IFITM3
IFITM3 (англ. Interferon-induced transmembrane protein 3; GGT1) — мембранный белок из семейства интерферон-индуцируемых мембранных белков, продукт гена человека IFITM3 [1][2][3].
| IFITM3 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | ||||||
| Символы | IFITM3, 1-8U, DSPA2b, IP15, interferon induced transmembrane protein 3 | |||||
| Внешние IDs | OMIM: 605579 MGI: 1913391 HomoloGene: 136199 GeneCards: 10410 | |||||
| Ортологи | ||||||
| Виды | Человек | Мышь | ||||
| Entrez | ||||||
| Ensembl | ||||||
| UniProt | ||||||
| RefSeq (мРНК) | ||||||
| RefSeq (белок) | ||||||
| Локус (UCSC) | Chr 11: 0.32 – 0.33 Mb | Chr 7: 141.01 – 141.01 Mb | ||||
| Поиск PubMed | ||||||
| Править (человек) | Править (мышь) | |||||
У человека семейство IFITM представлено 4 генами 11-й хромосомы: IFITM1, IFITM2, IFITM3 и IFITM5[4]. У мыши в семейство входят 7 белков (есть также IFITM6 и IFITM7).
Функции
IFITM3, как и другие члены этого семейства, является антивирусным белком, который ингибирует вход вируса в клеточную цитоплазму. Белок нарушает гомеостаз холестерина. Ингибирует вход вируса в цитоплазму клетки хозяина за счёт предотвращения слияния вируса с эндосомами, истощёнными по холестерину. Может инактивироать вновь образующиеся вирусные частицы, отпочкующиеся от мембраны заражённой клетки за счёт их отпочковывания от холестерин-обеднённой мембраны. Белок активен против вируса гриппа A, коронавираса SARS, вируса Марбург, вируса Эбола, вируса лихорадки денге, вируса лихорадки Западного Нила, ВИЧ-1 и вируса везикулярного стоматита. Играет важную роль в структурной стабильности и функционировании вакуолярной АТФазы (v-ATPase). Взаимодействует с эндосомальной v-ATPase, которая критически важна для правильной локализации клатрина и необходим для функционирования АТФазы в понижении кислотности в фагоцитарных эндосомах, что в результате устанавливает антивирусное состояние клетки.
Примечания
- Lewin A.R., Reid L.E., McMahon M., Stark G.R., Kerr I.M. Molecular analysis of a human interferon-inducible gene family (англ.) // Eur J Biochem : journal. — 1991. — August (vol. 199, no. 2). — P. 417—423. — doi:10.1111/j.1432-1033.1991.tb16139.x. — PMID 1906403.
- Tanaka S.S., Yamaguchi Y.L., Tsoi B., Lickert H., Tam P.P. IFITM/Mil/fragilis family proteins IFITM1 and IFITM3 play distinct roles in mouse primordial germ cell homing and repulsion (англ.) // Dev Cell : journal. — 2005. — December (vol. 9, no. 6). — P. 745—756. — doi:10.1016/j.devcel.2005.10.010. — PMID 16326387.
- Entrez Gene: IFITM3 interferon induced transmembrane protein 3 (1-8U).
- Hickford D., Frankenberg S., Shaw G., Renfree M.B. Evolution of vertebrate interferon inducible transmembrane proteins (англ.) // BMC Genomics : journal. — 2012. — Vol. 13. — P. 155. — doi:10.1186/1471-2164-13-155. — PMID 22537233.
Литература
- Vaarala M.H., Porvari K., Kyllönen A., Vihko P. Differentially expressed genes in two LNCaP prostate cancer cell lines reflecting changes during prostate cancer progression (англ.) // Lab. Invest. : journal. — 2000. — Vol. 80, no. 8. — P. 1259—1268. — doi:10.1038/labinvest.3780134. — PMID 10950117.
- Hartley J.L., Temple G.F., Brasch M.A. DNA cloning using in vitro site-specific recombination (англ.) // Genome Res. : journal. — 2001. — Vol. 10, no. 11. — P. 1788—1795. — doi:10.1101/gr.143000. — PMID 11076863.
- Simpson JC; Wellenreuther R; Poustka A; Pepperkok, R; Wiemann, S. Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing (англ.) // EMBO Rep. : journal. — 2001. — Vol. 1, no. 3. — P. 287—292. — doi:10.1093/embo-reports/kvd058. — PMID 11256614.
- Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G.D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932.
- Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, CM; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, SL; Old, S; Rasooly, R. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334.
- Wiemann S; Arlt D; Huber W; Wellenreuther, R; Schleeger, S; Mehrle, A; Bechtel, S; Sauermann, M; Korf, U. From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2136—2144. — doi:10.1101/gr.2576704. — PMID 15489336.
- Kimura K; Wakamatsu A; Suzuki Y; Ota, T; Nishikawa, T; Yamashita, R; Yamamoto, J; Sekine, M; Tsuritani, K. Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes (англ.) // Genome Res. : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 1. — P. 55—65. — doi:10.1101/gr.4039406. — PMID 16344560.
- Mehrle A; Rosenfelder H; Schupp I; Del Val, C; Arlt, D; Hahne, F; Bechtel, S; Simpson, J; Hofmann, O. The LIFEdb database in 2006 (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — 2006. — Vol. 34, no. Database issue. — P. D415—D418. — doi:10.1093/nar/gkj139. — PMID 16381901.