RasMol

RasMol — компьютерная программа, предназначенная для визуализации молекул и используемая преимущественно для изучения и получения изображений пространственных структур биологических макромолекул, в первую очередь белков и нуклеиновых кислот. Первая версия программы RasMol была создана Роджером Сэйлом в начале 90-х годов.

RasMol
Тип Биоинформатика
Разработчик Herbert J. Bernstein
Написана на C
Операционная система Microsoft Windows, Linux, Apple Macintosh
Языки интерфейса Английский, Русский
Первый выпуск 1992
Последняя версия 2.7.5 (3 June 2009 (rev. 23 July 2009))
Читаемые форматы файлов Protein Data Bank
Лицензия GNU General Public License
Сайт rasmol.org
 Медиафайлы на Викискладе
Отображение в RasMol тримера белка TRAF2. Код PDB 1DOA

Начиная с версий серии 2.7, RasMol распространяется по двойной лицензии (GPL или RASLIC). Тем самым, RasMol (наряду с Jmol и PyMOL) — одна из немногих программ визуализации молекул с открытым кодом.

Исходными данными для визуализации служат координаты атомов молекулы (или комплекса молекул), содержащиеся в файле формата Protein Data Bank (PDB). Файлы с координатами атомов могут быть скопированы с одного из сайтов PDB (см. Worldwide Protein Data Bank).

RasMol продолжает активно использоваться молекулярными биологами и биоинформатиками. Благодаря простой и логичной структуре пользовательского интерфейса, программа проста для освоения. Система команд, разработанная для программы ("язык" RasMol'а) используется в других программах, например, в Jmol. Последняя постепенно вытесняет RasMol, поскольку почти столь же проста в освоении, охватывает всю функциональность RasMol и обладает некоторыми дополнительными возможностями.

Ссылки

Официальный сайт


This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.