Грановский, Александр Александрович
Александр Александрович Грановский (15 января 1971 год, Бердск, СССР — 9 ноября 2019[1], Москва, Россия) — российсский квантовый химик, автор программного пакета для ab initio квантовохимических расчётов Firefly[2], ранее известного как PC GAMESS.
Грановский Александр Александрович | |
---|---|
Дата рождения | 15 января 1971 |
Место рождения | Бердск |
Дата смерти | 9 ноября 2019 (48 лет) |
Место смерти | Москва |
Страна | Россия |
Научная сфера | квантовая химия, программирование |
Место работы | Химический факультет МГУ |
Альма-матер | МГУ |
Научный руководитель | С. Н. Степанов |
Биография
Родился 15 января 1971 года в городе Бердск Новосибирской области. В 1996 г. семья переехала в Москву, где обучался в средней общеобразовательной школе № 171 Ленинского района г. Москвы и был победителем городских и всесоюзных химических олимпиад в 1985/86, 1986/87 и 1987/88 гг. В 1988 г. окончил специализированный химический класс школы № 171[1] при химическом факультете МГУ с серебряной медалью и в составе команды СССР участвовал в 20-й международной олимпиаде школьников по химии, проходившей в Эспоо. Как призер олимпиады был зачислен на химический факультет МГУ без экзаменов.
Обучался в специализированной физико-химической группе (11 группа). Со второго по пятый курс представлял студенческий коллектив в Ученом Совете факультета. Участвовал во всесоюзных и международных студенческих олимпиадах по химии в 1990—1992 гг. В 1990 г. на XV Международной олимпиаде по аналитической химии в Праге занял 3-е абсолютное место в личном первенстве и 1-е место в личном первенстве в теоретическом туре, а на всесоюзной олимпиаде «Студент и научно-технический прогресс» в Алма-Ате — 2-е место в личном первенстве. За успехи в учёбе и активную организационную работу был удостоен специальной стипендии общества «Филантропия» при Советском фонде мира.
Научную деятельность начал на 1 курсе в лаборатории химии редких элементов (упразднена в 1991 с образованием лаборатории химии координационных соединений) кафедры неорганической химии под руководством доц. А. И. Жирова. На 3 курсе перешел в лабораторию строения и квантовой механики молекул кафедры физической химии, где выполнял исследования под руководством доц. В. Б. Павлова-Веревкина. Защитив дипломную работу в 1993 г. и получив диплом с отличием, поступил в аспирантуру химического факультета по специальности «Физическая химия» под руководством профессора Н. Ф. Степанова.
После окончания аспирантуры в ноябре 1996 г. работал на химическом факультете МГУ в должности научного сотрудника лаборатории химической кибернетики кафедры физической химии под руководством А. В. Немухина, основной деятельностью являлась работа над кодом PC GAMESS — программы для квантовохимических расчётов. В 1999—2002 гг. был ответственным исполнителем хоздоговора между факультетом и кампанией Intel «Разработка программного пакета PC GAMESS, предназначенного для высокоэффективных квантовохимических расчётов высокого уровня теории», а также ещё ряда договоров с Intel в 2005—2007 гг.
Покинул МГУ в апреле 2009 года, переименовывал PC GAMESS в Firefly и образовал проект Firefly Project Team[2] для работы над своей программой. При этом он сотрудничал с коллегами из МГУ, Центра Фотохимии РАН и других организаций, работал специалистом-консультантом Kintech Lab[3]. В 2016 г. у А. А. Грановского диагностировали диабет, из-за чего он стал заниматься своим здоровьем, а работа над Firefly замедлилась. Скончался 10 ноября 2019 года.
Научная деятельность
Первые работы А. А. Грановского были посвящены мерам хаотичности динамики в квантовой механике и описанию локализованных высоковозбужденных колебательных состояний молекулярных систем в рамках квазиклассического подхода[4][5].
В аспирантуре он занимался применением методов классической и квантовой динамики для описания высоковозбужденных локализованных состояний молекул. Предложил эффективные методы расчета ряда характеристик (энергий, волновых функций, туннельных расщеплений) локализованных высоковозбужденных состояний — шрамов периодических орбит[6]. Использовал классические и полуклассические методы для описания динамики слабосвязанных комплексов, в том числе для оценки времен жизни комплексов в зависимости от степени колебательного возбуждения. Обнаружил существенное влияние тонких особенностей структуры фазового пространства (регулярных и нерегулярных нелинейных резонансов) на оценки времен жизни[7].
