Активатор апоптоза harakiri
Активатор апоптоза harakiri (HRK) — белок семейства Bcl2, активатор апоптоза, который у человека кодируется геном HRK.
Активатор апоптоза harakiri | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||
Символы | HRK, DP5, HARAKIRI, harakiri, BCL2 interacting protein | ||||||||||||
Внешние IDs | OMIM: 603447 HomoloGene: 136405 GeneCards: 8739 | ||||||||||||
| |||||||||||||
Профиль экспрессии РНК | |||||||||||||
Больше информации | |||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||
Виды | Человек | Мышь | |||||||||||
Entrez |
| ||||||||||||
Ensembl |
| ||||||||||||
UniProt |
| ||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
| ||||||||||||
RefSeq (белок) |
| ||||||||||||
Локус (UCSC) | Chr 12: 116.86 – 116.88 Mb | n/a | |||||||||||
Поиск PubMed | n/a | ||||||||||||
Править (человек) |
Структура гена, мРНК и белка
кДНК HRK была впервые независимо клонирована из клеток HeLa и симпатических нейронов крыс в 1997 году[1][2]. кДНК HRK человека имела длину около 700 нуклеотидов и включала 5'- и 3'-некодирующие области, кодирующую область и поли(А)-хвост. В 3'-некодирующей области был обнаружен сигнал дестабилизации мРНК 5'-ATTTA-3'[1].
Ген HRK кодирует белок длиной в 91 аминокислотный остаток. Гомологи HRK по первичной структуре пока не обнаружены. Фрагмент 37—44 гомологичен домену BH3 (англ. Bcl-2 homology domain 3)[1].
Распространение и внутриклеточная локализация
Методом нозерн-блота мРНК HRK была обнаружена в лимфоидных органах, особенно в селезёнке и костном мозге, а также в поджелудочной железе человека[1]. Хотя методом полногеномного секвенирования РНК присутствие мРНК HRK в селезёнке и костном мозге выявить не удалось, небольшие её количества были обнаружены в лимфатических узлах, коре головного мозга, щитовидной железе, надпочечниках и тестикулах[3].
мРНК HRK была обнаружена только в головном мозге взрослых крыс и отсутствовала в селезёнке, тимусе, тестикулах, тонком кишечнике, сердечной и скелетных мышцах[2].
Методом иммуногистохимии низкие и средние количества белка Hrk были обнаружены во многих органах, при этом препараты тонкого кишечника, поджелудочной железы, кожи, молочных желёз и лимфоидных тканей имели, как правило, отрицательную окраску (белок отсутствует)[3].
В клетках HRK локализуется преимущественно в митохондриях и взаимодействует там с белком митохондриального матрикса p32[4].
Примечания
- Inohara N., Ding L., Chen S., Núñez G. harakiri, a novel regulator of cell death, encodes a protein that activates apoptosis and interacts selectively with survival-promoting proteins Bcl-2 and Bcl-X(L) // EMBO J. — 1997. — Vol. 16, № 7. — P. 1686—94. — PMID 9130713.
- Imaizumi K., Tsuda M., Imai Y., Wanaka A., Takagi T., Tohyama M. Molecular cloning of a novel polypeptide, DP5, induced during programmed neuronal death // J Biol Chem. — 1997. — Vol. 272, № 30. — P. 18842—8. — PMID 9228060.
- HRK в базе данных The Human Protein Atlas . Дата обращения: 7 апреля 2014.
- Sunayama J., Ando Y., Itoh N., Tomiyama A., Sakurada K., Sugiyama A., Kang D., Tashiro F., Gotoh Y., Kuchino Y., Kitanaka C. Physical and functional interaction between BH3-only protein Hrk and mitochondrial pore-forming protein p32 // Cell Death Differ. — 2004. — Vol. 11, № 7. — P. 771—81. — PMID 15031724.