CARD (домен)
CARD (сокр. от англ. Caspase recruitment domains, или Caspase activation and recruitment domains) — домены активации и рекрутирования каспаз, являются мотивами взаимодействия, обнаруживаемыми в широком спектре белков, как правило, участвующих в процессах, связанных с воспалением и апоптозом. Эти домены опосредуют образование более крупных белковых комплексов посредством прямого взаимодействия между отдельными CARD-содержащими белками. Домены CARD находятся в поразительно широком диапазоне белков, включая хеликазы, киназы, митохондриальные белки, каспазы и другие цитоплазматические факторы.
Caspase recruitment domain | |
---|---|
| |
Идентификаторы | |
Символ | CARD |
Pfam | PF00619 |
InterPro | IPR001315 |
SMART | SM00114 |
PROSITE | PS50209 |
SCOP | 3crd |
SUPERFAMILY | 3crd |
CDD | cd01671 |
Доступные структуры белков | |
Pfam | структуры |
PDB | RCSB PDB; PDBe; PDBj |
PDBsum | 3D-модель |
Основные характеристики
Домены CARD являются подклассом белкового мотива, известного как фолд смерти, в котором расположено шесть-семь антипараллельных альфа-спиралей с гидрофобным сердечником (кор) и наружной поверхностью, состоящей из заряженных аминокислотных остатков. Другие мотивы этого класса включают пириновый домен (PYD), домен смерти (DD) и домен эффектора смерти (DED), они все также участвуют в основном в регуляции апоптоза и воспалительных реакциях.
Участие в апоптозе
Домены CARD ранее характеризовались активацией каспазы и апоптозом[2]. Основная шестиспиральная структура области, по-видимому, сохраняется еще в виде генов ced-3 и ced-4 у C. elegans, организма, в котором сначала были описаны несколько компонентов апоптотического аппарата. CARD мотивы присутствуют в ряде белков, которые способствуют апоптозу, в основном это каспазы 1,2,4,5,9 и 15 у млекопитающих.
Примечания
- Chou J. J., Matsuo H., Duan H., Wagner G. Solution structure of the RAIDD CARD and model for CARD/CARD interaction in caspase-2 and caspase-9 recruitment (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1998. — July (vol. 94, no. 2). — P. 171—180. — doi:10.1016/S0092-8674(00)81417-8. — PMID 9695946.
- Hofmann K., Bucher P., Tschopp J. The CARD domain: a new apoptotic signalling motif (англ.) // Trends Biochem Sci : journal. — 1997. — Vol. 22, no. 5. — P. 155—156. — doi:10.1016/S0968-0004(97)01043-8. — PMID 9175472.