После того, как на химическом факультете МГУ в 1993 году появляется код программы GAMESS (US)[8], изначально предназначенной для использования на мейнфреймах, Грановский занялся адаптацией этой программы под персональные компьютеры и разработкой высокоэффективных алгоритмов квантовохимических методов[9][10][11]. В число этих методов входят теория возмущений Меллера-Плессе второго порядка, многоконфигурационная квазивырожденная теория возмущения второго порядка, теория функционала плотности и зависящая от времени теория функционала плотности. В списке трудов А. А. Грановского насчитывается 30 статей[12] и ряд докладов на конференциях.
PC GAMESS и Firefly
Первая версия PC GAMESS, предназначенная только для использования внутри факультета, появилась в 1994 году в результате замены ряда алгоритмов на оптимизированные под современные[1]. 18 марта 1997 года в общий доступ выходит версия PC GAMESS 4.0. Использование этой программы позволило сократить время расчётов с месяцев до нескольких дней[1]. Далее Грановский занялся переписыванием кода, сначала изменяя имеющиеся модули программы, а потом добавляя новые, позволяющие реализовать алгоритмы расчёта в рамках методов Меллера-Плессета и конфигурационного взаимодействия. Одновременно с этим шла оптимизация программы: поддержка больших (более 2 Гб) файлов, ускорение процедур ввода-вывода, сокращение числа запросов к жесткому диску.
В 1999 году компания Intel заинтересовалась PC GAMESS[13]. Грановский начал использовать библиотеки Intel MKL, добавил автоматическое распознавание типа процессора, включая различные поколения Intel и AMD, а также получил от Intel двухгодичный грант для своих разработок. Читал лекции об использовании программы МГУ[14] и за его пределами[15][16].
Грановский обеспечивал совместимость своей программы с версией с американским GAMESS, но это становилось затруднительно, так как PC GAMESS уже являлся полноценным ответвлением от оригинала. В 2000 году создал отдельный сайт[2] для программы, где её можно было скачать, а на сайте оригинала[8] некоторое время была ссылка на сайт PC GAMESS. Программы остаются частично совместимы на уровне формата файлов ввода-вывода.
Окончательное отделение PC GAMESS от GAMESS (US) началось в 2008 году. Процесс разделения шёл в течение года, и 4 декабря 2009 года название программы официально было сменено на Firefly. У Грановского появляются помощники, которые написали руководство по работе с программой и активно участвовали в обсуждении Firefly на форуме[17].
Работа над Firefly продолжалась вплоть до 2016 года, она стала одной из самых быстрых программ для квантовой химии, особенно для больших многоконфигурационных расчётов[18]. Последняя версия программы (8.2.0) была выпущена в сентябре 2016 года. Firefly активно используется учёными из разных стран при выполнении научных работ, требующих квантовохимических расчётов[19][20][21]. Расчёты на Firefly проводятся на ряде российских суперкомпьютеров[22][23][24].
Педагогическая деятельность
Всё своё время в МГУ Грановский параллельно с учёбой и научной работой занимался преподаванием. Во время обучения участвовал в работе кружков по углубленному изучению химии для школьников, а затем в подготовке команды школьников к Всесоюзной олимпиаде по химии. В аспирантуре он вёл занятия в практикуме по физической химии для студентов 3 курса и факультативные занятия по математике для студентов 1 курса. После окончания аспирантуры читал спецкурс «Дополнительные главы квантовой химии». Также под его руководством были защищены две дипломные работы.
Память
В 2020 и 2021 годах были проведены симпозиумы по вычислительной химии памяти А. А. Грановского, включающие в себя доклады по спектроскопии, теоретической, структурной и физической химии[25][26].
Примечания
- Александр Александрович Грановский (доклад Александры Фрейдзон) (рус.) ?. Дата обращения: 21 ноября 2021.
- Firefly Home Page . classic.chem.msu.su. Дата обращения: 21 ноября 2021.
