DDX17

Геликаза 17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) бокса
Геликаза 17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) бокса
Идентификаторы
Символ	DDX17 ; P72; RH70
Внешние ID	OMIM: 608469 MGI: 1914290 HomoloGene: 101101 GeneCards: DDX17 Gene
номер EC	3.6.4.13
Генная онтология
Генная онтология
Функция	• transcription coactivator activity; • RNA binding; • RNA helicase activity; • protein binding; • ATP binding; • ATP-dependent helicase activity; • RNA-dependent ATPase activity; • estrogen receptor binding; • poly(A) RNA binding;
Компонент клетки	• nucleus; • nucleolus; • membrane;
Биологический процесс	• ATP catabolic process; • transcription, DNA-templated; • RNA processing; • positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • regulation of skeletal muscle cell differentiation;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Предполагаемая АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX17 (р72) — фермент, кодируемый у человека геном DDX17[1][2].

Функция

Белки DEAD бокса, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), и предположительно являются РНК геликазами. Они участвуют во многих клеточных процессах, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, сборка рибосом и сплайсосомы. Основываясь на характере их распространения, предполагаю, что некоторые члены этого семейства участвует в эмбриогенезе, сперматогенезе а также клеточном росте и делении. Этот ген (DDX17) кодирует белок DEAD бокса, который АТФазой, активируемой с помощью различных видов РНК, но не двухцепочечной ДНК. Этот белок и тот, что кодирован геном DDX5 состоят друг с другом в более тесном родстве, чем с любым другим членом семейства DEAD бокса. Альтернативный сплайсинг этого гена даёт два варианта транскриптов, кодирующих различные изоформ белка, при этом, сообщается, что более длинный транскрипт способен инициировать трансляцию с CUG кодона, а не с AUG, как прочие белки[2].

Взаимодействия

DDX17, как было выявлено, взаимодействует с:

DDX5,[3]
DHX9,[4]
NR3A1,[5]
HDAC1,[6]
NCOA1,[5]
NCOA2,[5]
NCOA3,[5] и
SRA1.[5]

Примечания

Lamm G. M., Nicol S. M., Fuller-Pace F. V., Lamond A. I. p72: a human nuclear DEAD box protein highly related to p68. (англ.) // Nucleic acids research. — 1996. — Vol. 24, no. 19. — P. 3739—3747. — PMID 8871553.
Entrez Gene: DDX17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 17 (неопр.).
Ogilvie V. C., Wilson B. J., Nicol S. M., Morrice N. A., Saunders L. R., Barber G. N., Fuller-Pace F. V. The highly related DEAD box RNA helicases p68 and p72 exist as heterodimers in cells. (англ.) // Nucleic acids research. — 2003. — Vol. 31, no. 5. — P. 1470—1480. — PMID 12595555.
Wilson B. J., Giguère V. Identification of novel pathway partners of p68 and p72 RNA helicases through Oncomine meta-analysis. (англ.) // BMC genomics. — 2007. — Vol. 8. — P. 419. — doi:10.1186/1471-2164-8-419. — PMID 18005418.
Watanabe M., Yanagisawa J., Kitagawa H., Takeyama K., Ogawa S., Arao Y., Suzawa M., Kobayashi Y., Yano T., Yoshikawa H., Masuhiro Y., Kato S. A subfamily of RNA-binding DEAD-box proteins acts as an estrogen receptor alpha coactivator through the N-terminal activation domain (AF-1) with an RNA coactivator, SRA. (англ.) // The EMBO journal. — 2001. — Vol. 20, no. 6. — P. 1341—1352. — doi:10.1093/emboj/20.6.1341. — PMID 11250900.
Wilson B. J., Bates G. J., Nicol S. M., Gregory D. J., Perkins N. D., Fuller-Pace F. V. The p68 and p72 DEAD box RNA helicases interact with HDAC1 and repress transcription in a promoter-specific manner. (англ.) // BMC molecular biology. — 2004. — Vol. 5. — P. 11. — doi:10.1186/1471-2199-5-11. — PMID 15298701.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[pmid8871553-1] Lamm G. M., Nicol S. M., Fuller-Pace F. V., Lamond A. I. p72: a human nuclear DEAD box protein highly related to p68. (англ.) // Nucleic acids research. — 1996. — Vol. 24, no. 19. — P. 3739—3747. — PMID 8871553.

[entrez-2] Entrez Gene: DDX17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 17 (неопр.).

[pmid12595555-3] Ogilvie V. C., Wilson B. J., Nicol S. M., Morrice N. A., Saunders L. R., Barber G. N., Fuller-Pace F. V. The highly related DEAD box RNA helicases p68 and p72 exist as heterodimers in cells. (англ.) // Nucleic acids research. — 2003. — Vol. 31, no. 5. — P. 1470—1480. — PMID 12595555.

[pmid18005418-4] Wilson B. J., Giguère V. Identification of novel pathway partners of p68 and p72 RNA helicases through Oncomine meta-analysis. (англ.) // BMC genomics. — 2007. — Vol. 8. — P. 419. — doi:10.1186/1471-2164-8-419. — PMID 18005418.

[pmid11250900-5] Watanabe M., Yanagisawa J., Kitagawa H., Takeyama K., Ogawa S., Arao Y., Suzawa M., Kobayashi Y., Yano T., Yoshikawa H., Masuhiro Y., Kato S. A subfamily of RNA-binding DEAD-box proteins acts as an estrogen receptor alpha coactivator through the N-terminal activation domain (AF-1) with an RNA coactivator, SRA. (англ.) // The EMBO journal. — 2001. — Vol. 20, no. 6. — P. 1341—1352. — doi:10.1093/emboj/20.6.1341. — PMID 11250900.

[pmid15298701-6] Wilson B. J., Bates G. J., Nicol S. M., Gregory D. J., Perkins N. D., Fuller-Pace F. V. The p68 and p72 DEAD box RNA helicases interact with HDAC1 and repress transcription in a promoter-specific manner. (англ.) // BMC molecular biology. — 2004. — Vol. 5. — P. 11. — doi:10.1186/1471-2199-5-11. — PMID 15298701.