N-Конец

N-Конец (англ. N-terminus), также амино-конец — аминогруппа первой аминокислоты, с которой начинается молекула белка или пептид[1].

Тетрапептид Val-Gly-Ser-Ala, на котором зелёным цветом отмечен N-конечная α-аминокислота (на изображении: L-валин), а синим — C-конечная α-аминокислота (на изображении: L-аланин). Этот тетрапептид может быть закодирован мРНК-последовательностью 5'-GUUGGUAGUGCU-3'.

Каждая аминокислота имеет аминогруппу и карбоксильную группу. Аминокислоты связываются друг с другом посредством реакции дегидратации присоединением карбоксильной группы одной аминокислоты к аминогруппе другой. Таким образом, полипептидные цепочки заканчиваются свободной карбоксильной группой — C-концом, а начинаются с аминогруппы — N-конца[1].

Методы определения N-концевой аминокислоты

Для определения природы N-концевой аминокислоты предложен ряд методов, в частности метод Сэнджера (F. Sanger), основанный на реакции арилирования полипептида 2,4-динитрофторбензолом (ДНФБ), что приводит к образованию окрашенного в жёлтый цвет 2,4-динитрофенильного производного N-концевой аминокислоты. Раствор полипептида обрабатывают ДНФБ, который взаимодействует со свободной NH2-группой N-концевой аминокислоты пептида.

После кислотного гидролиза продукта реакции — динитрофенилпептида только одна N-концевая аминокислота оказывается связанной с реактивом в виде 2,4-динитрофениламинокислоты (стабильной при гидролизе). В отличие от других образовавшихся при гидролизе полипептида свободных аминокислот она жёлтого цвета. Её идентифицируют методом хроматографии.

Для определения N-концевой аминокислоты значительно более широко применяется фенилтиогидантоиновый метод Эдмана благодаря своей высокой чувствительности и возможности многократного использования в одной и той же пробе. Фенилизотиоцианат реагирует со свободной α-NH2-группой N-концевой аминокислоты полипептида с образованием фенилтиокарбамоилпептида.

Примечания
  1. Нельсон, Кокс, 2011, с. 128.

Литература
  • Дэвид Л. Нельсон, Майкл М. Кокс. Основы биохимии Ленинджера. — Бином, 2011. — Т. 1. — 692 с. — ISBN 978-5-94774-365-4.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.