Флаг Усть-Кубинского района

«Флаг Усть-Кубинского муниципального района Вологодской области представляет собой полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее изображение фигур и цветов полей герба района в упрощённой версии».

Жёлтая рысь символизирует местную фауну.

Зелёный цвет полотнища символизирует обилие лесов в районе и лесную промышленность, сельское хозяйства, а также процветание, стабильность.

Синяя полоса символизирует озеро Кубенское и реку Кубена, давшей название району.

Два перекрещённых белых якоря символизируют речной порт Устье. Также якорь является символом надежды.

Жёлтый крест напоминает о сказании об основании монастыря на острове Каменном. Ладью князя Глеба Васильковича в 1260 году озёрный шторм выбросил на клочок земли среди бурных волн. Возблагодарив Бога за чудесное спасение, Глеб дал обет построить там монастырь — Спасо-Каменный. Также крест символизирует просвещение, является символом христианской веры и Церкви, а также древним знаком власти.

Зелёный цвет — символ нового роста, плодородия, природы и радости.

Синий цвет (лазурь) — символ красоты, мягкости и величия.

Жёлтый цвет (золото) — символ прочности, богатства, величия, интеллекта и прозрения.

Белый цвет (серебро) — символ простоты, совершенства, мудрости, благородства, мира, взаимосотрудничества.