Укладка Россмана

Укладка Россманна — структурный мотив в третичной структуре белка, который связывает нуклеотиды (в частности, кофактор НАД).[1] Структура, состоящая из двух идентичных частей, содержит шесть почти параллельных β-листов, соединённых между собой двумя парами α-спиралей, следующих в порядке β-α-β-α-β. Поскольку каждая укладка Россманна может связать один нуклеотид, связывающий домен для динуклеотидов, таких как НАД, состоит из двух параллельных укладок Россманна. Одиночная укладка Россманна может связать мононуклеотид, например, кофактор ФМН.

Пример укладки Россмана, домен белка декарбоксилазы бактерии Staphylococcus epidermidis (PDB ID 1G5Q) со связанным кофактором ФМН

Мотив назван по имени Майкла Россмана, который первым обнаружил и описал эту структуру как часто встречающуюся в нуклеотид-связывающих белках, таких, как дегидрогеназы[2].

В 1989 году Исраэль Ханукоглу из Института Вейцмана обнаружил, что нуклеотидная последовательность для НАДФ-связывающих структур в некоторых белках отличается от мотивов, связывающих НАД[3]. Это открытие было использовано для реинжиниринга кофакторной избирательности ферментов[4].

Примечания

  1. Hanukoglu I. Proteopedia: Rossmann fold: A beta-alpha-beta fold at dinucleotide binding sites (англ.) // Biochem Mol Biol Educ : journal. — 2015. Vol. 43, no. 3. P. 206—209. doi:10.1002/bmb.20849. PMID 25704928.
  2. Rao S., Rossmann M. Comparison of super-secondary structures in proteins (англ.) // J Mol Biol : journal. — 1973. Vol. 76, no. 2. P. 241—256. doi:10.1016/0022-2836(73)90388-4. PMID 4737475.
  3. Hanukoglu I., Gutfinger T. cDNA sequence of adrenodoxin reductase. Identification of NADP-binding sites in oxidoreductases. (англ.) // European journal of biochemistry / FEBS. — 1989. — Vol. 180, no. 2. — P. 479—484. PMID 2924777.
  4. Scrutton N.S., Berry A., Perham R.N. Redesign of the coenzyme specificity of a dehydrogenase by protein engineering. (англ.) // Nature : journal. — 1990. — January (vol. 343, no. 6253). P. 38—43. doi:10.1038/343038a0. PMID 2296288.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.