNA binding component influences cell cycle progression (англ.) // Cell : journal. — United States: Cell Press, 2001. — January (vol. 104, no. 2). P. 247—257. ISSN 0092-8674. doi:10.1016/S0092-8674(01)00209-4. PMID 11207365.

Литература

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.