Коронавирусы (подсемейство)

Коронавирусы
Коронавирусы
	; Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (SARSCoV)
Научная классификация
	Группа: Вирусы[1] Реалм: Riboviria Царство: Orthornavirae Тип: Pisuviricota Класс: Pisoniviricetes Порядок: Nidovirales Подпорядок: Cornidovirineae Семейство: Коронавирусы Подсемейство: Коронавирусы
Международное научное название
	Orthocoronavirinae
Синонимы
	Coronavirinae;
Группа по Балтимору
	IV: (+)оцРНК-вирусы
NCBI	2501931

Коро́навирусы[2] (лат. Orthocoronavirinae) — подсемейство вирусов из семейства Coronaviridae[3], объединяющее оболочечные РНК-содержащие плеоморфные[К 1] вирусы, вызывающие широкий спектр заболеваний различной тяжести у животных, включая человека[4]. В большинстве случаев коронавирусные инфекции протекают в лёгкой форме, однако в XXI веке происходили вспышки тяжёлых заболеваний, вызываемых бетакоронавирусами MERS-CoV и SARS-CoV[4], а также SARS-CoV-2. Это вирусы с (+)одноцепочечной РНК-геном и нуклеокапсидом спиральной симметрии. Размер генома коронавирусов варьируется от приблизительно 27 до 34 килобаз, самый большой среди известных РНК-вирусов.

Геном

Схематическое изображение организации генома и функциональных доменов S-белков вирусов SARS-CoV и MERS-CoV

Коронавирусы содержат геном с одноцепочечной смысловой РНК. Размер их генома колеблется от 27 до 34 килобаз является одним из самых больших среди РНК-вирусов. Геном имеет 5'-метилированный кэп и 3'-полиаденилированный хвост. Геномная организация коронавируса: 5'-НТО лидерная последовательность — репликаза / транскриптаза — шип (S) — оболочка (E) — нуклеокапсид (N) — 3’НТО — поли(A) хвост. Открытые рамки считывания 1a и 1b, которые занимают первые две трети генома, кодируют полипротеин репликазы / транскриптазы. Полипротеины репликазы / транскриптазы саморасщепляется, образуя неструктурные белки (nsps). Далее идут рамки считывания, кодирующие четыре основных структурных белка: шип, оболочку, мембрану и нуклеокапсид. Перемежаясь с этими рамками расположены рамки считывания для вспомогательных белков. Количество вспомогательных белков и их функция различны для разных коронавирусов.

Жизненный цикл

Зарождение

Инфекция начинается, когда вирусный шип (S) гликопротеин прикрепляется к своему комплементарному рецептору клетки-хозяина. После прикрепления протеаза клетки-хозяина расщепляется и активирует прикрепленный к рецептору спайковый белок. В зависимости от доступной протеазы клетки-хозяина, расщепление и активация позволяют клетке проникать посредством эндоцитоза или прямого слияния вирусной оболочки с мембраной хозяина. При проникновении в клетку-хозяина вирусная частица не имеет покрытия и ее геном попадает в цитоплазму клетки. Геном РНК коронавируса имеет 5'-метилированную кепку и 3'-полиаденилированный хвост, что позволяет РНК прикрепляться к рибосоме клетки-хозяина для трансляции. Рибосома хозяина транслирует исходную перекрывающуюся открытую рамку считывания генома вируса и образует длинный полипротеин. Полипротеин имеет свои собственные протеазы, которые расщепляют полипротеин на множество неструктурных белков.

Классификация

До 2009 года представителей подсемейства объединяли в род Coronavirus[5], но в 2009 году систематику коронавирусов пересмотрели: Coronavirus разделили на 3 рода (Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus), объединённых в подсемейство Coronavirinae[6].

Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) по состоянию на апрель 2020 года выделяет в подсемействе 4 рода[7]:

Род Alphacoronavirus (14 подродов и 19 видов)
Род Betacoronavirus (5 подродов и 14 видов)
Род Gammacoronavirus (3 подрода и 5 видов)
Род Deltacoronavirus (3 подрода и 7 видов)

Примечания

Комментарии

Плеоморфные вирусы — вирусы, варьирующие по форме и размерам.

Источники

Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
Коронавирусы / Горбаленя А. Е. // Конго — Крещение. — М. : Большая российская энциклопедия, 2010. — С. 352. — (Большая российская энциклопедия : [в 35 т.] / гл. ред. Ю. С. Осипов ; 2004—2017, т. 15). — ISBN 978-5-85270-346-0.
Щелканов М. Ю., Попова А. Ю., Дедков В. Г., Акимкин В. Г., Малеев В. В. История изучения и современная классификация коронавирусов (Nidovirales: Coronaviridae) (рус.) // Инфекция и иммунитет : научная статья. — 2020. — Т. 10, № 2. — С. 221—246.
Zumla A., Chan J. F. W., Azhar E. I., Hui D. S. C., Yuen K.-Y. Coronaviruses — drug discovery and therapeutic options (англ.) // Nature Reviews Drug Discovery. — 2016. — Vol. 15. — P. 327—347. — doi:10.1038/nrd.2015.37.
ICTV Taxonomy History for Coronavirus на сайте ICTV (англ.) (Дата обращения: 19 июля 2019).
Revision of the family Coronaviridae : [англ.] // ICTV. — Code(s) assigned: 2008.085-126V. — 2008. — P. 3—6. — 37 p.
Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV). (Дата обращения: 25 мая 2020).

Ссылки

Коронавирусная инфекция.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[4] Плеоморфные вирусы — вирусы, варьирующие по форме и размерам.

[1] Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).

[BRE-2] Коронавирусы / Горбаленя А. Е. // Конго — Крещение. — М. : Большая российская энциклопедия, 2010. — С. 352. — (Большая российская энциклопедия : [в 35 т.] / гл. ред. Ю. С. Осипов ; 2004—2017, т. 15). — ISBN 978-5-85270-346-0.

[3] Щелканов М. Ю., Попова А. Ю., Дедков В. Г., Акимкин В. Г., Малеев В. В. История изучения и современная классификация коронавирусов (Nidovirales: Coronaviridae) (рус.) // Инфекция и иммунитет : научная статья. — 2020. — Т. 10, № 2. — С. 221—246.

[NRDD-5] Zumla A., Chan J. F. W., Azhar E. I., Hui D. S. C., Yuen K.-Y. Coronaviruses — drug discovery and therapeutic options (англ.) // Nature Reviews Drug Discovery. — 2016. — Vol. 15. — P. 327—347. — doi:10.1038/nrd.2015.37.

[6] ICTV Taxonomy History for Coronavirus на сайте ICTV (англ.) (Дата обращения: 19 июля 2019).

[CD08_085-126V-7] Revision of the family Coronaviridae : [англ.] // ICTV. — Code(s) assigned: 2008.085-126V. — 2008. — P. 3—6. — 37 p.

[ICTV_0-8] Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV). (Дата обращения: 25 мая 2020).