Протеобактерии

Протеобактерии (лат. Proteobacteria) — наиболее многочисленная группа бактерий — 1534 вида или примерно треть от всех известных видов бактерий[1].

Протеобактерии

Escherichia coli
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Международное научное название
Proteobacteria Stackebrandt et al. 1986
Подгруппы

Acidithiobacilla

  • Acidithiobacillales

Alphaproteobacteria
(Альфа-протеобактерии)

  • Caulobacterales
  • Kopriimonadales
  • Kordiimonadales
  • Parvularculales
  • Rhizobiales
  • Rhodobacterales
  • Rhodospirillales
  • Rickettsiales
  • Sneathiellales
  • Sphingomonadales

Betaproteobacteria
(Бета-протеобактерии)

  • Burkholderiales
  • Hydrogenophilales
  • Methylophilales
  • Neisseriales
  • Nitrosomonadales
  • Rhodocyclales
  • Procabacteriales

Gammaproteobacteria
(Гамма-протеобактерии)

  • Aeromonadales
  • Alteromonadales
  • Cardiobacteriales
  • Chromatiales
  • Enterobacteriales
  • Legionellales
  • Methylococcales
  • Oceanospirillales
  • Pasteurellales
  • Pseudomonadales
  • Thiotrichales
  • Vibrionales
  • Xanthomonadales

Deltaproteobacteria
(Дельта-протеобактерии)

  • Bdellovibrionales
  • Desulfarculales
  • Desulfobacterales
  • Desulfovibrionales
  • Desulfurellales
  • Desulfuromonadales
  • Myxococcales
  • Syntrophobacterales

Epsilonproteobacteria
(Эпсилон-протеобактерии)

  • Campylobacterales
  • Nautiliales

Zetaproteobacteria
(Зета-протеобактерии)

  • Mariprofundales

Oligoflexia

  • Oligoflexales

Систематика
в Викивидах
Изображения
на Викискладе
ITIS  956120
NCBI  1224
EOL  311
FW  325166

Протеобактерии является весьма неоднородной группой, в эту группу включены как симбионты эукариот, так и большое число патогенных и условно-патогенных микроорганизмов, фото- и хемотрофные виды бактерий, как автотрофы, так и гетеротрофы. Все протеобактерии грамотрицательны, внешняя мембрана построена из липополисахарида. Группа включает как облигатно, так и факультативно аэробные и анаэробные бактерии. Также отличны типы движения, в группу входят как бактерии, имеющие жгутики, так и неподвижные бактерии и бактерии, имеющие т. н. «скользящий» тип движения.

Морфологически группа также неоднородна: сюда входят и палочковидные бактерии, и кокки, и спиралевидные бактерии.

Карл Вёзе выделил эту группу в 1987 году и шутливо назвал её «пурпурные бактерии и их родственники»[2]. Группа была выделена на основании анализа нуклеотидных последовательностей 16S рРНК, названа в честь древнегреческого бога Протея, умевшего менять форму по собственному желанию (в названии протеобактерий отражено большое разнообразие биохимических, физиологических и морфологических свойств, присущих этой группе).

На основании правил номенклатуры бактерий, таксон протеобактерии является нелегитимным ввиду отсутствия определённого типового нижнего таксона[3].

Таксономия

Протеобактерии делятся на классы, обозначенные буквами греческого алфавита: Alpha-, Beta-, Gamma-, Delta- и Epsilonproteobacteria. Деление на классы также произведено на основании анализа 16S рРНК. Классы альфа-, бета-, дельта- и эпсилон-протеобактерий являются монофилитическими[4][5][6]. Род Acidithiobacillus из класса Gammaproteobacteria был перенесён в класс Acidithiobacillia в 2013[7]. Согласно последним данным, этот род парафилетичен по отношению к бета-протеобактериям[8]. Относительно недавно был описан шестой класс — зета-протеобактерии (Zetaproteobacteria), представителем которого пока является единственный вид (выделенный в чистой культуре) — Mariprofundus ferrooxydans[9], железоокисляющий нейтрофильный хемолитоавтотроф, впервые обнаруженный около вулкана Лоихи в 1996 году[10].

Альфа-протеобактерии
Wolbachia

В класс альфа-протеобактерии включено большое количество фототрофов, также он включает симбионтов эукариот (Rhizobium), облигатных внутриклеточных паразитов (риккетсии, вольбахии), уксуснокислых бактерий (Acetobacter, Gluconacetobacter), бактерий, способных к спиртовому брожению (Zymomonas mobilis), метилотрофов (Methylobacteriaceae). Предположительный предок митохондрий также происходит из этой группы.

Бета-протеобактерии
Колонии Burkholderia pseudomallei

В этот класс входят аэробные и факультативно-анаэробные бактерии. Сюда входят и хемоорганогетеротрофы, и хемолитоавтотрофы (например, нитрификаторы I стадии Nitrosomonadaceae, тионовые бактерии Thiobacillus), фототрофные роды (Rhodocyclus и Rubrivivax). Также в эту группу включены возбудители инфекций: Burkholderia mallei (возбудитель сапа) и Burkholderia pseudomallei (возбудитель мелиоидоза), Bordetella pertussis (возбудитель коклюша) и род Neisseria (возбудители менингита и гонореи).

