Ribozyviria

Ribozyviria (лат.) — реалм[Ком. 1] РНК-содержащих вирусов, выделенный в 2020 году и по состоянию на 2020 год содержащий единственное семейство Kolmioviridae[2]. Представители Ribozyviria — вирусы-сателлиты, которые могут размножаться в заражённых клетках только в присутствии вируса-хозяина. Вирусы реалма Ribozyviria заражают только клетки животных, а наиболее изученным представителем реалма является патоген человека вирус гепатита дельта, который является сателлитом вируса гепатита B[3][4].

Ribozyviria

Схема строения вириона вируса гепатита дельта
Научная классификация
Группа:
Вирусы[1]
Реалм:
Ribozyviria
Международное научное название
Ribozyviria

Систематика
в Викивидах
Поиск изображений
на Викискладе
NCBI  2842242

Описание

Представители реалма Ribozyviria, из которых по состоянию на 2022 год подробно изучен только вирус гепатита дельта, инфицируют только клетки животных. В геномах этих вирусов закодирован единственный белок, который подвергается посттрансляционным модификациям с образованием двух функционально различных форм белка, которые задействованы в размножении вируса и формируют нуклеокапсид внутри вирионов. По остальным свойствам вирусы из реалма Ribozyviria очень близки к вироидам и сателлитным РНК. Как и представители двух вышеупомянутых групп, вирусы из Ribozyviria реплицируются по механизму катящегося кольца, причем реакцию присоединения новых нуклеотидов катализирует ДНК-зависимая РНК-полимераза клетки-хозяина. Разрезание промежуточной длинной молекулы РНК на отдельные вирусные геномы осуществляет специальный рибозим, входящий в состав вируса. Представители Ribozyviria используют рибозимы нескольких типов, причём один из них уникален для вирусов реалма Ribozyviria[4].

Поскольку члены Ribozyviria устроены гораздо сложнее, чем вироиды и другие вироидоподобные агенты, и имеют единственный структурный ген, предполагается, что Ribozyviria произошли от вироидов. Однако вироиды являются патогенами растений, поэтому возникновению Ribozyviria, вероятно, предшествовал горизонтальный перенос этих агентов от растений к животным. Предполагается, что в ходе эволюции члены Ribozyviria приобрели белоккодирующий ген в ходе рекомбинации с генетическим материалом животной клетки[4].

Классификация

По состоянию на 2020 год реалм Ribozyviria содержит единственное семейство, Kolmioviridae, содержащее восемь родом. Таксоны промежуточного ранга между семейством и родом не выделены. Названия всех родов, входящих в состав Kolmioviridae, в своем названии содержат название буквы D на разных языках. Название самого семейства происходит от сунд. kolmio — треугольник, поскольку буква Δ греческого алфавита, соответствующая латинской D, имеет треугольное начертание[3].

Ниже приведена таксономия реалма Ribozyviria по состоянию на 2020 год:[2]

  • Реалм: Ribozyviria
    • Семейство: Kolmioviridae
      • Род: Daazvirus
      • Род: Dagazvirus
        • Вид: Dagazvirus schedorhinotermitis [также известен как RTV-1 (от англ. rhinotermitid virus 1, а также rHDV] (хозяин: Schedorhinotermes intermedius)[5]
      • Род: Daletvirus
        • Вид: Daletvirus boae [также известен как SwSCV-1 (от англ. Swiss snake colony virus 1), ранее sHDV] (хозяева: обыкновенный удав (Boa constrictor), Liasis mackloti savuensis)[6]
      • Род: Dalvirus
      • Род: Deevirus
        • Вид: Deevirus actinopterygii [также известен как RFFV-1 (от англ. ray-finned fish virus 1), ранее fHDV] (хозяин: различные лучепёрые рыбы)[5]
      • Род: Deltavirus[2]
        • Вид: Deltavirus cameroonense [вирус гепатита дельта человека 7 (HDV-7)] (хозяин: Homo sapiens)
        • Вид: Deltavirus carense [вирус гепатита дельта человека 6 (HDV-6)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus italiense [вирус гепатита дельта человека 1 (HDV-1)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus japanense [вирус гепатита дельта человека 2 (HDV-2)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus peruense [вирус гепатита дельта человека 3 (HDV-3)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus senegalense [вирус гепатита дельта человека 8 (HDV-8)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus taiwanense [вирус гепатита дельта человека 4 (HDV-4)] (хозяин: H. sapiens)
        • Вид: Deltavirus togense [вирус гепатита дельта человека 5 (HDV-5)] (хозяин: H. sapiens)
      • Род: Dobrovirus
      • Род: Thurisazvirus

История изучения

Первый известный представитель реалма Ribozyviria, вирус гепатита дельта (вид Hepatitis delta virus, род Deltavirus), был открыт в 1993 году. С тех пор несколько членов Ribozyviria, заражающих клетки разных видов животных, были описаны с помощью метагеномики[4]. До 2018 года таксономическое положение рода Deltavirus оставалось неопределённым, пока Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) не отнёс его ошибочно в новообразованный реалм Riboviria. В 2019 году ошибка была исправлена, и таксономическое положение Deltavirus вновь стало неопределённым. В 2020 году вид Hepatitis delta virus, вместо него было выделено восемь новых видов.

Примечания

Комментарии

  1. На данный момент устоявшегося русскоязычного термина, соответствующего англ. realm в таксономии, нет.

Источники

  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV). (Дата обращения: 27 апреля 2020).
  3. Create one new realm (Ribozyviria) including one new family (Kolmioviridae) including genus Deltavirus and seven new genera for a total of 15 species (англ.) (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (6 December 2020). Дата обращения: 27 мая 2021.
  4. Lee Benjamin D., Koonin Eugene V. Viroids and Viroid-like Circular RNAs: Do They Descend from Primordial Replicators? (англ.) // Life. — 2022. — 12 January (vol. 12, no. 1). — P. 103. — ISSN 2075-1729. — doi:10.3390/life12010103.
  5. Chang W. S., Pettersson J. H., Le Lay C., Shi M., Lo N., Wille M., Eden J. S., Holmes E. C. Novel hepatitis D-like agents in vertebrates and invertebrates. (англ.) // Virus Evolution. — 2019. — July (vol. 5, no. 2). — P. 021—021. — doi:10.1093/ve/vez021. — PMID 31321078.
  6. Hetzel U., Szirovicza L., Smura T., Prähauser B., Vapalahti O., Kipar A., Hepojoki J. Identification of a Novel Deltavirus in Boa Constrictors. (англ.) // MBio. — 2019. — 2 April (vol. 10, no. 2). — doi:10.1128/mBio.00014-19. — PMID 30940697.
  7. Wille M., Netter H. J., Littlejohn M., Yuen L., Shi M., Eden J. S., Klaassen M., Holmes E. C., Hurt A. C. A Divergent Hepatitis D-Like Agent in Birds. (англ.) // Viruses. — 2018. — 17 December (vol. 10, no. 12). — doi:10.3390/v10120720. — PMID 30562970.
  8. Paraskevopoulou S., Pirzer F., Goldmann N., Schmid J., Corman V. M., Gottula L. T., Schroeder S., Rasche A., Muth D., Drexler J. F., Heni A. C., Eibner G. J., Page R. A., Jones T. C., Müller M. A., Sommer S., Glebe D., Drosten C. Mammalian deltavirus without hepadnavirus coinfection in the neotropical rodent Proechimys semispinosus. (англ.) // Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. — 2020. — 28 July (vol. 117, no. 30). — P. 17977—17983. — doi:10.1073/pnas.2006750117. — PMID 32651267.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.