Крупные ядерно-цитоплазматические ДНК-содержащие вирусы
Крупные ядерно-цитоплазматические ДНК-содержащие вирусы (англ. nucleocytoplasmic large DNA viruses; NCLDV) — группа семейств эукариотичесих вирусов, содержащих ДНК. Вирусы этой группы отличаются большой длиной ДНК (от 300 Кб до 2,5 Мб) и крупными размерами (от 200 нм до 1000 нм) и, таким образом, сравнимы по этим параметрам с бактериями.
Группа вирусов | |||
---|---|---|---|
| |||
Название | |||
Крупные ядерно-цитоплазматические ДНК-содержащие вирусы | |||
Статус названия | |||
обсуждается | |||
Научное название | |||
— | |||
Родительский таксон | |||
Домен Вирусы (Viruses[1]) | |||
Семейства | |||
|
|||
|
Классификация
В группу входят следующие семейства:
- Asfarviridae
- Ascoviridae
- Iridoviridae
- Marseilleviridae
- Megaviridae
- Mimiviridae
- Pandoraviridae
- Phycodnaviridae
- Pithoviridae
- Poxviridae
К этой группе относят также род Dinodnavirus.
Особенности NCLDV
Вирусы данной группы имеют общие и уникальные особенности геномной ДНК и структуры вириона. Однако не известно, имеют ли эти семейства общего предка либо эти общие черты возникли независимо друг от друга в результате рекрутирования генов хозяина в процессе репликации вирусов. Гипотеза общего предка считается противоречивой[2].
В настоящее время обнаружено 47 основных генов NCLDV. Они включают четыре ключевых белка репликации и репарации ДНК: ДНК-полимеразу семейства B, топоизомеразу II A, эндонуклеазу FLAP (5-липоксигеназа-активирующий белок) и фактор процессинга proliferating cell nuclear antigen. Кроме этого, сюда относятся ДНК-зависимая РНК-полимераза II и фактор транскрипции II B.
Возможно, эти вирусы возникли до разделения эукариот на коронные группы (группы организмов, состоящих из последнего общего предка группы и всех живущих потомков). Геном предшественников был сложный и состоял по крайней мере из 41 гена, включая гены репликации, до 4 субъединиц РНК-полимеразы, по крайней мере 3 фактора транскрипции, ферменты кэпа и полиаденилирования, аппарат упаковки вирусной ДНК и структурные компоненты икосаэдрового капсида и вирусной мембраны.
См. также
Примечания
- Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
- Iyer, LM.; Aravind, L.; Koonin, EV. Common origin of four diverse families of large eukaryotic DNA viruses (англ.) // J Virol : journal. — 2001. — December (vol. 75, no. 23). — P. 11720—11734. — doi:10.1128/JVI.75.23.11720-11734.2001. — PMID 11689653.
Литература
- Koonin EV, Yutin N.: Origin and evolution of eukaryotic large nucleo-cytoplasmic DNA viruses. Intervirology. 2010;53(5):284-92. PMID 20551680
- Yutin N, Koonin EV.: Hidden evolutionary complexity of Nucleo-Cytoplasmic Large DNA viruses of eukaryotes. Virol J. 2012 Aug 14;9:161. PMID 22891861
- Yutin N, Colson P, Raoult D, Koonin EV.: Mimiviridae: clusters of orthologous genes, reconstruction of gene repertoire evolution and proposed expansion of the giant virus family. Virol J. 2013 Apr 4;10:106. PMID 23557328
- Yutin N, Wolf YI, Raoult D, Koonin EV.: Eukaryotic large nucleo-cytoplasmic DNA viruses: clusters of orthologous genes and reconstruction of viral genome evolution. Virol J. 2009 Dec 17;6:223. PMID 20017929
- Lakshminarayan M. Iyer, L. Aravind, and Eugene V. Koonin: Common Origin of Four Diverse Families of Large Eukaryotic DNA Viruses. J Virol. 2001 December; 75(23): 11720–11734. PMID 11689653