Dicer

Dicer — рибонуклеаза из семейства РНКазы III (RNase III), которая разрезает двуцепочечные молекулы РНК и пре-микроРНК (pre-miRNA) с получением коротких двуцепочечных РНК-фрагментов, называемых малыми интерферирующими РНК (siRNA) и микроРНК (miRNA) соответственно. Данные фрагменты имеют длину приблизительно 20-25 нуклеотидов, обычно с оверхенгом в 2-3 нуклеотида на 3'-конце[1].

Dicer 1, рибонуклеаза III
Структура РНКазы IIIb и дцРНК-связывающего домена мыши (Dicer).
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB Список идентификаторов PDB 2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA
Идентификаторы
Символ	DICER1 ; DCR1; Dicer; HERNA; MNG1; RMSE2
Внешние ID	OMIM: 606241 MGI: 2177178 HomoloGene: 13251 GeneCards: DICER1 Gene
номер EC	3.1.26.3
Генная онтология Функция • double-stranded RNA binding • helicase activity • ribonuclease III activity • protein binding • ATP binding • miRNA binding • metal ion binding Компонент клетки • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • cytosol • RISC complex • axon • dendrite • growth cone Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • angiogenesis • post-embryonic development • zygote asymmetric cell division • gene expression • negative regulation of Schwann cell proliferation • positive regulation of Schwann cell differentiation • stem cell maintenance • spinal cord motor neuron differentiation • nerve development • olfactory bulb interneuron differentiation • cerebral cortex development • lung development • production of siRNA involved in RNA interference • targeting of mRNA for destruction involved in RNA interference • pre-miRNA processing • hair follicle morphogenesis • positive regulation of myelination • peripheral nervous system myelin formation • embryonic hindlimb morphogenesis • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • multicellular organism growth • regulation of viral genome replication • regulation of neuron differentiation • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • spleen development • regulation of oligodendrocyte differentiation • branching morphogenesis of an epithelial tube • neuron projection morphogenesis • spindle assembly • defense response to virus • regulation of cell cycle • cardiac muscle cell development • inner ear receptor cell development • intestinal epithelial cell development • regulation of enamel mineralization • hair follicle cell proliferation • RNA phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • positive regulation of miRNA metabolic process Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	23405	192119
Ensembl	ENSG00000100697	ENSMUSG00000041415
UniProt	Q9UPY3	Q8R418
RefSeq (мРНК)	NM_001195573	NM_148948
RefSeq (белок)	NP_001182502	NP_683750
Локус (UCSC)	Chr 14: 95.55 – 95.62 Mb	Chr 12: 104.69 – 104.75 Mb
Поиск в PubMed

Молекула Dicer-подобного белка из Giardia intestinalis. Dicer катализирует разрезание двуцепочечной РНК (dsRNA), при этом образуются малые интерферирующие РНК (siRNA). Домены РНКазы III показаны зеленым цветом, домен PAZ — желтым, домен платформы — красным, соединительная спираль — синим. Расстояние между доменами РНКазы III и PAZ определяется длиной соединительной петли и углом её наклона, что, по-видимому, определяет длину образующихся молекул siRNA[1].

Dicer содержит два домена RNase III и один домен PAZ. Расстояние между этими участками в молекуле определяется длиной и углом соединяющей петли и определяет длину образующейся siRNA. Dicer катализирует первую стадию в процессе РНК-интерференции и инициирует образование RISC (RNA-induced silencing complex), каталитический компонент которого, белок Argonaute, является эндонуклеазой, деградирующей мРНК, комплементарные ведущей цепи siRNA[2].