GROMACS

GROMACS (англ. groningen machine for chemical simulations, гронингенская машина для химического моделирования) пакет программ для моделирования физико-химических процессов в молекулярной динамике. Разработан командой Германа Берендсена, работающей в отделении биофизической химии университета Гронингена. В настоящее время развивается и поддерживается усилиями энтузиастов, в число которых входят представители университета Уппсалы и королевского технологического института. Пакет предназначен для моделирования биомолекул (например, молекул белков и липидов), имеющих много связанных взаимодействий между атомами. Обеспечивает высокую скорость расчётов для несвязанных взаимодействий. Считается одним из самых быстрых инструментов. Является свободным программным обеспечением с открытым исходным кодом. Исходный код доступен под лицензией GPL.

GROMACS
Тип Моделирование
Разработчик университет Гронинген
Написана на C/C++
Операционная система Кроссплатформенный
Последняя версия
Читаемые форматы файлов GROMACS Residue Topology[d] и GROMACS Residue Topology (with rem)[d]
Создаваемые форматы файлов GROMACS Residue Topology[d] и GROMACS Residue Topology (with rem)[d]
Лицензия GNU General Public License
Сайт gromacs.org

См. также

Программы, используемые при моделировании из «первых принципов»

Примечания

Ссылки


This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.