- Kintech Laboratory - R&D Service and Software for Predicitve Physical Chemical Modeling . www.kintechlab.com. Дата обращения: 21 ноября 2021.
- А.А. Грановский, В.Б. Павлов-Веревкин. Внутримолекулярная динамика и спектры: применения метода Хеллера к N-уровневым системам. // Журнал Физической Химии. — 1993. — Т. 67, № 8. — С. 1635—1638.
- С.В.Петров, A.A Грановский, В.Б. Павлов-Веревкин. Анализ колебательно-вращательной динамики на фазовой плоскости. // Журнал Физической Химии. — 1995. — Т. 69, № 12. — С. 2185—2191.
- А.А. Грановский, В.Б. Павлов-Веревкин, Н.Ф. Степанов. Шрамы неусточивых периодических орбит в волновых функциях: квазиклассическое квантование. // Журнал Физической Химии. — 1996. — Т. 70, № 6. — С. 1069—1076.
- A.A. Granovsky, A.V. Medvedev, A.A. Buchachenko, N.F. Stepanov. An influence of nonlinear resonances on the classical unimolecular dynamics: Predissociation of van de Waals complexes. (англ.) // Proceedings of the 10th International Symposium on Atomic Molecular, Cluster, Ion, and Surface Physics. — 1996. — P. 136—190.
- The General Atomic and Molecular Electronic Structure System (GAMESS) (англ.). Mark Gordon's Quantum Theory Group.
- A.A. Granovsky, A.V. Nemukhin. On some computational aspects of the nonempirical quantum chemistry. // Proceedings of the First Russian Conference and School on the Supercomputing and Parallel Computation in Physics and Chemistry.. — 1999. — 1 ноября.
- A.A. Granovsky, A.V. Nemukhin. The efficient parallel algorithm for the calculation of the triple excitations contributions in the fourth-order closed-shell Moller-Plesset perturbation theory. // Proceedings of the Second Russian Conference and School on the Supercomputing and Parallel Computation in Physics and Chemistry. — 2000. — 31 октября.
- A. A. Granovsky. Extended multi-configuration quasi-degenerate perturbation theory: The new approach to multi-state multi-reference perturbation theory (англ.) // The Journal of Chemical Physics. — 2011. — Vol. 134, no. 21. — P. 214113.
- Granovsky A.A. - сотрудник | ИСТИНА – Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных . istina.msu.ru. Дата обращения: 21 ноября 2021.
- Вычислительный кластер для химиков . itWeek. Дата обращения: 21 ноября 2021.
- A.A. Granovsky. General Contraction Basis Sets: fast direct Fock Matrix formation General Contraction Basis Sets: fast direct Fock Matrix formation (англ.) (4 мая 2005).
- Alex A. Granovsky. The PC GAMESS project at MSU: optimization tutorial (англ.). Intel Oregon (ноябрь 1999).
- Alex A. Granovsky. The PC GAMESS Project at MSU (англ.). Conference SC99: High Performance Networking and Computing, Portland, Oregon, USA (19 ноября 1999).
- Firefly-related discussion club (англ.).
- Firefly and PC GAMESS Benchmarks (англ.).
- PC GAMESS version 7.0 (англ.). ResearchGate (январь 2006).
- GAMESS Firefly version 7.1.G (англ.). ResearchGate (январь 2001).
- Firefly version 8 (англ.). ResearchGate (январь 2013).
- PARALLEL.RU. Программный комплекс PC-GAMESS/Firefly на СКИФ МГУ - "Чебышев" | PARALLEL.RU - Информационно-аналитический центр по параллельным вычислениям . parallel.ru. Дата обращения: 21 ноября 2021.
- Firefly | Ресурсный Центр Вычислительный Центр СПбГУ . www.cc.spbu.ru. Дата обращения: 21 ноября 2021.
- Программный пакет Firefly (PC GAMESS) . supercomputer.susu.ru. Дата обращения: 21 ноября 2021.
- Онлайн-симпозиум по вычислительной химии памяти А.А. Грановского (2020 год) . chemport.ru. Дата обращения: 21 ноября 2021.
- Онлайн-симпозиум по вычислительной химии памяти А.А.Грановского (2021 год) . chemport.ru. Дата обращения: 21 ноября 2021.