Гамма-протеобактерии
Pseudomonas aeruginosa

В этот класс входят как фототрофные бактерии (например, Chromatium — пурпурные серные аноксигенные бактерии), метанотрофы (например, Methylococcus capsulatus), так и бактерии, важные с клинической и научной точки зрения — семейства Enterobacteriaceae, Vibrionaceae, Pseudomonadaceae, Francisellaceae, Legionellaceae и Pasteurellaceae. В эту группу входят такие возбудители особо опасных инфекций: Yersinia pestis, Francisella tularensis, Haemophilus influenzae, Legionella pneumophila и Vibrio cholerae, а также такой важный с научной точки зрения модельный организм, как Escherichia coli.

Дельта-протеобактерии
Desulfovibrio vulgaris, ТЭМ

Эта группа включает такие известные бактерии, как способные к скользящему движению и образующие многоклеточные плодовые тела миксобактерии, так и известные сульфат-редуцирующие бактерии (Desulfovibrio, Desulfobacter, Desulfococcus, Desulfonema) и серобактерии (Desulfuromonas). Сюда также входят анаэробные железобактерии (Geobacter). Сюда также входят известные бактерии-хищники рода Bdellovibrio, облигатные внутриклеточные бактерии рода Lawsonia, хемолитотрофы рода Hippea, способные использовать серу и водород в качестве источника энергии. В класс входят как аэробные, так и анаэробные бактерии, факультативные анаэробы не известны в этом классе. Большинство анаэробов способно использовать неорганические акцепторы электрона, осуществляя таким образом анаэробное дыхание. Представители класса играют важную роль в круговороте элементов в природе.

Эпсилон-протеобактерии
Helicobacter pylori

Сюда входит порядок Campylobacterales с семействами Campylobacteraceae и Helicobacteraceae, в том числе важный с геохимической точки зрения род Sulfurospirillum[11], возбудитель язвы человека Helicobacter pylori. Также сюда входят симбионты пищеварительного тракта жвачных животных Wolinella.

Филогения протеобактерий

Примечания
  1. The Earth Life Web, The Proteobacteria
  2. Woese C. R. Bacterial evolution (англ.) // Microbiology and Molecular Biology Reviews. — American Society for Microbiology, 1987. — Vol. 51, no. 2. — P. 221—271. — PMID 2439888.
  3. Nomenclatural type of orders: corrections necessary according to Rules 15 and 21a of the Bacteriological Code (1990 Revision), and designation of appropriate nomenclatural typ … (недоступная ссылка). Дата обращения: 16 августа 2008. Архивировано 7 сентября 2008 года.
  4. Noel R. Krieg, Don J. Brenner, James T. Staley. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: The Proteobacteria (англ.). — Springer, 2005. — ISBN 978-0-387-95040-2.
  5. Ciccarelli, FD; Doerks, T; Von Mering, C; Creevey, CJ; Snel, B; Bork, P. Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life (англ.) // Science : journal. — 2006. — Vol. 311, no. 5765. — P. 1283—1287. — doi:10.1126/science.1123061. — PMID 16513982.
  6. Yarza, P; Ludwig, W; Euzéby, J; Amann, R; Schleifer, KH; Glöckner, FO; Rosselló-Móra, R. Update of the All-Species Living Tree Project based on 16S and 23S rRNA sequence analyses (англ.) // Systematic and applied microbiology : journal. — 2010. — Vol. 33, no. 6. — P. 291—299. — doi:10.1016/j.syapm.2010.08.001. — PMID 20817437..
  7. Williams, KP; Kelly, D.P. Proposal for a new class within the phylum Proteobacteria, Acidithiobacillia classis nov., with the type order Acidithiobacillales, and emended description of the class Gammaproteobacteria (англ.) // International journal of systematic and evolutionary microbiology : journal. — 2013. — Vol. 63, no. Pt 8. — P. 2901—2906. — doi:10.1099/ijs.0.049270-0. — PMID 23334881.
  8. Williams, K. P.; Gillespie, J. J.; Sobral, B. W. S.; Nordberg, E. K.; Snyder, E. E.; Shallom, J. M.; Dickerman, A. W. Phylogeny of Gammaproteobacteria (англ.) // American Society for Microbiology. — American Society for Microbiology, 2010. — Vol. 192, no. 9. — P. 2305—2314. — doi:10.1128/JB.01480-09. — PMID 20207755.
  9. Genus Mariprofundus : [англ.] // LPSN.
  10. Emerson D., Moyer C. L. Neutrophilic Fe-oxidizing bacteria are abundant at the Loihi Seamount hydrothermal vents and play a major role in Fe oxide deposition. (англ.) // Applied and environmental microbiology. — 2002. — Vol. 68, no. 6. — P. 3085—3093. — PMID 12039770.
  11. The versatile [epsi]-proteobacteria: key players in sulphidic habitats : Abstract : Nature Reviews Microbiology

См. также

Ссылки
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.