GAMESS (US)

GAMESS (US) — программа пакета вычислительной квантовой химии.[1][2][3] Аббревиатура расшифровывается как General Atomic and Molecular Electronic Structure System. Разработка оригинального кода началась в 1977 году в рамках проекта национальных ресурсов для вычислений в химии (National Resources for Computations in Chemistry project)[4]. В 1981 году появились две стабильных ветви GAMESS: GAMESS (US) и GAMESS (UK), с тех пор их развитие шло самостоятельно и на сегодняшний день эти две программы отличаются довольно существенно. Проект GAMESS поддерживается членами исследовательской группы Гордона в Государственном Университете штата Айова.

GAMESS
Тип ПО для вычислительной химии
Разработчик Iowa State University Quantum Chemistry Group
Написана на Фортран
Операционная система Linux, FreeBSD, Unix и UNIX-подобные операционные системы, Microsoft Windows, Mac OS X
Последняя версия 20130501.1 (1 мая 2013)
Лицензия No cost license
Сайт msg.chem.iastate.edu/gam…

Возможности
Суммарная таблица по ряду основных возможностей GAMESS
(C - хранение интегралов, D - прямые вычисления интегралов АО, p - параллельное исполнение, F - использование фрагментарных МО)
SCFTYP=RHFROHFUHFGVBMCSCF
ЭнергияCDpFCDpCDpCDpCDpF
Аналитический градиентCDpFCDpCDpCDpCDpF
Численный ГессианCDpFCDpCDpCDpCDp
Аналитический ГессианCDpCDp-CDpCDp
MP2 энергияCDpFCDpCDp-CDp
MP2 градиентCDpFDpCDp--
CI энергияCDpCDp-CDpCDp
CI градиентCD----
CC энергияCDpF----
EOM энергияCD----
DFT энергияCDpFCDpCDp--
DFT градиентCDpFCDpCDp--
MOPAC энергияyesyesyesyes-
MOPAC градиентyesyesyes--

GAMESS (US) способен производить расчеты МО при помощи многих методов вычислительной квантовой химии, включая метод Хартри-Фока, теорию функционала плотности (DFT), теория валентных связей (GVB), и многоконфигурационное самосогласованное поле (MCSCF). Коррекция энергии электронной корреляции после процедуры самосогласования может быть осуществлена при помощи конфигурационного взаимодействия (CI), теории возмущений Меллера-Плессета второго порядка. Эффект растворителя может учитываться в рамках моделей SCRF, PCM или моделироваться с помощью, т.н. "эффективных фрагментов". Релятивистские поправки также могут быть учтены с помощью различных методов, например приближением Дугласа-Кролла третьего порядка.

Поскольку в программе молекулярная механика не реализована, комбинированные расчеты используют пакет TINKER для вычислений механической части. Метод фрагментарных МО может использоваться для расчета крупных систем, деля их на "фрагменты".

Связь с другими программами

GAMESS сохраняет расчет в текстовый файл специального формата. Хранящиеся в данном файле координаты могут быть преобразованы программой OpenBabel. Молекулярные орбитали можно визуализировать такими программами, как Molekel (англ. Molekel) или wxMacMolPlt.

Совместимость и доступность

US GAMESS работает на всех POSIX-совместимых операционных системах, OS X и Windows. На официальном сайте доступны бинарные пакеты для Mac OS X, MacOS 7-9 и Microsoft Windows. Также поддерживаются платформы Sun Solaris UltraSPARC/x86/x86-64, IBM BlueGene, AIX POWER/PowerPC, Linux x86/x86-64, Cray X1/XT Unicos, Fujitsu PrimePower Solaris, HP PA-RISC/x86 HP-UX и NEC SUPER-UX[5].

Исходный код US GAMESS распространяется бесплатно при условии некоммерческого использования программы.

См. также

Примечания
  1. Computational Chemistry, David Young, Wiley-Interscience, 2001. Appendix A. A.2.3 pg 334, GAMESS
  2. M.W. Schmidt et al. General Atomic and Molecular Electronic Structure System (англ.) // J. Comput. Chem. : journal. — 1993. — Vol. 14. — P. 1347—1363. — doi:10.1002/jcc.540141112.
  3. M. S. Gordon and M. W. Schmidt, Advances in electronic structure theory: GAMESS a decade later, in Theory and Applications of Computational Chemistry, the first 40 years, C. E. Dykstra, G. Frenking. K. S. Lim and G. E. Scusaria, Elsevier, Amsterdam, 2005.
  4. Gordon Research Group. GAMESS Manual (Introduction).
  5. GAMESS Registration: download

Внешние ссылки
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.