Автономно реплицирующаяся последовательность
Автоно́мно реплици́рующаяся после́довательность (англ. autonomously replicating sequence, ARS) — последовательность ДНК генома дрожжей, содержащая точку начала репликации (ori) и отвечающая за инициацию репликации.
Функционирование и структура
Вначале ARS-последовательности были описаны в почкующихся дрожжах Saccharomyces cerevisiae как фрагменты хромосомной ДНК, повышающие частоту трансформации и обеспечивающие стабильность плазмид. Так, содержащие их плазмиды трансформировали дрожжевые клетки с высокой частотой[1]. Впоследствии аналогичные элементы были выявлены у дрожжей Schizosaccharomyces pombe[2].
При дальнейшем изучении оказалось, что ARS содержат точку начала репликации, то есть являются элементами, отвечающими за инициацию репликации — репликаторами. На участке ДНК длиной 5 тыс. н. п. находится три отдельных элемента ARS. Их инициация происходит единожды в каждой S-фазе клеточного цикла, хотя у различных ARS эффективность и время активации (в начале или конце S-фазы) может различаться[3].
У S. cerevisiae длина ARS составляет 100—200 н. п. В ARS входят 2 следующих обязательных элемента: домен А, содержащий консервативную последовательность из 11 н. п. — ACS, которая связывается с комплексом из 6 белков — комплексом узнавания точки начала репликации (англ. Origin recognition complex, ORC), и крупный богатый А—Т-парами домен B, прилегающий к элементу А, однако сходства между их последовательностями нет. Последовательность ACS такова: 5'-T/ATTTAYRTTTT/A-3'
, где Y — пиримидин, а R — пурин. ORC имеет гомологов у других эукариот, например, Drosophila, Xenopus, мыши и человека. У S. cerevisiae к настоящему моменту хорошо изучено связывание факторов инициации с ORC[1].
Следует отметить, что, несмотря на сходство механизмов репликации у эукариот и задействованных в этом белков, их области начала репликации могут обнаруживать серьёзные различия. Например, у дрожжей S. pombe, имеющих много сходств с клетками высших эукариот, ARS гораздо длиннее, чем у S. cerevisiae и содержит 600—1500 н. п., а сходство в их последовательностях ДНК заключается лишь в наличии у обоих А—Т-богатых участков[1].
Установлено, что мутации в домене В уменьшают активность элемента ARS, однако при мутации домена А весь элемент становится полностью неактивным.
Примечания
- VINAY KUMAR SRIVASTAVA, DHARANI DHAR DUBEY. Mapping autonomously replicating sequence elements in a 73-kb region of chromosome II of the fission yeast, Schizosaccharomyces pombe // Journal of Genetics. — 2007. — Т. 86, № 2. — С. 139—148.
- Clyne R. K., Kelly T. J. Identification of autonomously replicating sequence (ARS) elements in eukaryotic cells. // Methods.. — 1997. — Т. 13, № 3. — С. 221—233.
- Коничев, Севастьянова, 2012, с. 230.
Литература
- Коничев А. С., Севастьянова Г. А. Молекулярная биология. — Издательский центр «Академия», 2012. — 400 с. — ISBN 978-5-7695-9147-1.