OpenBabel
OpenBabel — свободная химическая экспертная система, в основном используемая для преобразования форматов файлов. Эта программа доступна для UNIX и Windows и распространяется на условиях GNU GPL.
OpenBabel | |
---|---|
Тип | Хемоинформатика |
Написана на | C++ |
Операционная система | Кроссплатформенное программное обеспечение |
Последняя версия | 2.3.2 (17 октября 2011) |
Читаемые форматы файлов | CML[1][2], International Chemical Identifier[3][2], MDL Molfile[d][4][2], Protein Data Bank[5], FASTA (формат)[6], Alchemy Format[d][7], Gaussian Cube File[d][8], CDX Format[d][9], CIF[10], XYZ file format[d][11], Free Form Fractional format[d][12] и MCDL format[d] |
Создаваемые форматы файлов | SMILES[13][2], CML[1][2], International Chemical Identifier[3][2], InChIKey[d][14][2], MDL Molfile[d][4][2], Multilevel Neighborhoods of Atoms format[d][15], Free Form Fractional format[d][12], MCDL format[d][16] и CAChe MolStruct[d][17] |
Лицензия | GNU General Public License |
Сайт | openbabel.sourceforge.net/… |
OpenBabel, так же как и JOELib, основан на библиотеке OELib, которая, в свою очередь, использовала идеи из программы Babel.
Основные возможности
- Химическая экспертная система
- Преобразование форматов
- Поиск фрагментов (с помощью SMILES)
См. также
Примечания
- Chemical Markup Language (cml, mrv)
- Supported File Formats and Options
- InChI format (inchi)
- MDL MOL format (mol, mdl, sdf, sd)
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Protein_Data_Bank_format.html
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/FASTA_format.html
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Alchemy_format.html
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Gaussian_cube_format.html
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/ChemDraw_binary_format.html
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Crystallographic_Information_File.html
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/XYZ_cartesian_coordinates_format.html
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Free_Form_Fractional_format.html
- SMILES format (smi, smiles)
- InChIKey (inchikey)
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Multilevel_Neighborhoods_of_Atoms_(MNA).html
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/MCDL_format.html
- http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/CAChe_MolStruct_format.html
Ссылки
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.