LIN28A

Lin-28 гомолог A (C. elegans)
Lin-28 гомолог A (C. elegans)
	; PDB rendering based on 2cqf.
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2CQF, 2LI8
Идентификаторы
Символ	LIN28A ; CSDD1; LIN-28; LIN28; ZCCHC1; lin-28A
Внешние ID	OMIM: 611043 MGI: 1890546 HomoloGene: 32592 GeneCards: LIN28A Gene
Генная онтология
Генная онтология
Функция	• DNA binding; • RNA binding; • mRNA binding; • protein binding; • zinc ion binding; • translation initiation factor binding; • miRNA binding;
Компонент клетки	• cytoplasmic mRNA processing body; • nucleus; • nucleolus; • cytoplasm; • cytoplasmic stress granule;
Биологический процесс	• regulation of transcription, DNA-templated; • germ cell development; • miRNA catabolic process; • stem cell maintenance; • pre-miRNA processing; • RNA 3'-end processing; • positive regulation of neuron differentiation; • negative regulation of glial cell differentiation; • positive regulation of translation; • regulation of gene silencing by miRNA;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

LIN28 гомолог A[1] — ген, встречающийся в геномах животных[2]. В геноме человека расположен на первой хромосоме, в локусе 1p36.11[3].

LIN28 кодирует РНК-связывающий белок, содержащий домен холодового шока в N-концевой части и два мотива цинковых пальцев CCHC ретровирусного типа в С-концевом участке[4].

Белок является маркером недифференцированных эмбриональных стволовых клеток человека[5], используется для повышения эффективности получения стволовых клеток из фибробластов[6]. Было показано, что белок LIN28 связывается с предшественником микроРНК Let7 и блокирует образование зрелых микроРНК Let7 в эмбриональных стволовых клетках мыши[7].

Примечания

LIN28A Symbol Report | HUGO Gene Nomenclature Committee (неопр.). www.genenames.org. Дата обращения: 6 августа 2018.
H. R. Horvitz, P. W. Sternberg, I. S. Greenwald, W. Fixsen, H. M. Ellis. Mutations that affect neural cell lineages and cell fates during the development of the nematode Caenorhabditis elegans // Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. — 1983. — Т. 48 Pt 2. — С. 453–463. — ISSN 0091-7451.
LIN28A lin-28 homolog A [Homo sapiens (human) - Gene - NCBI] (англ.). www.ncbi.nlm.nih.gov. Дата обращения: 22 сентября 2018.
Eric G. Moss, Lingjuan Tang. Conservation of the heterochronic regulator Lin-28, its developmental expression and microRNA complementary sites // Developmental Biology. — 2003-06-15. — Т. 258, вып. 2. — С. 432–442. — ISSN 0012-1606.
Mark Richards, Siew-Peng Tan, Jee-Hian Tan, Woon-Khiong Chan, Ariff Bongso. The transcriptome profile of human embryonic stem cells as defined by SAGE // Stem Cells (Dayton, Ohio). — 2004. — Т. 22, вып. 1. — С. 51–64. — ISSN 1066-5099. — doi:10.1634/stemcells.22-1-51.
Junying Yu, Maxim A. Vodyanik, Kim Smuga-Otto, Jessica Antosiewicz-Bourget, Jennifer L. Frane. Induced pluripotent stem cell lines derived from human somatic cells // Science (New York, N.Y.). — 2007-12-21. — Т. 318, вып. 5858. — С. 1917–1920. — ISSN 1095-9203. — doi:10.1126/science.1151526.
Srinivas R. Viswanathan, George Q. Daley, Richard I. Gregory. Selective blockade of microRNA processing by Lin28 // Science (New York, N.Y.). — 2008-04-04. — Т. 320, вып. 5872. — С. 97–100. — ISSN 1095-9203. — doi:10.1126/science.1154040.

Литература

Shyh-Chang N, Daley GQ. (2013) Lin28: primal regulator of growth and metabolism in stem cells. Cell Stem Cell. ;12(4):395-406. doi: 10.1016/j.stem.2013.03.005.
Mayr F, Heinemann U. (2013) Mechanisms of Lin28-mediated miRNA and mRNA regulation--a structural and functional perspective. Int J Mol Sci. 14(8):16532-53. doi: 10.3390/ijms140816532.
Ng Shyh-Chang, Hao Zhu, T. Yvanka de Soysa, Gen Shinoda, Marc T. Seligson, Kaloyan M. Tsanov, Liem Nguyen, John M. Asara, Lewis C. Cantley, George Q. Daley.(2013) Lin28 Enhances Tissue Repair by Reprogramming Cellular Metabolism. Cell,; 155 (4): 778 DOI:10.1016/j.cell.2013.09.059

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] LIN28A Symbol Report | HUGO Gene Nomenclature Committee (неопр.). www.genenames.org. Дата обращения: 6 августа 2018.

[2] H. R. Horvitz, P. W. Sternberg, I. S. Greenwald, W. Fixsen, H. M. Ellis. Mutations that affect neural cell lineages and cell fates during the development of the nematode Caenorhabditis elegans // Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. — 1983. — Т. 48 Pt 2. — С. 453–463. — ISSN 0091-7451.

[3] LIN28A lin-28 homolog A [Homo sapiens (human) - Gene - NCBI] (англ.). www.ncbi.nlm.nih.gov. Дата обращения: 22 сентября 2018.

[4] Eric G. Moss, Lingjuan Tang. Conservation of the heterochronic regulator Lin-28, its developmental expression and microRNA complementary sites // Developmental Biology. — 2003-06-15. — Т. 258, вып. 2. — С. 432–442. — ISSN 0012-1606.

[5] Mark Richards, Siew-Peng Tan, Jee-Hian Tan, Woon-Khiong Chan, Ariff Bongso. The transcriptome profile of human embryonic stem cells as defined by SAGE // Stem Cells (Dayton, Ohio). — 2004. — Т. 22, вып. 1. — С. 51–64. — ISSN 1066-5099. — doi:10.1634/stemcells.22-1-51.

[6] Junying Yu, Maxim A. Vodyanik, Kim Smuga-Otto, Jessica Antosiewicz-Bourget, Jennifer L. Frane. Induced pluripotent stem cell lines derived from human somatic cells // Science (New York, N.Y.). — 2007-12-21. — Т. 318, вып. 5858. — С. 1917–1920. — ISSN 1095-9203. — doi:10.1126/science.1151526.

[7] Srinivas R. Viswanathan, George Q. Daley, Richard I. Gregory. Selective blockade of microRNA processing by Lin28 // Science (New York, N.Y.). — 2008-04-04. — Т. 320, вып. 5872. — С. 97–100. — ISSN 1095-9203. — doi:10.1126/science.1154040.