Манхэттенский график

Манхэттенский график (англ. Manhattan plot) — тип точечной диаграммы, на которой обычно изображается множество значений, большинство из которых близки к нулю. Часто используется в полногеномных поисках ассоциаций (GWAS).[1] При обработке результатов GWAS на оси X отмечаются геномные координаты. На оси Y отмечается значение, противоположенное десятичному логарифму P-значения для каждого однонуклеотидного полиморфизма. Так как полифорфизмы, которые имеют наибольшую ассоциацию с изучаемым признаком, имеют наименьшее P-значение, то их значение на графике будет иметь максимальное значение.

Пример манхэттенского графика при проведении GWAS

График получил свое название из-за сходства с панорамой Манхэттена с высокими небоскребами, возвышающимися над массой более низких зданий.

Примечания
  1. Eric Reed, Sara Nunez, David Kulp, Jing Qian, Muredach P. Reilly. A guide to genome-wide association analysis and post-analytic interrogation // Statistics in Medicine. — 2015-12-10. — Т. 34, вып. 28. — С. 3769–3792. — ISSN 1097-0258. — doi:10.1002/sim.6605.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.