Казанская церковь представляет собой каменный храм, своды которого опираются на два смещенных на восток прямоугольных в плане столба. Основной объем храма (квадратный в плане) объединен с колокольней через трапезную. С востока к нему примыкает прямоугольный в плане алтарь с небольшими скруглениями на юго-восточном и северо-восточном углах. К трапезной пристроен придел, имеющий полукруглую апсиду.

Храм увенчан широко расставленным по углам четырехскатной крыши пятиглавием с глухими барабанами. Главки имеют луковичную форму.

Декор храма достаточно скромен. На фасаде выделяются наличники с килевидным завершением нескольких типов, расположенные на окнах первого и второго света. Центральная точка трех фасадов храма отмечена восьмигранным окном - характерным для нарышкинского стиля. В оформлении храма также использованы горизонтальные тяги, карнизы и поребрик (в цокольной части). На западной стене храма сохранились полихромные изразцы, помещенные в ниши-ширинки. Подобные изразцы встречаются в оформлении Трапезной Благовещенской церкви Ростовского Борисоглебского монастыря (1524–1526), в церкви Николая Чудотворца Авраамиевского Богоявленского монастыря (1684), в церкви Похвалы Богородицы Ростовского Петровского монастыря (1695).

Барабаны украшены аркатурно-колончатыми поясками с бегунцом и горизонтальными тягами в духе традиции архитектуры митрополита Ионы (1652-1690 гг.).

Многоярусная прямоугольная в плане колокольня имеет два яруса звона, увенчана луковичной главкой на квадратном в плане барабане. Ярусы декорированы фронтонами и пилястрами.

В интерьере сохранились росписи XVIII века. Точная дата их создания неизвестна. В Маклерской книге за 1800–1803 г. сказано, что пример-майорша вдова Надежда Николаевна в 1802 г. договорилась  с иконописцем из Ростова (Дмитрием Михайловым Гладковым) об обновлении иконостасов и ветхих икон, позолотить обветшалые места и покрыть лаком. За все это цена была 500 рублей «без всяких запасов»[8]. Работа должна была быть начала 6 декабря 1802 г. и закончена в августе 1803 г.

Сохранился богато украшенный алтарь в виде триумфальной арки, характерной для позднего классицизма, когда реальная архитектура иконостаса стала доминировать над живописью и скульптурным декором. Истоком мотива триумфальной арки в архитектуре иконостаса считается схема иконостаса Петропавловского собора в Санкт-Петербурге. Подобный тип получил широкое распространение в первой трети XIX в. По-видимому, иконостас Казанской церкви следует относить к концу 10-х годов XIX  в.[9]  В нем сочетаются черты классицизма и барокко (это использование волют в верхнем ярусе, ажурная, утонченная резьба, растительные гирлянды). Схожий тип иконостаса мы видим в расположенной в 180 км от Скнятиново Троицкой церкви села Верхне-Никульское Некоузского района (1816). Включение триумфальной арки в архитектуру иконостаса связывают с "самобытным претворением" темы победы в Отечественной войне 1812 г.[10] Отсюда возникает целый ряд иконостасов, датируемых 1810-1830-ми годами. Например, церковь Флора и Лавра в селе Ярлыково Ивановской области (1830 г.). В таком случае, мы предполагаем, что в Маклерской книге[11], сведения из которой приведены выше, речь идет о более раннем иконостасе, так как для 1803 года подобный тип и характер декора были бы слишком новаторскими.

Интересно наличие на северной стене храма скрытого в проеме окна второго света прохода, заметного изнутри. Его назначение точно неизвестно.

Выше мы уже указали даты строительства колокольни и храма, однако, следует подробней остановиться на вопросах датировки основного объема и его составных частей.

В краеведческой литературе и исследованиях советского периода дата строительства храма (1693) приводится без ссылок на источники.

Заведующий архитектурным отделом «Ростовского Кремля» А.Г. Мельник, не найдя подтверждения этой распространенной датировке,  выдвинул гипотезу о более поздней дате окончания строительства храма. Он считает, что верхний этаж храма следует рассматривать отдельно от нижнего храма. В таком случае, верхней хронологической границей стоит считать 1746 г., то есть именно тот год, в котором храм, по найденным им документам, был окончательно подготовлен к освещению. Он также обращает внимание на то, что восточная и боковые стены верхней Казанской церкви опираются на соответствующие стены нижнего храма, а западная стена этой же верхней церкви поставлена прямо на свод трапезной, из-за чего, свод трапезной был поддержан в более позднее время пилонами. Такая несогласованность планов первого и второго этажей подтверждает гипотезу о разновременности их строительства. Гипотезу о том, что строительство трапезной происходило не одновременно со строительством основного объема и было завершено к 1816 году, подтверждает тот факт, что она пристроена к основному объему без перевязки кирпичной кладки.

Даже если принять предложенные исследователем даты как примерные, мы точно понимаем, что строительство храма, начавшееся в 1693 г. было завершено приблизительно к 1746 г. в необходимом для освещения и проведения служб объеме. Возможно, в ходе строительства были обнаружены просчеты первоначального чертежа, и он был видоизменен (чем также может обуславливаться несогласованность планов этажей), кроме того, мы не исключаем приостановку строительства из-за нехватки средств или иных внешних факторов. В 1816–1818 гг. был пристроен придел собора Михаила Архангела, а в начале XX века, в 1903 г., была построена каменная западная паперть взамен сгоревшей деревянной[12]. В таком случае, говоря о стилистических особенностях храма, можно сказать, что он принадлежит архаизирующей традиции. На территории Ярославской области и Ростовского уезда подчеркнутые архаичные черты более ранних стилей мы находим в нескольких памятниках XVIII века. Таковы Корсунская церковь в Угличе (1730), церковь Михаила Архангела в Норском (1748), церковь Параскевы Пятницы Пятницкого погоста Пошехонского района (1779 г.), церковь Рождества Богородицы с. Туношна Ярославского района (1781), церковь Рождества Богородицы с. Приимково Ростовского района(1781), церковь Иоанна Златоуста в с. Годеново (1794).

• Алитова Р.Ф. Ростовская церковная архитектура XVIII века / Р. Ф. Алитова; Гос. музей-заповедник "Ростовский кремль". - Москва : Индрик, 2010. – 398 с.
• Мельник А. Г. Казанская церковь села Скнятинова близ Ростова Великого // Макариевские чтения. Патриарх Иоаким и его время. — Можайск, 2004. — Вып. 11. — С. 127—141.
• Рудченко В.М. Иконостасы XVIII – первой половины XIX в. в храмах верхневолжских областей // Памятники русской архитектуры и монументального искусства. Стиль, атрибуции, датировки. М., 1983.
• РФ ГАЯО Ф. Р-939. Оп. 6Т. Д. 100
• РФ ГАЯО Ф. Р-817. Оп. 7. Д. 50